Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 PRPF38AP1-201ENST00000451976 933 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 AC017101.1-201ENST00000453665 571 ntTSL 4 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 RN7SL738P-201ENST00000470264 297 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 AC006463.2-201ENST00000473326 348 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 LINC01206-203ENST00000476815 482 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 AC011005.3-201ENST00000491624 395 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 CASP12-210ENST00000494737 961 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 LINC00903-201ENST00000497854 223 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 MGST2-204ENST00000506797 634 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 FABP5P6-201ENST00000510588 409 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 AC091180.4-201ENST00000511322 245 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 ENPP7P9-201ENST00000514456 627 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 Y_RNA.719-201ENST00000517156 106 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 AC022915.1-201ENST00000521660 289 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 AF117829.1-209ENST00000523995 767 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 OR4V1P-201ENST00000525394 1140 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 AP001267.3-202ENST00000525992 448 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 AC073172.2-201ENST00000527770 571 ntTSL 4 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 AC007527.1-202ENST00000543347 382 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 AL929601.2-201ENST00000549951 381 ntTSL 4 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 LINC02444-201ENST00000550723 1256 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 AL132712.2-201ENST00000556653 127 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 MIR4330-201ENST00000579077 105 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 ADAD1P2-201ENST00000588476 646 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 OR4H6P-202ENST00000603819 340 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 AC005972.3-201ENST00000606304 481 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 AL136370.1-201ENST00000608166 691 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 FAM27B-201ENST00000610601 213 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 AC010435.1-201ENST00000623353 1177 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 AC103798.2-201ENST00000624292 632 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 AC119674.1-212ENST00000641155 993 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 EOGT-209ENST00000540955 1332 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 RACGAP1-202ENST00000427314 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 CAV1-205ENST00000405348 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 NCLP2-201ENST00000416078 1462 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 AC024341.1-201ENST00000526444 1552 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 ZNF334-203ENST00000593880 2635 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 AC007382.1-201ENST00000624376 2618 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 AC011287.1-206ENST00000638774 2642 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 AC006994.2-202ENST00000639259 3828 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 LINC01541-202ENST00000568095 3105 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 OBSCN-210ENST00000570156 26925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 ARHGEF12-202ENST00000397843 9660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 HMCN1-201ENST00000271588 18208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 ELF1-204ENST00000625359 2032 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 LINC01933-204ENST00000524295 3591 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 MTFR1-203ENST00000458689 2500 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 ADNP-201ENST00000349014 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 ZNF468-203ENST00000595646 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 DNAJB4-201ENST00000370763 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 FABP4-201ENST00000256104 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 R3HCC1L-204ENST00000370586 941 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 NRG4-201ENST00000394907 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 SPINK13-201ENST00000398450 509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 RN7SKP100-201ENST00000411258 284 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 AC099566.1-204ENST00000413825 943 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 QRSL1P2-201ENST00000418582 964 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 AC004074.1-201ENST00000421810 1063 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 AC073069.1-201ENST00000428657 441 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 MTND4LP14-201ENST00000429447 288 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 AC073052.1-201ENST00000440417 714 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 AL138878.2-201ENST00000440581 1241 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 AC122136.1-201ENST00000443971 478 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 CYCSP24-201ENST00000445119 316 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 AL355870.1-201ENST00000448272 454 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 RPS5P7-201ENST00000456664 608 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 EIF2S2P4-201ENST00000461070 984 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 RPL5P30-201ENST00000465511 891 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 EDNRA-204ENST00000506066 1032 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 AC104257.1-202ENST00000524275 884 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 AC079089.1-204ENST00000530194 572 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 ETFRF1-202ENST00000553788 708 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 DNAL1-205ENST00000554339 548 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 AC007599.2-201ENST00000573040 493 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 SNORA74C-1-201ENST00000580726 201 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 AC010424.2-201ENST00000607594 443 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 AL022238.2-202ENST00000607915 658 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 PLCE1-AS2-211ENST00000613585 542 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 AC009318.3-201ENST00000616916 503 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 RPL23AP61-201ENST00000623642 466 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 AC244517.5-203ENST00000624778 517 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 ATL2-217ENST00000629272 1242 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 AF067845.5-201ENST00000633906 437 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 AC107398.4-201ENST00000635489 765 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 C1orf112-202ENST00000359326 4002 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 UGT2B7-201ENST00000305231 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 AC092329.3-201ENST00000611392 1904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 ADAMDEC1-204ENST00000522298 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 Z73965.1-201ENST00000623412 2297 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 ASTE1-208ENST00000514044 2504 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 ZFPM2-203ENST00000517361 3300 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 HGF-201ENST00000222390 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 CMYA5-201ENST00000446378 12847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 MAPK10-236ENST00000638313 3971 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 KIAA1456-203ENST00000524591 9587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 STXBP4-202ENST00000398391 2160 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 AC008758.3-201ENST00000507003 1829 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 GPR18-202ENST00000397470 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 SLMAP-206ENST00000428312 4132 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 ORC4-202ENST00000392857 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
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