Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 ARHGAP42P1-201ENST00000507474 1976 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
BNIP1Q12981 AC018797.3-201ENST00000513388 1241 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
BNIP1Q12981 TRIM36-209ENST00000514154 1952 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
BNIP1Q12981 KLHL13-208ENST00000541812 3102 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
BNIP1Q12981 SNHG1-219ENST00000542112 780 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
BNIP1Q12981 AC074029.2-201ENST00000551045 634 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
BNIP1Q12981 AL132800.1-201ENST00000555109 698 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
BNIP1Q12981 IGHV4OR15-8-201ENST00000557788 353 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
BNIP1Q12981 AC025580.2-202ENST00000558536 715 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
BNIP1Q12981 AC012414.2-201ENST00000559474 187 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
BNIP1Q12981 MIR1273E-201ENST00000581165 102 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
BNIP1Q12981 AC131274.1-201ENST00000582507 254 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
BNIP1Q12981 AC091059.1-201ENST00000585190 215 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
BNIP1Q12981 AC006504.5-212ENST00000587188 746 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
BNIP1Q12981 AC018695.3-201ENST00000602617 408 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
BNIP1Q12981 AC069307.1-201ENST00000602820 447 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
BNIP1Q12981 AC005229.3-201ENST00000603438 323 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
BNIP1Q12981 AC105254.2-201ENST00000603636 436 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
BNIP1Q12981 AC134882.1-201ENST00000603738 1676 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
BNIP1Q12981 AC019131.2-201ENST00000609071 870 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
BNIP1Q12981 ADAM29-214ENST00000618444 2949 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.59□□□□□ -1.67
BNIP1Q12981 AC135068.2-201ENST00000622410 353 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
BNIP1Q12981 LINC00216-201ENST00000623548 1126 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
BNIP1Q12981 AL356121.2-201ENST00000624715 780 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
BNIP1Q12981 CASP1-217ENST00000640184 327 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
BNIP1Q12981 POU2F1-206ENST00000429375 13651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
BNIP1Q12981 ERGIC2-212ENST00000611644 4961 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.68
BNIP1Q12981 KCNJ6-201ENST00000609713 19645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
BNIP1Q12981 AC079062.1-203ENST00000581862 3610 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
BNIP1Q12981 KRTAP24-1-201ENST00000340345 1650 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
BNIP1Q12981 OR8H2-203ENST00000641311 3092 ntAPPRIS P2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
BNIP1Q12981 ZZZ3-202ENST00000370801 4328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
BNIP1Q12981 LINC01505-206ENST00000637046 4266 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
BNIP1Q12981 FAM26D-201ENST00000368596 1353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
BNIP1Q12981 SSX5-202ENST00000347757 1261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
BNIP1Q12981 ANK3-202ENST00000355288 3811 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
BNIP1Q12981 AC002069.1-201ENST00000429649 1159 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
BNIP1Q12981 FAM96AP1-201ENST00000430879 482 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
BNIP1Q12981 AL121759.1-201ENST00000434043 795 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
BNIP1Q12981 AL355339.1-201ENST00000434386 435 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
BNIP1Q12981 AC008269.1-201ENST00000438070 646 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
BNIP1Q12981 AC092013.1-201ENST00000438795 332 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
BNIP1Q12981 OR7E125P-201ENST00000443450 846 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
BNIP1Q12981 KNOP1P3-201ENST00000446933 426 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
BNIP1Q12981 LINC00704-203ENST00000449712 703 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
BNIP1Q12981 AL031668.1-201ENST00000451556 603 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
BNIP1Q12981 RPL7P45-201ENST00000455851 743 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
BNIP1Q12981 TPRKBP1-201ENST00000456243 481 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
BNIP1Q12981 AC245041.2-201ENST00000479781 376 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
