Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 DPPA2P2-201ENST00000418220 897 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 EIF4A1P1-201ENST00000420241 934 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 PRKG1-AS1-202ENST00000426785 1111 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 RPL7AP49-201ENST00000429522 581 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 VDAC1P6-201ENST00000430062 855 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 BX323845.1-201ENST00000432417 179 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 AL591438.1-201ENST00000433508 581 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 GSTA7P-201ENST00000438425 448 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 AL354794.1-201ENST00000442103 516 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 AC112492.1-201ENST00000449607 712 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 PSMC1P13-201ENST00000458195 985 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 LINC02077-201ENST00000465795 409 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 AC004263.1-201ENST00000479327 332 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 AC108748.1-201ENST00000487772 515 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 AC011405.1-201ENST00000514207 248 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 SNORA31.13-201ENST00000516624 135 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 IGHVIII-47-1-201ENST00000518187 331 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 AC078906.1-201ENST00000523602 798 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 AP002765.2-201ENST00000532961 666 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 AC092112.1-201ENST00000538329 640 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 GCSHP4-201ENST00000538792 439 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 AL049875.1-201ENST00000554328 582 ntTSL 4 BASIC6.44□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 AC106729.1-201ENST00000567777 466 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 AC105411.1-203ENST00000568819 601 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 AC005324.5-201ENST00000584540 571 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 AC005757.1-201ENST00000591432 472 ntTSL 4 BASIC6.44□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 GMFG-202ENST00000594700 397 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 AC245008.1-201ENST00000608123 476 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 AC245100.7-201ENST00000609678 442 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 MIR378J-201ENST00000611988 109 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 AC079416.3-201ENST00000624479 549 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 AC024023.1-201ENST00000624530 922 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 AC006927.2-201ENST00000639256 389 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 AC119674.1-212ENST00000641155 993 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 AC011604.2-201ENST00000381541 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 ZNF571-203ENST00000451802 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 MECOM-202ENST00000433243 3508 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 RRP15-201ENST00000366932 7771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 SLC4A7-206ENST00000428386 7385 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 SLC10A7-202ENST00000394059 1730 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 RAB3GAP1-207ENST00000539493 3161 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 ZBTB44-210ENST00000530205 2179 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 FANCI-201ENST00000300027 4713 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 HSPA8P14-201ENST00000552265 1805 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 CPXCR1-201ENST00000276127 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 TET1-201ENST00000373644 9288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 FAT4-202ENST00000394329 16123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 ADAM29-203ENST00000445694 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 MSL3P1-202ENST00000440028 1468 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 TMLHE-AS1-201ENST00000433624 1702 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 SNORD56.4-201ENST00000363883 71 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 SNORA66-201ENST00000384792 133 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 HMGB3P7-201ENST00000400214 611 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 HNRNPDP2-201ENST00000406475 478 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 BMS1P17-201ENST00000413661 723 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 RPL22P18-201ENST00000417197 377 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 VN1R108P-201ENST00000431580 830 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 TEX41-205ENST00000431734 529 ntTSL 4 BASIC6.43□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 RPS7P2-201ENST00000435134 607 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 FABP5P3-201ENST00000437960 408 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 PRPF38AP2-201ENST00000438179 851 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 ZBTB40-IT1-201ENST00000438551 273 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 KATNBL1P3-201ENST00000443475 909 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 AL050303.1-201ENST00000444356 458 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 AL355601.1-201ENST00000444701 427 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 AC023271.1-201ENST00000445936 1090 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 RSL24D1P3-201ENST00000449255 495 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 AGBL4-IT1-201ENST00000457061 514 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 CEP70-205ENST00000464035 1054 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 ADGRL3-AS1-202ENST00000504135 542 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 AC139718.2-201ENST00000506068 481 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 TRDN-204ENST00000542443 1294 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 NMNAT1P1-201ENST00000554095 876 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 AC009097.3-201ENST00000563557 1018 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 MMP2-AS1-202ENST00000569037 553 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 LINC00511-212ENST00000581183 657 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 AC099785.1-201ENST00000605697 437 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 uc_338.18-201ENST00000615451 175 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 AC091304.6-201ENST00000619761 202 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 MIR6839-201ENST00000620425 113 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 AC004232.3-201ENST00000622977 525 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 AC078883.4-201ENST00000623218 367 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 FP475955.2-201ENST00000623720 458 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 EIF3M-208ENST00000531120 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 DECR1-215ENST00000522161 1766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 AC091045.1-201ENST00000561460 2277 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 AL513185.3-201ENST00000433335 1300 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 TTC41P-205ENST00000551270 3963 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 AL355578.1-201ENST00000607405 1328 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 DAZ4-207ENST00000634662 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 ZNF891-201ENST00000537226 15455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 SP110-202ENST00000258382 2080 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 KLHL5-202ENST00000261426 3300 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 ACE2-201ENST00000252519 3393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 SETDB2-201ENST00000258672 2138 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 CLCA1-202ENST00000394711 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 OR4F5-202ENST00000641515 2618 ntAPPRIS P1 BASIC6.43□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 TEK-205ENST00000615002 4666 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 IL31RA-204ENST00000396834 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 ANKRD30A-204ENST00000602533 4458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 128.5 ms