Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 DUTP7-201ENST00000507982 486 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
SP140Q13342 AC018861.2-201ENST00000518078 513 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
SP140Q13342 AC008250.1-201ENST00000539874 522 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
SP140Q13342 AC012555.2-201ENST00000549448 413 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
SP140Q13342 AC110023.1-201ENST00000554318 457 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
SP140Q13342 IGBP1P1-201ENST00000554337 1009 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
SP140Q13342 HSPE1P2-201ENST00000554777 306 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
SP140Q13342 AL133485.1-201ENST00000555966 392 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
SP140Q13342 LINC02131-201ENST00000563289 419 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
SP140Q13342 DPPA2P4-201ENST00000563717 878 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
SP140Q13342 AC139099.3-202ENST00000574856 439 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
SP140Q13342 RNA5SP439-201ENST00000617595 124 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
SP140Q13342 AC145207.9-201ENST00000623802 325 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
SP140Q13342 AP003497.2-201ENST00000624220 967 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
SP140Q13342 OR52B4-201ENST00000624801 1124 ntAPPRIS P1 BASIC5.52□□□□□ -1.53
SP140Q13342 SATB1-AS1-269ENST00000630766 591 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
SP140Q13342 ZNF253-203ENST00000589717 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
SP140Q13342 CDH18-210ENST00000511273 2318 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
SP140Q13342 AL137100.1-201ENST00000556703 1620 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
SP140Q13342 INO80D-201ENST00000403263 14136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
SP140Q13342 SLC4A7-206ENST00000428386 7385 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
SP140Q13342 KIAA0391-209ENST00000604948 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
SP140Q13342 PPP2R5C-226ENST00000557095 1307 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
SP140Q13342 RYR3-209ENST00000634418 15078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
SP140Q13342 AC011933.2-201ENST00000578539 2790 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
SP140Q13342 KCNH5-201ENST00000322893 11290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
SP140Q13342 ADGB-205ENST00000397944 5325 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
SP140Q13342 AC106872.5-201ENST00000508856 1416 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
SP140Q13342 CLEC1A-204ENST00000457018 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
SP140Q13342 AP000776.1-201ENST00000530032 1663 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
SP140Q13342 AL022393.1-201ENST00000625142 1677 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
SP140Q13342 CLDN12-203ENST00000394605 3488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
SP140Q13342 DEFB118-201ENST00000253381 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
SP140Q13342 IL1RAPL2-201ENST00000344799 1290 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
SP140Q13342 Y_RNA.77-201ENST00000362962 107 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
SP140Q13342 MLIP-203ENST00000370877 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
SP140Q13342 KRTAP27-1-201ENST00000382835 682 ntAPPRIS P1 BASIC5.51□□□□□ -1.53
SP140Q13342 MIR320B1-201ENST00000390209 79 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
SP140Q13342 AL590867.1-201ENST00000392385 1212 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
SP140Q13342 TAF9BP1-201ENST00000396646 746 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
SP140Q13342 MOB4-205ENST00000409916 829 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
SP140Q13342 AC096921.1-201ENST00000411661 375 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
SP140Q13342 AL162430.2-201ENST00000422306 435 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
SP140Q13342 AL353801.1-201ENST00000425541 425 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
SP140Q13342 LINC01445-201ENST00000426205 812 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
SP140Q13342 BX276092.6-201ENST00000430476 250 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
SP140Q13342 AL590999.1-204ENST00000430595 638 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
SP140Q13342 FAM96AP1-201ENST00000430879 482 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
SP140Q13342 HMGB3P24-201ENST00000433260 622 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
SP140Q13342 ATP5F1P1-201ENST00000433775 569 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
SP140Q13342 GUSBP6-201ENST00000434932 640 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
SP140Q13342 AC099670.2-201ENST00000435130 321 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
SP140Q13342 DIAPH3-AS1-203ENST00000435636 467 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
SP140Q13342 GTF2IP7-202ENST00000436677 309 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
SP140Q13342 AC017074.2-201ENST00000439382 607 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
SP140Q13342 AL591503.2-201ENST00000442314 1005 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
SP140Q13342 HMGN1P2-201ENST00000445197 310 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
SP140Q13342 RPS23P9-201ENST00000448848 438 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
SP140Q13342 AL445665.1-202ENST00000452436 324 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
SP140Q13342 MTCO3P16-201ENST00000454456 754 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
SP140Q13342 BX276092.8-201ENST00000455722 250 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
SP140Q13342 RPS23P6-201ENST00000466136 431 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
SP140Q13342 GUCA1C-203ENST00000471108 633 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
SP140Q13342 OARD1-211ENST00000480585 829 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
SP140Q13342 AC008592.2-201ENST00000506070 571 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
SP140Q13342 VCAN-AS1-201ENST00000512090 424 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
SP140Q13342 MTRNR2L5-201ENST00000512524 739 ntAPPRIS P1 BASIC5.51□□□□□ -1.53
SP140Q13342 AC104233.2-201ENST00000518922 414 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
SP140Q13342 AP002428.1-201ENST00000527345 380 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
SP140Q13342 TEX12-202ENST00000530752 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
SP140Q13342 SDHAF2-205ENST00000537782 559 ntTSL 4 BASIC5.51□□□□□ -1.53
SP140Q13342 AC122688.1-201ENST00000541494 223 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
SP140Q13342 AP000763.3-201ENST00000542598 334 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
SP140Q13342 NANOGNBP2-201ENST00000544753 553 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
SP140Q13342 AC090109.1-201ENST00000548885 819 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
SP140Q13342 AC079950.1-201ENST00000551229 568 ntTSL 4 BASIC5.51□□□□□ -1.53
SP140Q13342 AC018552.1-201ENST00000562099 811 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
SP140Q13342 AC079171.1-201ENST00000568788 914 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
SP140Q13342 H3F3BP2-201ENST00000583907 357 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
SP140Q13342 CLPTM1LP1-201ENST00000604519 484 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
SP140Q13342 AC096553.1-201ENST00000605169 829 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
SP140Q13342 AL391425.1-202ENST00000617518 774 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
SP140Q13342 AC245452.5-201ENST00000620649 780 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
SP140Q13342 AC138965.3-201ENST00000623875 498 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
SP140Q13342 MIR4278-201ENST00000636094 69 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
SP140Q13342 MTCO1P6-201ENST00000481192 1384 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
SP140Q13342 YWHAZ-219ENST00000522542 1394 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
SP140Q13342 CTAGE5-219ENST00000640607 4239 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
SP140Q13342 PWAR1-201ENST00000624188 2414 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SP140Q13342 ECM1P2-201ENST00000503354 1577 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SP140Q13342 BACH1-202ENST00000399921 5769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
SP140Q13342 DLG1-213ENST00000443183 2516 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SP140Q13342 LINC01553-203ENST00000521074 4329 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
SP140Q13342 KYAT3-203ENST00000370491 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SP140Q13342 OR13C1P-202ENST00000641378 2919 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SP140Q13342 CDON-206ENST00000531738 5803 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
SP140Q13342 IFIT1B-201ENST00000371809 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
SP140Q13342 FABP4-201ENST00000256104 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
SP140Q13342 KLRC4-201ENST00000309384 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
SP140Q13342 OR1L1-201ENST00000309623 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.5 ms