Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 RNA5SP90-201ENST00000364801 99 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
GPS1Q13098 SPANXN1-201ENST00000370493 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
GPS1Q13098 BPHL-201ENST00000380368 797 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
GPS1Q13098 AL136310.1-201ENST00000404926 654 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
GPS1Q13098 AC007738.1-201ENST00000413892 348 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
GPS1Q13098 SDHDP6-201ENST00000414693 480 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
GPS1Q13098 AC092687.1-201ENST00000418835 389 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
GPS1Q13098 AL121872.1-201ENST00000420327 281 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
GPS1Q13098 GTF2IP2-201ENST00000424290 697 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
GPS1Q13098 MTND6P12-201ENST00000428247 522 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
GPS1Q13098 AC009238.2-201ENST00000431026 355 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
GPS1Q13098 AL161457.1-201ENST00000434656 905 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
GPS1Q13098 Z82198.2-201ENST00000434741 567 ntTSL 4 BASIC5.32□□□□□ -1.56
GPS1Q13098 RPL23AP19-201ENST00000436229 369 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
GPS1Q13098 EEF1A1P39-201ENST00000440791 250 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
GPS1Q13098 RPS11P7-201ENST00000442125 465 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
GPS1Q13098 HMGB3P6-201ENST00000444896 598 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
GPS1Q13098 HMGN1P36-201ENST00000446623 298 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
GPS1Q13098 RPL31P15-201ENST00000449770 338 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
GPS1Q13098 AL021393.1-201ENST00000456740 539 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
GPS1Q13098 RPL35AP19-201ENST00000469425 329 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
GPS1Q13098 LINC00903-201ENST00000497854 223 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
GPS1Q13098 AC106821.1-201ENST00000502861 572 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
GPS1Q13098 AC093534.1-201ENST00000504977 132 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
GPS1Q13098 AC008592.2-201ENST00000506070 571 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
GPS1Q13098 AC084871.1-201ENST00000508020 628 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
GPS1Q13098 AC104108.1-201ENST00000509930 412 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
GPS1Q13098 LINC01365-202ENST00000512219 637 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
GPS1Q13098 IGKV2D-10-201ENST00000520194 281 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
GPS1Q13098 MTATP6P15-201ENST00000527233 835 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
GPS1Q13098 AP003969.1-201ENST00000531846 400 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
GPS1Q13098 AP002812.4-201ENST00000532139 286 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
GPS1Q13098 AC125612.1-201ENST00000547580 377 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
GPS1Q13098 AC090503.2-201ENST00000551135 981 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
GPS1Q13098 LSM3P2-201ENST00000551246 273 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
GPS1Q13098 MTND4P33-201ENST00000556706 766 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
GPS1Q13098 AC138907.2-201ENST00000561479 866 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
GPS1Q13098 AC145350.4-201ENST00000562827 866 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
GPS1Q13098 AC133485.5-201ENST00000563407 866 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
GPS1Q13098 AC009097.3-201ENST00000563557 1018 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
GPS1Q13098 RPL10P14-201ENST00000565265 298 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
GPS1Q13098 PDCD6IPP2-207ENST00000566321 1069 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
GPS1Q13098 MTCO1P40-201ENST00000574371 625 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
GPS1Q13098 AC005757.1-201ENST00000591432 472 ntTSL 4 BASIC5.32□□□□□ -1.56
GPS1Q13098 ZNF92P3-201ENST00000596594 954 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
GPS1Q13098 AC092316.1-201ENST00000598703 297 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
GPS1Q13098 AC018695.5-201ENST00000605872 315 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
GPS1Q13098 AL138478.1-201ENST00000612252 832 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
GPS1Q13098 AC231759.1-201ENST00000616455 597 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
GPS1Q13098 BX005214.3-202ENST00000619809 325 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
GPS1Q13098 HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 337 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
GPS1Q13098 AC013470.4-201ENST00000619978 986 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
GPS1Q13098 AP003497.2-201ENST00000624220 967 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
GPS1Q13098 SATB1-AS1-266ENST00000630271 813 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
GPS1Q13098 AJ009632.2-207ENST00000634659 527 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
GPS1Q13098 RAD17-220ENST00000616683 3057 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
GPS1Q13098 TBC1D23-201ENST00000344949 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
GPS1Q13098 AC092747.4-201ENST00000620519 1861 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
GPS1Q13098 SAMD12-202ENST00000409003 8866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
GPS1Q13098 AC008079.2-201ENST00000623543 20396 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
GPS1Q13098 PIK3C3-217ENST00000639914 2722 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
GPS1Q13098 LINC00862-204ENST00000637098 1400 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
GPS1Q13098 C2CD6-202ENST00000439140 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
GPS1Q13098 ALB-209ENST00000503124 1741 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
GPS1Q13098 SMG1P4-204ENST00000523028 4131 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
GPS1Q13098 TCP11X1-202ENST00000622971 1372 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
GPS1Q13098 PRG4-206ENST00000635041 4915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
GPS1Q13098 AL137100.1-201ENST00000556703 1620 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
GPS1Q13098 DLC1-209ENST00000511869 2451 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
GPS1Q13098 MCF2L2-202ENST00000414362 3031 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
GPS1Q13098 RNU1-87P-201ENST00000363727 170 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
GPS1Q13098 DEFB136-201ENST00000382209 237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
GPS1Q13098 FAIM-204ENST00000393035 946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
GPS1Q13098 MTND4P13-201ENST00000402078 1023 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
GPS1Q13098 U3.32-201ENST00000408116 212 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
GPS1Q13098 AC092745.2-202ENST00000411880 369 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
GPS1Q13098 CTSL3P-202ENST00000412179 788 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
GPS1Q13098 RPS24P7-201ENST00000416921 246 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
GPS1Q13098 TMEM196-203ENST00000422233 775 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
GPS1Q13098 HIGD1AP12-201ENST00000427832 281 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
GPS1Q13098 AL049749.1-201ENST00000430281 632 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
GPS1Q13098 CDY14P-201ENST00000431260 1014 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
GPS1Q13098 AL389925.1-201ENST00000432257 728 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
GPS1Q13098 AC084290.1-201ENST00000434995 374 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
GPS1Q13098 AP000936.3-201ENST00000438127 255 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
GPS1Q13098 CDY12P-201ENST00000440679 1015 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
GPS1Q13098 AC002542.1-201ENST00000440683 193 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
GPS1Q13098 RNF219-AS1-202ENST00000444769 590 ntTSL 4 BASIC5.31□□□□□ -1.56
GPS1Q13098 CDY13P-201ENST00000445813 1015 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
GPS1Q13098 MTATP6P26-201ENST00000445926 662 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
GPS1Q13098 CASP3P1-201ENST00000446037 609 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
GPS1Q13098 AC012512.1-201ENST00000446594 718 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
GPS1Q13098 RNF148-202ENST00000447240 839 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
GPS1Q13098 CDY23P-201ENST00000451661 1014 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
GPS1Q13098 YWHAEP1-201ENST00000453697 763 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
GPS1Q13098 AC093157.1-204ENST00000454721 753 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
GPS1Q13098 AC100832.1-201ENST00000471945 383 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
GPS1Q13098 RABGAP1L-214ENST00000478442 648 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
GPS1Q13098 RPL7AP10-201ENST00000481016 791 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
GPS1Q13098 LINC02027-201ENST00000482617 596 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
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