Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 MMRN1-204ENST00000508372 3234 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 SPRR2A-201ENST00000392653 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 RPL21P108-201ENST00000413857 481 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 MTATP6P20-201ENST00000414147 562 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 AC090960.1-201ENST00000421072 306 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 RPS12P10-201ENST00000427031 377 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 AC062021.1-201ENST00000429008 557 ntTSL 4 BASIC6.47□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 LINC01359-203ENST00000444349 381 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 Z73495.1-201ENST00000444982 147 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 AL121718.1-201ENST00000449463 387 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 COX7A2-205ENST00000460985 357 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 AC090058.1-201ENST00000498788 435 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 LINC01340-201ENST00000504012 724 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 AC010350.1-201ENST00000504908 231 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 SNHG27-202ENST00000507933 491 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 AC010406.1-201ENST00000507948 555 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 ENPP7P9-201ENST00000514456 627 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 RNU5A-4P-201ENST00000516588 111 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 AC010376.1-201ENST00000522101 334 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 MTCYBP20-201ENST00000524239 1129 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 AC090503.1-201ENST00000548029 729 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 AL049779.1-201ENST00000553306 670 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 AC119868.1-202ENST00000584741 347 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 AC008543.4-201ENST00000585694 442 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 AC100781.1-202ENST00000597906 463 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 AL606834.3-201ENST00000602615 496 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 IGKV1OR2-9-201ENST00000603957 287 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 IGKV1OR2-11-201ENST00000604120 287 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 RNU4-5P-201ENST00000607255 135 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 AL669942.2-201ENST00000620352 697 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 AC018628.1-201ENST00000624147 3819 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 IKZF2-210ENST00000451136 9344 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 RAD17-201ENST00000282891 2135 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 AP001157.1-201ENST00000550837 2339 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 AL603840.1-201ENST00000422374 4063 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 PSD3-202ENST00000327040 11689 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 RBMS2-201ENST00000262031 8382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 KLHL28-202ENST00000396128 6545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 SLC26A7-201ENST00000276609 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
R3HDM1Q15032 FMN1-212ENST00000616417 13529 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
R3HDM1Q15032 RGSL1-201ENST00000294854 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
R3HDM1Q15032 AL121657.1-201ENST00000327215 531 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
R3HDM1Q15032 C10orf120-201ENST00000329446 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
R3HDM1Q15032 KIF16B-202ENST00000355755 606 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
R3HDM1Q15032 SNORA62.3-201ENST00000365110 153 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
R3HDM1Q15032 SNORD116-4-201ENST00000384733 96 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
R3HDM1Q15032 Y_RNA.599-201ENST00000410489 109 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
R3HDM1Q15032 AC234781.2-201ENST00000426370 994 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
R3HDM1Q15032 AC020571.1-201ENST00000430904 768 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
R3HDM1Q15032 AC008568.1-203ENST00000433406 765 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
R3HDM1Q15032 AC015971.1-202ENST00000439077 514 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
R3HDM1Q15032 UPP2-IT1-201ENST00000439185 357 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
R3HDM1Q15032 OR7E125P-201ENST00000443450 846 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
R3HDM1Q15032 AC005772.1-201ENST00000446671 976 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
R3HDM1Q15032 ZNF347-202ENST00000452676 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
R3HDM1Q15032 ATG10-AS1-201ENST00000504846 648 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
R3HDM1Q15032 AC010486.2-201ENST00000505572 483 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
R3HDM1Q15032 AC025470.2-201ENST00000506106 897 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
R3HDM1Q15032 AC007016.1-201ENST00000512110 244 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
R3HDM1Q15032 RNU6-1102P-201ENST00000516149 96 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
R3HDM1Q15032 AC105177.1-201ENST00000523110 555 ntTSL 4 BASIC6.46□□□□□ -1.38
R3HDM1Q15032 AP003049.2-202ENST00000532929 803 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
R3HDM1Q15032 EQTN-204ENST00000537675 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
R3HDM1Q15032 SDHAF2-208ENST00000543265 438 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
R3HDM1Q15032 AP003717.3-201ENST00000544832 1180 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
R3HDM1Q15032 AC021755.1-201ENST00000559747 1447 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
R3HDM1Q15032 AC011477.5-201ENST00000586571 259 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
R3HDM1Q15032 AC008752.1-201ENST00000590046 408 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
R3HDM1Q15032 AL157938.2-208ENST00000590461 877 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
R3HDM1Q15032 AC010503.3-201ENST00000594355 540 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
R3HDM1Q15032 OR7A8P-201ENST00000595427 913 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
R3HDM1Q15032 AC008537.2-201ENST00000596135 482 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
R3HDM1Q15032 AC006115.2-201ENST00000596823 202 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
R3HDM1Q15032 Z99497.2-201ENST00000603634 310 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
R3HDM1Q15032 AL450270.1-201ENST00000606160 391 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
R3HDM1Q15032 OR7A19P-201ENST00000608051 733 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
R3HDM1Q15032 AC005858.4-201ENST00000623191 700 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
R3HDM1Q15032 ZNF347-201ENST00000334197 7960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
R3HDM1Q15032 AC022893.2-201ENST00000564832 3296 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
R3HDM1Q15032 LAMA2-201ENST00000421865 9640 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
R3HDM1Q15032 AC106799.3-201ENST00000562127 3300 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
R3HDM1Q15032 LINC00907-201ENST00000585627 3324 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
R3HDM1Q15032 MSL3P1-202ENST00000440028 1468 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
R3HDM1Q15032 ODAM-201ENST00000396094 1319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
R3HDM1Q15032 LINC02388-201ENST00000550678 1975 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
R3HDM1Q15032 DNM1P47-202ENST00000561463 15043 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
R3HDM1Q15032 DNHD1-201ENST00000254579 14862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
R3HDM1Q15032 RYR2-201ENST00000360064 14850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
R3HDM1Q15032 AC083837.1-201ENST00000565297 2994 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
R3HDM1Q15032 AC099329.2-203ENST00000471537 3605 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
R3HDM1Q15032 OR5B2-202ENST00000641342 2184 ntAPPRIS P1 BASIC6.45□□□□□ -1.38
R3HDM1Q15032 AP000526.1-201ENST00000603308 1388 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
R3HDM1Q15032 AP000756.2-201ENST00000624168 2567 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
R3HDM1Q15032 OR2J3-202ENST00000641151 3297 ntAPPRIS P1 BASIC6.45□□□□□ -1.38
R3HDM1Q15032 C3orf67-209ENST00000482387 2617 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
R3HDM1Q15032 AL592148.3-201ENST00000608771 2646 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
R3HDM1Q15032 RNU1-94P-201ENST00000362627 173 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
R3HDM1Q15032 ZNF602P-201ENST00000405929 924 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
R3HDM1Q15032 AC099566.1-204ENST00000413825 943 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
R3HDM1Q15032 AC104777.3-201ENST00000416350 545 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73 ms