Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 SEC24D-211ENST00000511481 2626 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
TCOF1Q13428 PIGN-241ENST00000640050 3154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
TCOF1Q13428 THAP12P5-201ENST00000405864 2275 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
TCOF1Q13428 ZNF532-201ENST00000336078 6696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
TCOF1Q13428 BMPR1B-202ENST00000394931 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
TCOF1Q13428 ETV1-205ENST00000405192 4402 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
TCOF1Q13428 CFHR3-206ENST00000617219 1462 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
TCOF1Q13428 EXPH5-203ENST00000525344 6542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
TCOF1Q13428 SPART-202ENST00000438666 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
TCOF1Q13428 MIR449B-201ENST00000384995 97 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
TCOF1Q13428 TRAV36DV7-201ENST00000390463 356 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
TCOF1Q13428 CCL7-202ENST00000394627 696 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
TCOF1Q13428 SF3B1-202ENST00000409915 600 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
TCOF1Q13428 RN7SKP33-201ENST00000410942 340 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
TCOF1Q13428 SKINT1L-203ENST00000453388 749 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
TCOF1Q13428 AL603839.1-201ENST00000453437 432 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
TCOF1Q13428 snoU13.24-201ENST00000458998 104 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
TCOF1Q13428 VN1R105P-201ENST00000486595 910 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
TCOF1Q13428 TPT1P3-201ENST00000492841 512 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
TCOF1Q13428 AC005699.1-205ENST00000510639 427 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
TCOF1Q13428 MIR4286-201ENST00000580651 93 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
TCOF1Q13428 MIR7151-201ENST00000617477 60 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
TCOF1Q13428 DDX4-204ENST00000505374 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
TCOF1Q13428 TAB3-204ENST00000378932 3698 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
TCOF1Q13428 KLRC4-KLRK1-201ENST00000539300 1507 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
TCOF1Q13428 MYBPC1-205ENST00000536007 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
TCOF1Q13428 MYBPC1-206ENST00000541119 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
TCOF1Q13428 STXBP4-204ENST00000434978 2807 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
TCOF1Q13428 AFF2-201ENST00000286437 12280 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
TCOF1Q13428 PTPRD-202ENST00000356435 9472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
TCOF1Q13428 NXPH1-205ENST00000602349 1953 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
TCOF1Q13428 CDK14-201ENST00000265741 4953 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
TCOF1Q13428 ERGIC2-212ENST00000611644 4961 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
TCOF1Q13428 AC104260.2-201ENST00000623551 3497 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
TCOF1Q13428 PVALB-202ENST00000404171 422 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
TCOF1Q13428 HYKK-202ENST00000408962 847 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
TCOF1Q13428 AC010163.2-201ENST00000416341 381 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
TCOF1Q13428 LINC01468-201ENST00000422763 570 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
TCOF1Q13428 AL117339.2-201ENST00000430475 180 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
TCOF1Q13428 AP000302.1-201ENST00000450928 666 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
TCOF1Q13428 LINC02017-201ENST00000496829 474 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
TCOF1Q13428 AL592156.1-201ENST00000508758 304 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
TCOF1Q13428 AC004704.1-201ENST00000511219 583 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
TCOF1Q13428 SNHG27-203ENST00000514222 680 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
TCOF1Q13428 AP001804.2-201ENST00000533932 910 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
TCOF1Q13428 AC078889.1-201ENST00000536412 523 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
TCOF1Q13428 HYKK-203ENST00000563233 734 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
TCOF1Q13428 RN7SL600P-201ENST00000581811 299 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
TCOF1Q13428 AC011507.1-201ENST00000585364 567 ntTSL 4 BASIC6.62□□□□□ -1.35
TCOF1Q13428 HMGB2P1-201ENST00000591146 634 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
TCOF1Q13428 MIR6867-201ENST00000610636 67 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
TCOF1Q13428 AC008013.2-202ENST00000637965 364 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
TCOF1Q13428 NSD1-201ENST00000347982 7688 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
TCOF1Q13428 SUPT16HP1-201ENST00000537175 3133 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
TCOF1Q13428 MECOM-202ENST00000433243 3508 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
TCOF1Q13428 DAAM1-202ENST00000395125 5806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
TCOF1Q13428 SLC9C1-201ENST00000305815 4172 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
TCOF1Q13428 OFD1P5Y-201ENST00000447585 2590 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
TCOF1Q13428 GOLPH3L-201ENST00000271732 2999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
TCOF1Q13428 IKZF2-207ENST00000434687 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
TCOF1Q13428 ORC4-202ENST00000392857 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
TCOF1Q13428 WDR5B-201ENST00000330689 3720 ntAPPRIS P1 BASIC6.61□□□□□ -1.35
TCOF1Q13428 SENP7-202ENST00000348610 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
TCOF1Q13428 BPY2-202ENST00000382585 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
TCOF1Q13428 MYCBP2-AS1-201ENST00000422231 519 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
TCOF1Q13428 AC007389.2-201ENST00000434630 306 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
TCOF1Q13428 AC006326.1-201ENST00000445465 787 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
TCOF1Q13428 AL133547.1-201ENST00000448546 220 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
TCOF1Q13428 EIF4A2P2-201ENST00000455776 1070 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
TCOF1Q13428 AC117430.1-201ENST00000474711 801 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
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TCOF1Q13428 AC243756.2-201ENST00000618406 463 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
TCOF1Q13428 BPY2C-204ENST00000618574 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
TCOF1Q13428 LGALS13-204ENST00000621475 494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
TCOF1Q13428 FP325313.1-201ENST00000638228 703 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
TCOF1Q13428 AL133268.1-201ENST00000405676 1401 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
TCOF1Q13428 OSBPL11-201ENST00000296220 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
TCOF1Q13428 AC004852.2-204ENST00000614137 1370 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
TCOF1Q13428 TCP11X1-202ENST00000622971 1372 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
TCOF1Q13428 RNU1-14P-201ENST00000362759 152 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
TCOF1Q13428 NPM1P37-201ENST00000403105 874 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
TCOF1Q13428 ARL4AP4-201ENST00000434170 518 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
TCOF1Q13428 AC073636.1-202ENST00000457756 558 ntTSL 4 BASIC6.6□□□□□ -1.35
TCOF1Q13428 AC091564.1-201ENST00000464563 479 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
TCOF1Q13428 LINC02465-204ENST00000514892 481 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
TCOF1Q13428 OR5BC1P-201ENST00000529327 739 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
TCOF1Q13428 AC136475.4-201ENST00000534271 280 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
TCOF1Q13428 AC024224.2-201ENST00000544225 782 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
TCOF1Q13428 LINC00254-201ENST00000563416 662 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
TCOF1Q13428 Z98200.1-201ENST00000607298 470 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
TCOF1Q13428 MIR8059-201ENST00000620427 81 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
TCOF1Q13428 HELZ-207ENST00000580168 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
TCOF1Q13428 PCDH18-201ENST00000344876 5906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
TCOF1Q13428 NABP1-204ENST00000410026 11521 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
TCOF1Q13428 DZIP3-201ENST00000361582 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
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