Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 AC109462.1-201ENST00000491087 368 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 RPL9P6-201ENST00000492764 598 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 RPS4XP14-201ENST00000493072 781 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 MTCYBP18-201ENST00000501056 747 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 AC025459.1-201ENST00000504072 156 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 AC008448.1-201ENST00000505109 584 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 LINC02505-202ENST00000510597 776 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 AC004704.1-201ENST00000511219 583 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 AC093305.1-201ENST00000514105 522 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 LINC01339-203ENST00000519336 561 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 SNHG6-202ENST00000520619 479 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 AC079015.1-201ENST00000521793 596 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 OR5AZ1P-201ENST00000527448 943 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 AL121594.2-201ENST00000541658 472 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 AL049872.1-201ENST00000556323 322 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 AC066612.2-201ENST00000559875 695 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 AC091489.2-201ENST00000566263 604 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 AL359715.3-201ENST00000569267 2123 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 AC005154.1-222ENST00000579024 341 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 AC138207.6-203ENST00000581652 565 ntTSL 4 BASIC7.26□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 RBBP8-210ENST00000581687 617 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 AC012254.4-201ENST00000588843 273 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 AC025278.1-201ENST00000593558 515 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 AC008764.2-201ENST00000597226 376 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 HCG18-243ENST00000602498 327 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 DUXAP4-201ENST00000603046 613 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 AL022154.1-201ENST00000604698 785 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 AL049634.3-201ENST00000604968 457 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 AC131902.3-201ENST00000611767 581 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 AL513314.2-201ENST00000621440 545 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 AC010168.2-201ENST00000562691 5428 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 ANO4-201ENST00000392977 3509 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 ITPR1-205ENST00000456211 9717 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 GTF2IP4-201ENST00000453092 2054 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 EED-206ENST00000527888 1422 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 XRCC5-201ENST00000392132 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 NDST4-204ENST00000613194 3439 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 CASC11-201ENST00000502463 3301 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 IGSF6-201ENST00000268389 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 UGT2A2-202ENST00000604629 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 SGCD-202ENST00000435422 9755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 LINC01793-201ENST00000409590 2036 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 MAPK10-366ENST00000641903 2812 ntAPPRIS ALT1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 CNOT6LP1-201ENST00000559681 1462 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 AC105411.1-201ENST00000568776 1470 ntTSL 4 BASIC7.25□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 RAB3B-201ENST00000371655 12844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 MED1-201ENST00000300651 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 MLF1-208ENST00000478894 1372 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 TRIP12-201ENST00000283943 9874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 KTN1-223ENST00000555573 1712 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 RN7SKP162-201ENST00000363605 345 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 SNORA70H-201ENST00000383910 135 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 SNORA70J-201ENST00000384182 135 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 AL360271.1-201ENST00000395679 510 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 CIR1P3-201ENST00000405137 479 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 OR6E1P-201ENST00000414424 923 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 AC079163.1-201ENST00000418416 407 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 AL022400.1-201ENST00000423946 935 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 AL157786.1-206ENST00000424422 551 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 PCYT1B-AS1-201ENST00000432626 275 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 AP000365.1-201ENST00000438850 546 ntTSL 4 BASIC7.25□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 GDI2P2-201ENST00000445131 608 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 AP000477.2-201ENST00000447405 778 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 AC019117.1-204ENST00000451792 442 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 NIPA2P5-201ENST00000452282 464 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 OR9M1P-201ENST00000459641 921 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 AC115223.1-201ENST00000466377 870 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 RPL35AP19-201ENST00000469425 329 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 AC011979.1-201ENST00000472300 483 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 AC007003.1-201ENST00000472463 736 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 DUTP7-201ENST00000507982 486 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 AC093824.1-201ENST00000508796 343 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 AC034238.3-201ENST00000512349 591 ntTSL 4 BASIC7.25□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 AC027335.1-201ENST00000515377 543 ntTSL 4 BASIC7.25□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 RNU6-964P-201ENST00000516524 69 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 AC120193.1-201ENST00000518988 741 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 LINC02545-201ENST00000525381 306 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 AP000873.2-203ENST00000528524 549 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 AC116535.2-201ENST00000532365 441 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 AC091047.1-201ENST00000533344 552 ntTSL 4 BASIC7.25□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 AC026992.1-201ENST00000558269 571 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 AC009113.2-201ENST00000563182 403 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 AC113208.4-201ENST00000563568 206 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 AC006116.4-201ENST00000589671 452 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 AC103792.1-201ENST00000603591 919 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 AP000860.1-201ENST00000605250 559 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 AL160400.1-201ENST00000606385 1030 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 AC097376.2-202ENST00000608345 433 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 Y_RNA.812-201ENST00000610788 101 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 Y_RNA.784-201ENST00000613803 101 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 Y_RNA.787-201ENST00000616522 101 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 Y_RNA.780-201ENST00000617336 101 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 Y_RNA.801-201ENST00000619005 101 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 HGF-205ENST00000423064 1990 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 MTTP-203ENST00000457717 4092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 AL359715.4-201ENST00000606629 1436 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 GPATCH2L-201ENST00000261530 14007 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 RASGRP1-203ENST00000450598 2296 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 PYROXD1-205ENST00000538582 3639 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 AC073342.2-201ENST00000595842 1800 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
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