Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 ZNF343-207ENST00000612935 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 EPHA3-202ENST00000452448 2546 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 NOVA1-213ENST00000574031 1431 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 ABCC13-202ENST00000463099 3842 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 WDPCP-202ENST00000398544 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 GAS2L3-202ENST00000537247 2742 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 RIMS2-205ENST00000436393 4384 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 KTN1-202ENST00000395308 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 ZNF334-203ENST00000593880 2635 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 AC021086.1-201ENST00000499025 1569 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 AC093591.2-201ENST00000565254 3843 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 PLD1-203ENST00000356327 5855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 SEC31A-226ENST00000508479 3397 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 WAC-209ENST00000428935 1320 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 ZNF420-202ENST00000337995 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 ZNF230-201ENST00000429154 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 LCLAT1-203ENST00000379509 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 AC112255.1-201ENST00000624070 2493 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 ERP27-201ENST00000266397 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 EPS8-209ENST00000542903 1858 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 AC112198.2-201ENST00000426589 6996 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 AGBL4-201ENST00000334103 881 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 RNA5SP131-201ENST00000365452 119 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 MT-TP-201ENST00000387461 68 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 RNU6-244P-201ENST00000391028 104 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 FBXO11-203ENST00000405808 299 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 AL009179.1-201ENST00000406085 265 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 BTF3L4P1-201ENST00000413813 468 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 TEX41-202ENST00000414256 604 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 AC007389.1-203ENST00000414811 556 ntTSL 4 BASIC5.29□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 AP001476.3-201ENST00000429512 415 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 LINC01826-201ENST00000432894 584 ntTSL 4 BASIC5.29□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 COX7BP2-201ENST00000437976 242 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 AC006335.2-201ENST00000437993 330 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 AC017074.2-201ENST00000439382 607 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 AC073648.4-201ENST00000442655 781 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 IGBP1P3-201ENST00000447449 1000 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 RPL7L1P1-201ENST00000448259 785 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 AC079760.2-201ENST00000449361 681 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 AL157359.1-201ENST00000449840 424 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 AL591363.1-201ENST00000450091 483 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 AC234781.3-201ENST00000452540 973 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 HSPE1P22-201ENST00000456856 327 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 CHRM3-AS2-203ENST00000458325 895 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 RNU7-125P-201ENST00000458760 62 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 OARD1-211ENST00000480585 829 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 MTCYBP16-201ENST00000509187 1129 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 AC079921.1-201ENST00000509449 946 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 FABP5P12-201ENST00000515543 389 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 RNU6-615P-201ENST00000516065 106 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 TMEM97P2-201ENST00000517841 403 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 AC009884.1-201ENST00000522670 545 ntTSL 4 BASIC5.29□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 MTCO1P49-201ENST00000523429 802 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 ATXN3-215ENST00000532032 1191 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 PDCL2P2-201ENST00000533651 189 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 ASB8-202ENST00000535055 657 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 AP003037.1-201ENST00000537594 267 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 AC008250.1-201ENST00000539874 522 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 FLVCR2-207ENST00000555027 938 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 AC022929.1-201ENST00000560675 823 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 AC055874.1-201ENST00000561458 479 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 AC016180.1-201ENST00000567945 403 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 AC090403.1-204ENST00000582893 572 ntTSL 4 BASIC5.29□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 AC119751.7-201ENST00000600494 245 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 PDZPH1P-202ENST00000602846 722 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 OR2AS2P-201ENST00000606902 342 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 MIR6133-201ENST00000617057 108 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 AL121890.2-201ENST00000617644 465 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 FRG1HP-204ENST00000617940 757 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 AC139769.3-201ENST00000618383 175 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 AL591441.2-201ENST00000620059 535 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 OR6C4-203ENST00000641851 4989 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 FAM170B-AS1-203ENST00000442525 2000 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 AC006206.1-201ENST00000544842 3387 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 ELL2P3-201ENST00000457883 1602 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 MGC32805-205ENST00000510972 1424 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 OR2J3-202ENST00000641151 3297 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 LINC01222-201ENST00000427439 1785 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 MT-RNR2-201ENST00000387347 1559 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 AC015813.1-203ENST00000585065 4722 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 ADAM2-207ENST00000622267 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 AC007938.2-201ENST00000604666 2634 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 DNA2-201ENST00000358410 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 SDAD1-203ENST00000395711 2513 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 ZNF639-210ENST00000621687 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 PROX1-205ENST00000498508 8498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 MIA3-203ENST00000344922 8142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 TJP1-202ENST00000356107 6747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 GNGT1-201ENST00000248572 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 TMBIM4-201ENST00000286424 989 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 SSX5-202ENST00000347757 1261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 AMELX-201ENST00000348912 737 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 RN7SKP149-201ENST00000363008 344 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 RNA5SP394-201ENST00000364216 119 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 RNU4-4P-201ENST00000364588 130 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 MLIP-203ENST00000370877 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 PMS1-202ENST00000374826 948 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 SSX5-203ENST00000376923 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 OR2W1-201ENST00000377175 1028 ntAPPRIS P1 BASIC5.28□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 AMELX-202ENST00000380712 835 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131.2 ms