Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 AC118754.1-201ENST00000416958 370 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
MCCD1P59942 MTCO2P5-201ENST00000422621 426 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
MCCD1P59942 AL358394.1-201ENST00000422807 535 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
MCCD1P59942 NPIPB5-205ENST00000424340 3801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
MCCD1P59942 AL157786.1-206ENST00000424422 551 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
MCCD1P59942 RPL35AP12-201ENST00000425362 338 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
MCCD1P59942 TRBV29OR9-2-201ENST00000427589 333 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
MCCD1P59942 MAP3K13-207ENST00000438798 388 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
MCCD1P59942 RPL7P12-201ENST00000446719 750 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
MCCD1P59942 AL365318.1-201ENST00000453128 705 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
MCCD1P59942 AC090142.1-201ENST00000465776 462 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
MCCD1P59942 RN7SL655P-201ENST00000486087 298 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
MCCD1P59942 AC093278.1-201ENST00000494700 600 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
MCCD1P59942 AC108752.1-203ENST00000496674 339 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
MCCD1P59942 AC139783.2-201ENST00000504847 1145 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
MCCD1P59942 TPM3P3-201ENST00000521343 354 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
MCCD1P59942 TBCA-209ENST00000522370 435 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
MCCD1P59942 AP003080.1-202ENST00000526526 915 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
MCCD1P59942 RGS5-219ENST00000528019 512 ntTSL 4 BASIC7.23□□□□□ -1.25
MCCD1P59942 OR7G1-201ENST00000541538 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
MCCD1P59942 AL390718.1-201ENST00000566904 506 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
MCCD1P59942 DARS-AS1-217ENST00000599279 544 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
MCCD1P59942 AC247036.1-201ENST00000605005 389 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
MCCD1P59942 AC005392.3-201ENST00000607109 459 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
MCCD1P59942 TP53TG1_2.1-201ENST00000611226 182 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
MCCD1P59942 HOXA11-AS1_3.1-201ENST00000613383 98 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
MCCD1P59942 AC005858.1-201ENST00000620193 677 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
MCCD1P59942 LINC00836-201ENST00000625325 582 ntTSL 4 BASIC7.23□□□□□ -1.25
MCCD1P59942 CYP2C8-213ENST00000628935 924 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
MCCD1P59942 ASB8-218ENST00000629941 278 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
MCCD1P59942 TRMT13-202ENST00000370141 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
MCCD1P59942 AC011604.2-201ENST00000381541 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
MCCD1P59942 ALB-219ENST00000621085 1418 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
MCCD1P59942 MSR1-202ENST00000350896 3572 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
MCCD1P59942 TENM4-201ENST00000278550 14000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
MCCD1P59942 ANK2-203ENST00000394537 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
MCCD1P59942 GOLGA6L6-201ENST00000619213 4013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
MCCD1P59942 MEPE-203ENST00000424957 2022 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
MCCD1P59942 ACADM-203ENST00000420607 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
MCCD1P59942 MTERF1-202ENST00000406735 1639 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
MCCD1P59942 SYTL2-220ENST00000529581 1910 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
MCCD1P59942 MGAM-208ENST00000549489 6525 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
MCCD1P59942 ZNF480-204ENST00000490272 2238 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
MCCD1P59942 GRAMD1B-207ENST00000529750 7723 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
MCCD1P59942 TOX3-202ENST00000407228 3124 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
MCCD1P59942 AC096582.3-201ENST00000636578 3716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
MCCD1P59942 SLC25A40-201ENST00000341119 4045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
MCCD1P59942 AC006058.1-201ENST00000568686 5067 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
MCCD1P59942 PDGFRA-201ENST00000257290 6576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
MCCD1P59942 AQP4-201ENST00000383168 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
MCCD1P59942 TRRAP-202ENST00000359863 12677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
MCCD1P59942 OR2T2-203ENST00000642130 3331 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
MCCD1P59942 FAM240A-201ENST00000444264 1826 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
MCCD1P59942 ZNF33BP1-201ENST00000452497 1834 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
MCCD1P59942 FAM240A-202ENST00000640551 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
MCCD1P59942 AC025574.1-201ENST00000554784 1653 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
MCCD1P59942 IL1RAP-212ENST00000443369 2760 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
MCCD1P59942 PKIA-AS1-202ENST00000522302 2011 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
MCCD1P59942 ADAL-201ENST00000389651 1559 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
MCCD1P59942 SORBS1-205ENST00000371227 7279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
MCCD1P59942 Y_RNA.159-201ENST00000363674 87 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
MCCD1P59942 FDPSP5-201ENST00000399474 1057 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
MCCD1P59942 CEACAM7-202ENST00000401731 1236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
MCCD1P59942 RPS20P2-201ENST00000402520 389 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
MCCD1P59942 TANK-204ENST00000403609 555 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
MCCD1P59942 RN7SKP188-201ENST00000410789 317 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
MCCD1P59942 FAM230B-202ENST00000415704 396 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
MCCD1P59942 AC000089.1-201ENST00000424559 801 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
MCCD1P59942 LINC00352-201ENST00000425800 552 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
MCCD1P59942 AC114752.1-201ENST00000448204 289 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
MCCD1P59942 RPS23P9-201ENST00000448848 438 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
MCCD1P59942 AC009244.1-201ENST00000450566 258 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
MCCD1P59942 AC073594.1-201ENST00000462065 364 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
MCCD1P59942 PEX5L-AS2-201ENST00000462801 630 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
MCCD1P59942 RPL23AP71-201ENST00000470966 469 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
MCCD1P59942 AC008629.1-202ENST00000504820 525 ntTSL 4 BASIC7.22□□□□□ -1.25
MCCD1P59942 AC034159.1-201ENST00000513885 583 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
MCCD1P59942 AC126768.3-201ENST00000514519 560 ntTSL 4 BASIC7.22□□□□□ -1.25
MCCD1P59942 RN7SKP196-201ENST00000516267 345 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
MCCD1P59942 LY96-202ENST00000518893 430 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
MCCD1P59942 AC011586.1-201ENST00000521055 458 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
MCCD1P59942 AP002954.1-201ENST00000526274 425 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
MCCD1P59942 PHBP17-201ENST00000528576 541 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
MCCD1P59942 OR52K3P-201ENST00000531655 943 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
MCCD1P59942 AC117373.1-201ENST00000544036 392 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
MCCD1P59942 AC009097.1-201ENST00000567077 406 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
MCCD1P59942 FOPNL-205ENST00000573429 646 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
MCCD1P59942 MIR4312-201ENST00000579909 76 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
MCCD1P59942 AC233702.6-201ENST00000584594 396 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
MCCD1P59942 ZNF790-AS1-201ENST00000587278 653 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
MCCD1P59942 OR7E19P-202ENST00000589942 844 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
MCCD1P59942 ZNF682-204ENST00000593468 581 ntTSL 4 BASIC7.22□□□□□ -1.25
MCCD1P59942 KC877982.1-201ENST00000602313 470 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
MCCD1P59942 RNU6-87P-201ENST00000607561 108 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
MCCD1P59942 AC093388.1-201ENST00000609166 430 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
MCCD1P59942 AC074140.1-201ENST00000621617 208 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
MCCD1P59942 AC024940.5-201ENST00000622889 474 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
MCCD1P59942 TRIM2-201ENST00000338700 6735 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
MCCD1P59942 RBBP4-202ENST00000373493 7943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
MCCD1P59942 SHC4-202ENST00000396535 2799 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.8 ms