Protein–RNA interactions for Protein: A7E2U8

C4orf47, UPF0602 protein C4orf47, humanhuman

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf47A7E2U8 AC138360.1-201ENST00000552332 386 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 LINC02520-201ENST00000570443 537 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 LINC02185-201ENST00000575424 760 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 ELSPBP1-205ENST00000597519 557 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 AL590392.1-201ENST00000604960 446 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 AL391358.1-201ENST00000605342 190 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 AC026786.2-201ENST00000606110 392 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 AC080013.6-201ENST00000606185 215 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 AC004775.1-201ENST00000607389 753 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 AL135786.2-201ENST00000608422 615 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 AL592494.3-201ENST00000609485 464 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 TATDN1-221ENST00000630259 915 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 RAB3GAP1-207ENST00000539493 3161 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 ZNF415-201ENST00000243643 2270 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 PTK2-213ENST00000519465 3279 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 RBPJP2-201ENST00000618187 1444 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 DTNA-230ENST00000598334 3201 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 SUPT3H-203ENST00000371460 2389 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 ASXL3-201ENST00000269197 11399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 PRKAA1-204ENST00000397128 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 SYTL2-204ENST00000389958 1943 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 SLITRK4-202ENST00000356928 3074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 IPO11-203ENST00000409534 1725 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 ZNF33A-202ENST00000374618 6122 ntTSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 AL513185.3-201ENST00000433335 1300 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 ZFP14-201ENST00000270001 7489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 AC022893.1-201ENST00000517664 3549 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 ZNF681-201ENST00000402377 6497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 AC008505.1-201ENST00000637582 2025 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 AL033384.1-202ENST00000431554 3104 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 MLH3-210ENST00000556257 4229 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 COA1-201ENST00000223336 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 IL5-201ENST00000231454 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 DEFB136-201ENST00000382209 237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 AC104297.1-201ENST00000393779 870 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 RPS3AP23-201ENST00000401762 784 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 MIR1193-201ENST00000408109 78 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 ARSD-AS1-201ENST00000414053 816 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 MOBP-203ENST00000415443 577 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 AC004690.1-201ENST00000418216 328 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 MTCYBP7-201ENST00000419540 1134 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 AC034195.1-201ENST00000420000 559 ntTSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 AL158166.2-201ENST00000420845 748 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 AL158154.1-201ENST00000427387 465 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 AP000146.1-202ENST00000441666 441 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 LINC01307-202ENST00000444327 771 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 AL589963.1-201ENST00000449282 727 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 LINC01312-202ENST00000456347 813 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 HSPE1P22-201ENST00000456856 327 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 AC091976.1-201ENST00000458002 448 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 AC006148.2-201ENST00000467017 650 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 GAPDHP56-201ENST00000506031 988 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 LINC00491-204ENST00000513815 582 ntTSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 AC010261.2-201ENST00000515563 588 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 AC073023.1-201ENST00000522896 773 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 AC018442.3-201ENST00000523025 183 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 AC087783.1-201ENST00000527135 564 ntTSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 AP001318.3-202ENST00000528876 509 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 AP000873.2-205ENST00000529031 435 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 AC005906.2-204ENST00000541095 481 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 LDAH-211ENST00000541941 3807 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 AL161804.1-201ENST00000555600 708 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 AC022196.1-202ENST00000559570 462 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 AGBL1-AS1-203ENST00000566878 865 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 AC005856.1-201ENST00000585921 286 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 AC118757.1-201ENST00000586982 453 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 RNF138P2-201ENST00000603490 592 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 AL645927.2-201ENST00000618350 349 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 AP002791.1-201ENST00000623291 381 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 AC084816.1-212ENST00000625240 1114 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 PPARGC1A-201ENST00000264867 6318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 RNF19A-205ENST00000519449 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 FNIP1-201ENST00000307954 6366 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 AC104793.1-201ENST00000508189 2840 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 MPDZ-212ENST00000538841 3186 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 AC019072.1-201ENST00000604535 1551 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 C6orf10-210ENST00000617061 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 TCF4-290ENST00000638154 7801 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 CAV1-205ENST00000405348 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 TEK-205ENST00000615002 4666 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 FAM35A-202ENST00000298786 3614 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 CLVS1-205ENST00000519846 3622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 OR52E5-201ENST00000610445 2244 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 PTK2-212ENST00000519419 4439 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.61
C4orf47A7E2U8 GPX8-201ENST00000296734 3245 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
C4orf47A7E2U8 MTRR-202ENST00000440940 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
C4orf47A7E2U8 AC008695.1-201ENST00000514667 6393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
C4orf47A7E2U8 NSD1-204ENST00000439151 12892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
C4orf47A7E2U8 OR52A5-201ENST00000307388 3973 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
C4orf47A7E2U8 FAM26D-202ENST00000368597 1311 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
C4orf47A7E2U8 OR2J3-201ENST00000377169 1325 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
C4orf47A7E2U8 OR52A5-202ENST00000642125 3993 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
C4orf47A7E2U8 EIF4EBP2-201ENST00000373218 7257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
C4orf47A7E2U8 DDHD2-202ENST00000517385 4113 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
C4orf47A7E2U8 IGF1-202ENST00000337514 7359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
C4orf47A7E2U8 CASP10-204ENST00000346817 3926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
C4orf47A7E2U8 F9-201ENST00000218099 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
C4orf47A7E2U8 NKRF-202ENST00000371527 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
C4orf47A7E2U8 RASGRP1-209ENST00000559830 1910 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
C4orf47A7E2U8 RN7SKP145-201ENST00000363291 303 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.6 ms