Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 PCBP1-AS1-237ENST00000452431 1194 ntTSL 4 BASIC4.81□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 AC092647.2-201ENST00000452998 253 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 UBA52P7-201ENST00000486088 380 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 RN7SL30P-201ENST00000488416 306 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 AC000372.1-201ENST00000488818 646 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 AC097515.1-202ENST00000511818 371 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 ZCCHC10-210ENST00000513848 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 LINC00535-202ENST00000517785 264 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 IGHV3-63-201ENST00000518422 341 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 EIF4A2P3-201ENST00000525903 1055 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 AC100770.1-201ENST00000532310 322 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 AC022196.1-202ENST00000559570 462 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 AC021483.2-201ENST00000567415 758 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 AC010551.2-201ENST00000569200 416 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 AC209154.1-201ENST00000582156 337 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 AC131274.1-201ENST00000582507 254 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 PSMD5-AS1-203ENST00000589026 525 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 SRD5A3-AS1-204ENST00000592823 542 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 Z98949.1-211ENST00000596813 773 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 AC004160.1-202ENST00000599917 578 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 AC105254.2-201ENST00000603636 436 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 MIR4435-2HG-220ENST00000609902 603 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 MIR6768-201ENST00000610734 72 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 uc_338.32-201ENST00000615087 172 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 AC019206.1-201ENST00000621938 425 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 LINC02246-206ENST00000630211 712 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 ZNF568-216ENST00000619231 3797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 PPP1R2P3-201ENST00000522232 1991 ntAPPRIS P1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 DCDC1-211ENST00000597505 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 ATG12-208ENST00000509910 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 MAPK10-206ENST00000395161 4186 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 AC016588.2-201ENST00000632484 3021 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 SGO1-AS1-203ENST00000455626 2041 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 UTP20-201ENST00000261637 9025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 EEF1A1P36-201ENST00000427807 1351 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 C5orf51-204ENST00000612065 1391 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 DICER1-212ENST00000541352 5621 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 ZNF345-213ENST00000589046 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 FRYL-209ENST00000506685 1940 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 MACF1-231ENST00000564288 24828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 ST7-212ENST00000422922 1887 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 MAPK10-353ENST00000641803 8483 ntAPPRIS P2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 RGS5-212ENST00000618415 5812 ntTSL 4 BASIC4.8□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 Y_RNA.62-201ENST00000362840 99 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 SCN1A-202ENST00000375405 8097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 MT-TP-201ENST00000387461 68 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 TRAJ7-201ENST00000390530 59 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 AL391361.1-201ENST00000405580 489 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 RPL31P52-201ENST00000407532 367 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 RN7SKP177-201ENST00000410567 355 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 AF015720.1-201ENST00000412240 349 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 AC087380.1-202ENST00000415970 1163 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 CYP4F29P-201ENST00000420685 446 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 IGKV1OR9-1-201ENST00000424370 284 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 AL929288.1-201ENST00000426262 746 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 AFF2-IT1-201ENST00000435346 443 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 LINC01891-201ENST00000439798 538 ntTSL 4 BASIC4.8□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 OR7E125P-201ENST00000443450 846 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 TCEA1P1-201ENST00000449716 880 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 IGHV5-78-201ENST00000450948 295 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
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IFT88Q13099 SEPT7P6-201ENST00000469999 1143 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
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IFT88Q13099 MORC1-AS1-201ENST00000480826 564 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 RN7SL244P-201ENST00000493405 297 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 AC092924.1-201ENST00000496084 487 ntTSL 4 BASIC4.8□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 AC072052.1-201ENST00000496556 306 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 SNRPCP2-201ENST00000504370 475 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 AC010395.1-201ENST00000507627 697 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 AC113346.1-201ENST00000510150 287 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 FTH1P9-201ENST00000513251 355 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 RNA5SP154-201ENST00000516193 111 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 IGHV3-32-201ENST00000519182 355 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 AC068672.1-201ENST00000520391 328 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 SNHG14-221ENST00000554726 1116 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 AL161751.1-201ENST00000555636 1044 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 AL359232.1-201ENST00000556361 442 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 MOCS2-209ENST00000582677 741 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 EIF1P5-201ENST00000585002 234 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 AC022916.4-201ENST00000585646 475 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 AC005377.1-201ENST00000605126 456 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 AC008035.1-201ENST00000607353 448 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 SNORA35B-201ENST00000607417 129 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 AC123768.4-201ENST00000616244 701 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 AL049794.2-201ENST00000616301 365 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 AC009303.2-205ENST00000627670 1091 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 CARF-203ENST00000414439 2099 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 MGAT4A-203ENST00000409391 2018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 AC100871.1-201ENST00000507871 1456 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 PRKAA2-202ENST00000610361 9280 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 IGF2BP3-218ENST00000619562 2126 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 SLC13A1-201ENST00000194130 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 PIGN-229ENST00000638936 4233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 C11orf65-208ENST00000615746 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 CREM-202ENST00000342105 1541 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 AC096751.1-201ENST00000515178 2202 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 STEAP2-203ENST00000394622 6612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 CCDC169-202ENST00000239860 716 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 OR4C11-201ENST00000302231 1045 ntAPPRIS P1 BASIC4.79□□□□□ -1.64
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