Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 AC096632.1-201ENST00000427395 310 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 AL136231.1-201ENST00000429407 730 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 UBE2V1P1-201ENST00000430836 445 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 ENOX1-AS2-201ENST00000434273 609 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 AC242426.1-201ENST00000435270 960 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 GPC6-AS1-201ENST00000436329 698 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 AL583854.1-201ENST00000438818 613 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 LINC01004-201ENST00000445184 686 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 KRTAP2-5P-201ENST00000446109 396 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 MTCO1P48-201ENST00000448024 1096 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 RSL24D1P3-201ENST00000449255 495 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 PLCE1-AS2-205ENST00000453183 427 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 UBFD1P1-201ENST00000473259 814 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 RPL7P41-201ENST00000485823 957 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 NAA50-206ENST00000493454 964 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 LINC02057-202ENST00000511794 577 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 AC098829.1-202ENST00000513384 537 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 HNRNPKP5-201ENST00000515300 253 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 AC079098.1-202ENST00000523150 573 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 OR5AZ1P-201ENST00000527448 943 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 AC024405.1-201ENST00000532521 1042 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 ASB8-215ENST00000540782 659 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 LINC00944-203ENST00000542248 548 ntTSL 4 BASIC6.36□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 AC093012.1-203ENST00000548437 450 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 NELL2-211ENST00000548826 559 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 MYL6-213ENST00000549017 502 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 LINC02444-201ENST00000550723 1256 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 AC026956.1-201ENST00000558741 396 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 AC023968.1-201ENST00000560719 475 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 LCMT1-AS1-204ENST00000569920 474 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 AC025809.1-201ENST00000585336 560 ntTSL 4 BASIC6.36□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 AC006305.2-201ENST00000589617 552 ntTSL 4 BASIC6.36□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 AC092364.1-201ENST00000598561 471 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 Z99497.2-201ENST00000603634 310 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 AL031601.1-201ENST00000605702 394 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 AC091946.2-201ENST00000606105 291 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 TULP3P1-203ENST00000606237 586 ntTSL 4 BASIC6.36□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 AC090948.2-201ENST00000607363 564 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 AC245297.2-201ENST00000610119 565 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 AC097505.1-201ENST00000610199 565 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 AL607023.1-201ENST00000620045 248 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 AC010608.2-201ENST00000624830 470 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 FP236241.1-206ENST00000625005 987 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 SMARCA2-229ENST00000634781 1106 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 DNAH5-201ENST00000265104 15633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 STON1-201ENST00000404752 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 AC104024.1-201ENST00000428142 2201 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 TRAPPC13-201ENST00000231526 2715 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 PLEKHA5-202ENST00000424268 4391 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 RMDN2-207ENST00000417700 1426 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 ERCC6L-201ENST00000334463 4243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 ZNF615-201ENST00000376716 4048 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 ZNF542P-204ENST00000482727 1305 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 EDA2R-203ENST00000396050 3429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 LMO3-209ENST00000447609 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 CFHR4-201ENST00000251424 1292 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 OR4A15-201ENST00000314706 1035 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 KLRF1-202ENST00000354855 838 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 SPP1-202ENST00000360804 1196 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 RNU6-931P-201ENST00000363850 107 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 RNA5SP485-201ENST00000365053 119 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 RNASE11-202ENST00000398009 1034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 AL512430.2-201ENST00000406786 339 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 AL133482.1-201ENST00000415988 498 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 AC013401.1-202ENST00000422017 626 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 AC078960.1-201ENST00000422160 177 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 AL365203.2-201ENST00000423444 196 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 AL593851.1-201ENST00000426171 157 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 CRIP1P1-201ENST00000427567 185 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 HSPD1P12-201ENST00000429127 1069 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 VDAC1P6-201ENST00000430062 855 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 FSIP2-AS1-202ENST00000436557 689 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 UBE2D3P1-201ENST00000436669 444 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 CEACAMP9-201ENST00000442990 513 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 TIMM8BP2-201ENST00000445940 251 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 AL020997.1-201ENST00000446554 349 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 APOOP2-201ENST00000461561 539 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 NCOR1P1-202ENST00000486162 291 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 RPS27P20-201ENST00000492051 246 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 OR4G11P-201ENST00000492842 939 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 AC068672.3-203ENST00000505166 311 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 SNX5P1-201ENST00000505757 1041 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 AC110751.1-201ENST00000511916 462 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 AC022790.1-201ENST00000522872 204 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 OR5AK1P-201ENST00000524837 922 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 PTH-202ENST00000529816 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 LINC00944-204ENST00000544499 366 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 MRPL42-203ENST00000547098 701 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 AC009803.2-201ENST00000550378 665 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 AC107958.1-201ENST00000556576 290 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 AC022872.1-201ENST00000568391 781 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 STARD6-202ENST00000577499 696 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 AC011473.2-201ENST00000596286 240 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 AL513327.3-201ENST00000602618 469 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 AC012368.3-201ENST00000604190 219 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 AC026786.2-201ENST00000606110 392 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 AC012676.3-201ENST00000614983 479 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 Metazoa_SRP.66-201ENST00000615609 282 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 AL136981.2-201ENST00000617319 734 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 KLRF1-207ENST00000617793 1096 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.9 ms