Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

Predictions only

Length 582 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 CCL4L2-215ENST00000620055 537 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
SHOC2Q9UQ13 AC015660.5-201ENST00000623238 564 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SHOC2Q9UQ13 AJ009632.2-203ENST00000634708 1205 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
SHOC2Q9UQ13 AC013470.2-206ENST00000636804 771 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
SHOC2Q9UQ13 AL049767.1-202ENST00000637826 242 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SHOC2Q9UQ13 PTPRC-209ENST00000442510 5164 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
SHOC2Q9UQ13 FYB1-201ENST00000351578 4750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
SHOC2Q9UQ13 NSD1-202ENST00000354179 12195 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
SHOC2Q9UQ13 SLC1A3-201ENST00000265113 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
SHOC2Q9UQ13 LINC01553-203ENST00000521074 4329 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
SHOC2Q9UQ13 AC073055.1-201ENST00000456901 1621 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SHOC2Q9UQ13 AL354733.2-209ENST00000589233 1434 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
SHOC2Q9UQ13 STEAP2-205ENST00000394629 2261 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
SHOC2Q9UQ13 PHACTR4-201ENST00000373836 3107 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
SHOC2Q9UQ13 EXTL2-201ENST00000370113 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
SHOC2Q9UQ13 CCNT1-205ENST00000618666 6915 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SHOC2Q9UQ13 MECOM-217ENST00000494292 3939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SHOC2Q9UQ13 ATPAF1-212ENST00000542495 1779 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SHOC2Q9UQ13 WDHD1-201ENST00000360586 5996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
SHOC2Q9UQ13 DOCK10-202ENST00000409592 7288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
SHOC2Q9UQ13 RAD17-220ENST00000616683 3057 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
SHOC2Q9UQ13 UBXN7-201ENST00000296328 10568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
SHOC2Q9UQ13 DNAH14-208ENST00000430092 13763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SHOC2Q9UQ13 ADGRL2-209ENST00000370727 5164 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SHOC2Q9UQ13 AL138820.1-201ENST00000617901 5305 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SHOC2Q9UQ13 KCNJ16-204ENST00000585558 4014 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
SHOC2Q9UQ13 ARID2-202ENST00000422737 5481 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
SHOC2Q9UQ13 METTL21EP-201ENST00000298105 713 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SHOC2Q9UQ13 DEFB112-201ENST00000322246 342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
SHOC2Q9UQ13 OR5K4-201ENST00000354924 966 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SHOC2Q9UQ13 RNU6-543P-201ENST00000362576 108 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SHOC2Q9UQ13 RNU6-666P-201ENST00000363499 107 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SHOC2Q9UQ13 Y_RNA.169-201ENST00000363745 96 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SHOC2Q9UQ13 SEC61A2-203ENST00000379017 600 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SHOC2Q9UQ13 RNU6-185P-201ENST00000384421 107 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SHOC2Q9UQ13 TRAV14DV4-201ENST00000390440 425 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SHOC2Q9UQ13 AC105402.1-201ENST00000413336 545 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SHOC2Q9UQ13 AC073257.2-201ENST00000413991 528 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SHOC2Q9UQ13 MOBP-203ENST00000415443 577 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SHOC2Q9UQ13 CACYBPP1-201ENST00000438592 684 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SHOC2Q9UQ13 ARAFP2-201ENST00000440565 559 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SHOC2Q9UQ13 AL353093.1-201ENST00000441292 436 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SHOC2Q9UQ13 LINC01496-201ENST00000448761 460 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SHOC2Q9UQ13 AL034380.1-201ENST00000448791 306 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SHOC2Q9UQ13 AL512658.1-201ENST00000449072 533 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SHOC2Q9UQ13 PPIAP20-201ENST00000449839 135 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SHOC2Q9UQ13 LINC01344-202ENST00000449842 571 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SHOC2Q9UQ13 DNAJB5P1-201ENST00000454004 806 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SHOC2Q9UQ13 AP006216.2-201ENST00000457746 333 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SHOC2Q9UQ13 AC245028.2-201ENST00000458673 