Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 AP000770.1-201ENST00000444123 583 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 AP002345.1-201ENST00000456493 928 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 SSR3-208ENST00000496050 579 ntTSL 4 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 AC023424.1-201ENST00000496058 459 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 NIFKP7-201ENST00000503365 834 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 F11-AS1-201ENST00000505103 1178 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 AC104071.1-201ENST00000505636 602 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 AC106864.1-201ENST00000510655 640 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 RN7SKP276-201ENST00000516242 268 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 IGKV1-32-201ENST00000519290 311 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 AC009884.1-201ENST00000522670 545 ntTSL 4 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 AC013714.1-201ENST00000524707 747 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 AP001880.2-201ENST00000538233 448 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 ZNF84-212ENST00000542874 540 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 AC006349.1-201ENST00000555526 235 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 AC027216.1-201ENST00000577726 685 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 AC068020.1-201ENST00000594215 661 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 CERS6-AS1-204ENST00000599361 536 ntTSL 4 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 AC010422.4-201ENST00000601420 533 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 AC130352.1-201ENST00000602979 661 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 LAMTOR5-AS1-217ENST00000608152 407 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 LAMTOR5-AS1-227ENST00000609653 457 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 CCL4L2-215ENST00000620055 537 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 CCL4-203ENST00000621626 552 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 AC012593.1-212ENST00000627058 580 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 PHACTR2P1-202ENST00000636592 773 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 GLRA2-202ENST00000355020 1730 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 TAX1BP1-202ENST00000396319 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 AL592182.3-201ENST00000642132 3304 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 MYOZ2-201ENST00000307128 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 RNF133-201ENST00000340112 1445 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 UBE4A-202ENST00000431736 6061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 MAPK10-328ENST00000641553 4009 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 AC083843.3-201ENST00000623679 2186 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 OR4E1-202ENST00000641792 3742 ntAPPRIS P5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 C3orf58-202ENST00000441925 3260 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 IL20-201ENST00000367096 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 RNA5SP187-201ENST00000384400 119 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
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SGCGQ13326 RNU2-72P-201ENST00000411175 163 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 AC079809.1-201ENST00000415468 276 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 AL359378.2-201ENST00000415575 746 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 AC006369.1-201ENST00000419425 548 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 AC079790.1-201ENST00000420365 507 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
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SGCGQ13326 AL050338.2-202ENST00000431609 956 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
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SGCGQ13326 AP000720.1-201ENST00000625091 483 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 ZNF652P1-201ENST00000442420 1309 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 AC139713.2-209ENST00000509873 1303 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 EMSY-205ENST00000524767 4116 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
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SGCGQ13326 VIRMA-201ENST00000297591 6528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 ZNF639-210ENST00000621687 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 LINC01192-202ENST00000470546 1519 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
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SGCGQ13326 PRUNE2-204ENST00000376718 12584 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 IBTK-206ENST00000503631 3560 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 LINC02203-203ENST00000625989 1600 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 MYBPC1-201ENST00000361466 3899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 AC104623.2-202ENST00000623477 4002 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 RGS4-202ENST00000367908 2606 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 MRPL35-202ENST00000337109 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 LINC00989-201ENST00000508174 2080 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 HIST1H2BD-201ENST00000289316 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 CFHR2-201ENST00000367415 1059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 AL357515.1-201ENST00000402967 542 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 RPS4XP9-201ENST00000405151 780 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 Y_RNA.625-201ENST00000411256 107 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 COX5BP7-201ENST00000414780 274 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 RPL26P29-201ENST00000415623 438 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 AL590139.1-201ENST00000416267 400 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 AC034195.1-201ENST00000420000 559 ntTSL 4 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 AC048351.1-201ENST00000420064 602 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 AC006065.1-201ENST00000422539 802 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 AC245028.1-201ENST00000423259 256 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 RPL12P28-201ENST00000430852 489 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 TRIM31-AS1-204ENST00000440874 549 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 AC074327.1-202ENST00000443523 369 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 GEMIN8P3-201ENST00000445417 720 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 CASP12-208ENST00000448103 1071 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 MTND5P8-201ENST00000449817 1083 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 AL161630.1-201ENST00000450938 1299 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 AC010733.1-201ENST00000451515 401 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
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