Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 U3.15-201ENST00000365398 212 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 CFAP126-201ENST00000367974 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 TRAV36DV7-201ENST00000390463 356 ntAPPRIS P1 BASIC4.79□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 AC136624.1-201ENST00000400791 413 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 Z97832.1-201ENST00000402490 328 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 AL136116.2-201ENST00000404020 785 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 AC009468.1-201ENST00000412800 437 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 AC004552.1-201ENST00000419089 348 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 Z74021.1-201ENST00000423610 407 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 AL603840.1-203ENST00000424357 645 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 AL158835.2-201ENST00000430970 300 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 RPL7P33-201ENST00000444159 742 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 NDUFA5P8-201ENST00000449019 346 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 AL359715.2-201ENST00000452402 682 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 AP000472.1-201ENST00000452500 530 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
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IFT88Q13099 RPS26P3-201ENST00000470205 348 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 RPL23AP2-201ENST00000471227 466 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 COPS8P2-201ENST00000473228 627 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 AC105918.1-201ENST00000474399 838 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 AC079841.1-201ENST00000481228 950 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 AC090543.2-201ENST00000483963 348 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 AC004057.1-201ENST00000485827 348 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
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IFT88Q13099 AC092546.1-202ENST00000505628 499 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 MRPL36-203ENST00000505818 595 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
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IFT88Q13099 HDAC2-AS2-207ENST00000518470 563 ntTSL 4 BASIC4.79□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 BMPR1APS2-201ENST00000527904 1012 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 OR7E128P-201ENST00000532736 1024 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 C1GALT1P1-201ENST00000548895 1089 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 C16orf52-205ENST00000567004 951 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
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IFT88Q13099 AC011447.4-201ENST00000587562 111 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
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IFT88Q13099 IL13RA2-201ENST00000243213 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
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IFT88Q13099 ADGRL2-201ENST00000319517 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 ZNF639-210ENST00000621687 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 ENPP3-202ENST00000358229 3026 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 OR56B2P-201ENST00000317102 954 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 MIR93-201ENST00000385024 80 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 AL645465.1-201ENST00000417765 642 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 DYNLL1P7-201ENST00000429273 258 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
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IFT88Q13099 AC093716.1-201ENST00000435923 377 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 AL096678.1-201ENST00000438877 472 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 AC004824.1-201ENST00000439577 311 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 KRTAP8-2P-201ENST00000440620 186 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 FAM237A-201ENST00000441223 773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 AC104651.2-201ENST00000447549 528 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 AC108022.1-201ENST00000493466 478 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 LINC00632-202ENST00000498732 746 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
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