Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 FBLN5-205ENST00000556154 1875 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 TOGARAM2-201ENST00000379558 12691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 OPALIN-203ENST00000393871 3545 ntTSL 2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 LINC01630-208ENST00000635680 4363 ntTSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 UVRAG-205ENST00000528420 2463 ntTSL 2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 DCAF4L2-201ENST00000319675 3326 ntAPPRIS P1 BASIC8.72□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 MAGT1-205ENST00000618282 2788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 AL353052.2-201ENST00000441459 2241 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 AL590065.1-201ENST00000603371 4774 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 AC138207.6-201ENST00000579164 1967 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 JAZF1-201ENST00000283928 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 AC090643.1-201ENST00000623600 3100 ntBASIC8.71□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 TRIM49D1-203ENST00000605881 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 LRRC31-204ENST00000523069 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 ZNF268-213ENST00000542986 3773 ntTSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 UBQLNL-201ENST00000380184 2313 ntAPPRIS P1 BASIC8.71□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 OR3A3-203ENST00000641141 3800 ntAPPRIS P1 BASIC8.71□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 AOAH-210ENST00000617267 2398 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 USP16-204ENST00000399976 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 ZNF611-204ENST00000543227 4517 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC8.71□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 TMEM217-201ENST00000336655 1546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.71□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 CD46-205ENST00000358170 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 ZNF761-202ENST00000432094 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 TCN1-201ENST00000257264 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 ANXA1-202ENST00000376911 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 Y_RNA.14-201ENST00000362415 103 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 Y_RNA.152-201ENST00000363578 100 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 RNU12-2P-201ENST00000364789 156 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 WFDC6-202ENST00000372670 620 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 MT-TW-201ENST00000387382 68 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 RNU1-149P-201ENST00000390870 161 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 AL034374.1-201ENST00000406329 351 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 RNU2-36P-201ENST00000410361 191 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 AL691515.2-201ENST00000414765 466 ntTSL 3 BASIC8.71□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 ARL5AP1-201ENST00000418991 388 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 MYCBP2-AS1-201ENST00000422231 519 ntTSL 3 BASIC8.71□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 LINC01384-201ENST00000422494 659 ntTSL 3 BASIC8.71□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 AL591178.1-201ENST00000439239 454 ntTSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 AC093579.1-201ENST00000439455 352 ntTSL 2 BASIC8.71□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 AC123904.1-201ENST00000441072 368 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 SRP68P2-201ENST00000456184 254 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 AP1S2P1-201ENST00000457344 379 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 AC015724.1-201ENST00000478577 156 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 RPL7P43-201ENST00000478876 753 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 AC009567.2-201ENST00000502989 349 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 GAPDHP61-201ENST00000507324 1005 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 PSD2-AS1-201ENST00000515306 412 ntTSL 3 BASIC8.71□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 RNA5SP473-201ENST00000516402 125 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 RNU6-1038P-201ENST00000516516 104 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 RNU6-699P-201ENST00000517081 110 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 LINC01484-201ENST00000517733 555 ntTSL 4 BASIC8.71□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 AC131281.1-201ENST00000522984 164 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 AP006259.1-201ENST00000528520 561 ntTSL 2 BASIC8.71□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 MYL6-211ENST00000548580 528 ntTSL 2 BASIC8.71□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 BICD1-206ENST00000551086 423 ntTSL 3 BASIC8.71□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 AC103739.1-201ENST00000558389 474 ntTSL 3 BASIC8.71□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 AC005670.2-201ENST00000571841 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 MIR5186-201ENST00000577504 120 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 MIR548Y-201ENST00000582739 110 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 AC010271.1-201ENST00000599050 558 ntTSL 4 BASIC8.71□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 EIF3FP1-201ENST00000613970 806 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 CR381572.1-201ENST00000625098 102 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 LAMTOR5-AS1-248ENST00000630488 703 ntTSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 SLC8A1-AS1-239ENST00000631142 623 ntTSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 AC091812.1-201ENST00000432235 1948 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 ADGRE1-201ENST00000250572 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 WBP2NL-201ENST00000328823 2255 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 AADACL3-201ENST00000359318 3662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.71□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 ZFP62-207ENST00000512132 4010 ntTSL 2 BASIC8.71□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 FOPNL-206ENST00000573968 2039 ntTSL 2 BASIC8.71□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 CD86-202ENST00000330540 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 NXF2B-205ENST00000618881 3193 ntTSL 2 BASIC8.71□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 PLCZ1-201ENST00000266505 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 ESRRG-221ENST00000493603 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 HHIP-201ENST00000296575 10072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 FLG-AS1-202ENST00000392688 2995 ntTSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 CSTF2T-201ENST00000331173 4105 ntAPPRIS P1 BASIC8.7□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 GALK2-201ENST00000327171 5299 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 SNX16-202ENST00000353788 3032 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 NFAT5-208ENST00000566899 4914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 AC110716.2-201ENST00000563865 3945 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 AC107983.2-201ENST00000425211 4735 ntTSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 NRG3-208ENST00000556918 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 SOX5-202ENST00000381381 3991 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 VCAM1-204ENST00000370119 2483 ntTSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 PRICKLE2-AS3-201ENST00000473434 2496 ntTSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 SLC39A12-204ENST00000539911 2461 ntTSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 ZNF24-204ENST00000589881 7419 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 LINC01358-211ENST00000635571 1687 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 OSGIN2-201ENST00000297438 4209 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 Y_RNA.210-201ENST00000364161 110 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 RNA5SP238-201ENST00000365464 120 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 SNORA70.5-201ENST00000365519 135 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 RNU1-56P-201ENST00000391303 164 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 COX6A1P3-201ENST00000404167 293 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 NDUFS5P1-201ENST00000405668 289 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 MTERF4-205ENST00000407095 799 ntTSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 LINC00308-201ENST00000419431 727 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 AC048351.1-201ENST00000420064 602 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 LINC00502-201ENST00000423621 445 ntTSL 3 BASIC8.7□□□□□ -1.02
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