Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 AL592291.1-201ENST00000403830 352 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 AL359643.1-201ENST00000404109 423 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 ZNRF3-IT1-201ENST00000412798 674 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 SEC63P1-201ENST00000425785 1258 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 MAGI2-AS3-204ENST00000426835 738 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 AC092164.1-202ENST00000428036 486 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 AC007556.1-201ENST00000432133 307 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 PRR16-203ENST00000446965 1152 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 AC114814.3-201ENST00000449362 663 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 IMMP2L-205ENST00000450877 761 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 OTX2P1-201ENST00000450956 354 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 AC005304.1-201ENST00000457609 405 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 AC006063.1-201ENST00000512511 560 ntTSL 4 BASIC4.6□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 AC104350.1-201ENST00000518750 877 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 AC008676.3-201ENST00000521237 435 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 AC008641.1-201ENST00000523781 248 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 AC091163.1-201ENST00000524012 605 ntTSL 4 BASIC4.6□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 OR4V1P-201ENST00000525394 1140 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 AP003400.1-201ENST00000528319 231 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 GYPA-211ENST00000535709 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 AC016987.1-201ENST00000558587 499 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 AC109630.1-202ENST00000560552 579 ntTSL 4 BASIC4.6□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 AC105020.2-201ENST00000564683 572 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 HNRNPCP4-201ENST00000571636 900 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 AC005154.1-213ENST00000578572 445 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 AC022884.3-201ENST00000579571 248 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 AP005119.2-201ENST00000579735 1105 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 OR7E18P-201ENST00000592589 702 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 AC011487.3-201ENST00000593607 453 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 L34079.2-201ENST00000597119 561 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 AC233280.2-201ENST00000603917 1070 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 AC007423.1-201ENST00000605009 627 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 AL356056.1-205ENST00000608904 651 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 INTS6-AS1-226ENST00000610018 672 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 AC007497.1-201ENST00000610421 561 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 FAM27B-201ENST00000610601 213 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 C7orf77-201ENST00000616258 548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 MIR8069-1-201ENST00000616627 86 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 AC022106.2-201ENST00000620114 757 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 MIR8069-2-201ENST00000621412 86 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 AC009303.2-205ENST00000627670 1091 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 AC006453.5-201ENST00000636451 619 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 ZNF560-201ENST00000301480 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 OR2H1-203ENST00000377136 3024 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 AL592182.3-201ENST00000642132 3304 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 ALG14-201ENST00000370205 9367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 AC074029.4-201ENST00000624796 1859 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 MNS1-201ENST00000260453 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 SCN1A-220ENST00000641603 12506 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 INTS6P1-201ENST00000504674 2530 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 AC024337.2-201ENST00000616608 2797 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 ZFHX4-207ENST00000521891 14019 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 ARID2-205ENST00000444670 7316 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
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DDX39BQ13838 KLRF1-201ENST00000279545 1091 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 OR8I2-201ENST00000302124 1010 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 OR4F6-201ENST00000328882 1238 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 FAS-205ENST00000357339 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 TECRL-201ENST00000381210 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
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DDX39BQ13838 MGAT4A-203ENST00000409391 2018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 RN7SKP278-201ENST00000410504 342 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 AC079760.2-203ENST00000418395 489 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
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DDX39BQ13838 LINC02188-201ENST00000562064 550 ntTSL 4 BASIC4.59□□□□□ -1.67
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DDX39BQ13838 AC022726.1-201ENST00000587475 207 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 AC018695.3-201ENST00000602617 408 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 AC011453.2-201ENST00000603737 729 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 AL391834.1-201ENST00000609609 560 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 FAM49B-229ENST00000615041 750 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 AC009318.3-201ENST00000616916 503 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 uc_338.9-201ENST00000617424 182 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 AC090510.2-201ENST00000617465 629 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 KLRF1-208ENST00000617889 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 OSER1-AS1-205ENST00000623343 827 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 CCT5-215ENST00000625723 135 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 KIF21A-201ENST00000361418 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 MAPK10-263ENST00000641052 4307 ntBASIC4.59□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 AL590399.5-201ENST00000428709 3325 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 ASB5-201ENST00000296525 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 AC007382.1-201ENST00000624376 2618 ntBASIC4.59□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 MYOZ2-201ENST00000307128 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
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