253 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SHOC2Q9UQ13 AC079168.1-201ENST00000458741 345 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SHOC2Q9UQ13 NCK1-AS1-201ENST00000461864 1194 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SHOC2Q9UQ13 LINC02040-201ENST00000481004 556 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SHOC2Q9UQ13 RN7SL184P-201ENST00000488308 297 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SHOC2Q9UQ13 RN7SL547P-201ENST00000490793 290 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SHOC2Q9UQ13 AL136038.1-201ENST00000497246 351 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SHOC2Q9UQ13 OSMR-AS1-201ENST00000506463 800 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SHOC2Q9UQ13 AC034244.1-201ENST00000507687 207 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SHOC2Q9UQ13 LINC02505-202ENST00000510597 776 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SHOC2Q9UQ13 ZFAND1-217ENST00000521895 885 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SHOC2Q9UQ13 AC068672.3-201ENST00000524017 824 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SHOC2Q9UQ13 RGS5-208ENST00000530507 851 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SHOC2Q9UQ13 LINC02303-202ENST00000554711 531 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SHOC2Q9UQ13 FRMD6-AS2-202ENST00000557625 581 ntTSL 4 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SHOC2Q9UQ13 AC023906.4-201ENST00000557898 895 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SHOC2Q9UQ13 AC090971.2-201ENST00000558142 510 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SHOC2Q9UQ13 AC009852.2-201ENST00000567898 485 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SHOC2Q9UQ13 AGGF1P6-201ENST00000569213 976 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SHOC2Q9UQ13 AC012146.1-201ENST00000571138 462 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SHOC2Q9UQ13 MYL12B-204ENST00000584539 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SHOC2Q9UQ13 AC022031.2-203ENST00000587346 565 ntTSL 4 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SHOC2Q9UQ13 Z94722.1-201ENST00000604328 474 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SHOC2Q9UQ13 AL392112.1-201ENST00000605115 829 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SHOC2Q9UQ13 AC000068.2-201ENST00000608816 460 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SHOC2Q9UQ13 MIR8080-201ENST00000622224 89 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SHOC2Q9UQ13 AC138965.3-201ENST00000623875 498 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SHOC2Q9UQ13 AL355306.2-208ENST00000634868 1251 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SHOC2Q9UQ13 LINC02211-204ENST00000642024 1070 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SHOC2Q9UQ13 SLC10A7-202ENST00000394059 1730 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
SHOC2Q9UQ13 C5orf42-201ENST00000425232 11199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SHOC2Q9UQ13 AC020571.1-202ENST00000433933 1413 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
SHOC2Q9UQ13 ATXN3-207ENST00000503767 1315 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
SHOC2Q9UQ13 C2orf66-201ENST00000342506 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
SHOC2Q9UQ13 CCT8P1-201ENST00000413611 1657 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SHOC2Q9UQ13 RBM5-214ENST00000469838 2716 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
SHOC2Q9UQ13 SYTL2-204ENST00000389958 1943 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.53
SHOC2Q9UQ13 BMPR1APS1-201ENST00000403332 1598 ntBASIC5.46□□□□□ -1.53
SHOC2Q9UQ13 PPEF1-201ENST00000349874 2687 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
SHOC2Q9UQ13 HNF4G-203ENST00000396423 4209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
SHOC2Q9UQ13 AC010266.2-201ENST00000564741 3255 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SHOC2Q9UQ13 GTDC1-220ENST00000618778 2317 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
SHOC2Q9UQ13 TCP11X1-202ENST00000622971 1372 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SHOC2Q9UQ13 SERPINB7-207ENST00000546027 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
SHOC2Q9UQ13 ZNF143-201ENST00000299606 2562 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
SHOC2Q9UQ13 AC133552.1-201ENST00000569988 4007 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SHOC2Q9UQ13 GLYATL1-202ENST00000317391 1627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
SHOC2Q9UQ13 C4orf17-201ENST00000326581 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
SHOC2Q9UQ13 GPHN-204ENST00000543237 2459 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
SHOC2Q9UQ13 ACADSB-201ENST00000358776 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
SHOC2Q9UQ13 BPHL-201ENST00000380368 797 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.8 ms