Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

Predictions only

Length 3,210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 AC021242.1-201ENST00000507315 2035 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CENPFP49454 AC027228.2-201ENST00000567141 2154 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CENPFP49454 ATP5S-202ENST00000311459 10212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
CENPFP49454 AC092376.2-201ENST00000622621 4116 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CENPFP49454 OR1L4-201ENST00000259466 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CENPFP49454 RN7SKP74-201ENST00000362849 309 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CENPFP49454 AC090136.1-201ENST00000520009 240 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CENPFP49454 AC037471.2-201ENST00000564941 598 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
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CENPFP49454 MAPK10-349ENST00000641767 3661 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CENPFP49454 PPARGC1A-201ENST00000264867 6318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
CENPFP49454 MR1-209ENST00000617803 7584 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.65
CENPFP49454 MFN1-201ENST00000263969 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
CENPFP49454 SLC1A2-202ENST00000395750 11538 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
CENPFP49454 PCLO-201ENST00000333891 20329 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CENPFP49454 RNU4-6P-201ENST00000410804 122 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
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CENPFP49454 AC018742.1-201ENST00000435237 488 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
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CENPFP49454 LINC01969-201ENST00000514468 455 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
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CENPFP49454 RN7SL853P-201ENST00000617250 223 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CENPFP49454 GON4L-204ENST00000437809 7713 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CENPFP49454 PSMC6-218ENST00000606149 1560 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
CENPFP49454 UTY-209ENST00000537580 6490 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
CENPFP49454 HUWE1-203ENST00000342160 14796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CENPFP49454 DMD-202ENST00000343523 5623 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CENPFP49454 MAP3K13-201ENST00000265026 9876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
CENPFP49454 ERGIC2-201ENST00000360150 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
CENPFP49454 SV2B-202ENST00000394232 11279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CENPFP49454 CKS1BP6-201ENST00000424932 240 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CENPFP49454 AC104306.1-201ENST00000449702 371 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
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CENPFP49454 AC011396.1-201ENST00000507391 312 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
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CENPFP49454 ZNF532-214ENST00000589288 5585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
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CENPFP49454 GON4L-217ENST00000615926 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
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CENPFP49454 DNAJC12-205ENST00000483798 769 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
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CENPFP49454 TTTY23-201ENST00000452889 512 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
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CENPFP49454 RN7SKP141-201ENST00000516167 338 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CENPFP49454 AC013437.1-201ENST00000549878 414 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CENPFP49454 MIR5684-201ENST00000585074 65 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CENPFP49454 GALP-203ENST00000590002 150 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
CENPFP49454 AC010680.3-201ENST00000604215 520 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CENPFP49454 ITGA9-AS1-218ENST00000630762 751 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CENPFP49454 ZFHX4-204ENST00000518282 12175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CENPFP49454 ADAM29-201ENST00000359240 3325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
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