BNIP1Q12981 RN7SL97P-201ENST00000486780 299 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
BNIP1Q12981 EIF1P7-201ENST00000487533 337 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
BNIP1Q12981 RPS6P4-201ENST00000494693 758 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
BNIP1Q12981 AC025741.1-201ENST00000506100 544 ntTSL 4 BASIC4.58□□□□□ -1.68
BNIP1Q12981 LINC02472-201ENST00000512268 575 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
BNIP1Q12981 RPS3A-210ENST00000512690 845 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
BNIP1Q12981 AC113167.1-201ENST00000512941 570 ntTSL 4 BASIC4.58□□□□□ -1.68
BNIP1Q12981 GYPB-213ENST00000513128 360 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
BNIP1Q12981 IFITM8P-201ENST00000522529 394 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
BNIP1Q12981 AC091163.1-201ENST00000524012 605 ntTSL 4 BASIC4.58□□□□□ -1.68
BNIP1Q12981 NAV2-AS1-201ENST00000526642 660 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
BNIP1Q12981 AP003086.3-201ENST00000527030 365 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
BNIP1Q12981 GYPA-211ENST00000535709 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
BNIP1Q12981 AC004801.3-201ENST00000547602 962 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
BNIP1Q12981 AC126177.5-201ENST00000549599 178 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
BNIP1Q12981 NOP10-202ENST00000557912 436 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
BNIP1Q12981 AC021351.1-202ENST00000561394 701 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
BNIP1Q12981 AC092134.1-201ENST00000563690 800 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
BNIP1Q12981 CYP4A43P-201ENST00000568156 121 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
BNIP1Q12981 TVP23CP2-201ENST00000571473 623 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
BNIP1Q12981 AC023932.1-201ENST00000582726 429 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
BNIP1Q12981 AC008894.1-201ENST00000587693 367 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
BNIP1Q12981 AP001120.2-201ENST00000589395 296 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
BNIP1Q12981 AC108865.2-201ENST00000606881 432 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
BNIP1Q12981 ZNF630-AS1-201ENST00000614448 397 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
BNIP1Q12981 AC090527.3-201ENST00000619041 548 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
BNIP1Q12981 MIR4727-201ENST00000622232 55 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
BNIP1Q12981 AL118508.4-201ENST00000624142 1176 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
BNIP1Q12981 AC007389.5-201ENST00000629214 744 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
BNIP1Q12981 CSRNP3-202ENST00000342316 11684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
BNIP1Q12981 GPR180-201ENST00000376958 8822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
BNIP1Q12981 OSBPL11-201ENST00000296220 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
BNIP1Q12981 FAM169A-203ENST00000510496 5810 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
BNIP1Q12981 MECOM-219ENST00000628990 4835 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
BNIP1Q12981 PLCB4-203ENST00000378493 5796 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
BNIP1Q12981 AL031119.1-201ENST00000404707 1879 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
BNIP1Q12981 FAM72B-201ENST00000355228 1773 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
BNIP1Q12981 AL356489.2-201ENST00000566968 3528 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
BNIP1Q12981 C9orf153-204ENST00000613665 1738 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
BNIP1Q12981 AC046195.1-201ENST00000518973 4171 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
BNIP1Q12981 FBXO8-205ENST00000615392 1591 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
BNIP1Q12981 AC132825.1-201ENST00000463573 2247 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
BNIP1Q12981 HSFY1P1-202ENST00000425038 1381 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
BNIP1Q12981 AC234781.1-202ENST00000412436 1329 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
BNIP1Q12981 PHF11-215ENST00000488958 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
BNIP1Q12981 RN7SKP44-201ENST00000363602 316 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
BNIP1Q12981 CFAP126-201ENST00000367974 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
BNIP1Q12981 GCNT6-201ENST00000379591 934 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
BNIP1Q12981 RNA5SP284-201ENST00000384547 118 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
BNIP1Q12981 MT-TP-201ENST00000387461 68 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
BNIP1Q12981 AL034403.1-201ENST00000399414 885 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.5 ms