Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 AC017007.4-201ENST00000503353 1352 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
IFFO1Q0D2I5 SCAMP1-206ENST00000618166 1358 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
IFFO1Q0D2I5 AC006971.1-201ENST00000407916 4486 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
IFFO1Q0D2I5 POLR2B-201ENST00000314595 3748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
IFFO1Q0D2I5 RANBP2-201ENST00000283195 11711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
IFFO1Q0D2I5 EPC1-203ENST00000375110 3909 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
IFFO1Q0D2I5 ARHGAP42P1-201ENST00000507474 1976 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
IFFO1Q0D2I5 PUS7L-207ENST00000551923 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
IFFO1Q0D2I5 MGAT4A-204ENST00000414521 3709 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
IFFO1Q0D2I5 ITGB3BP-201ENST00000271002 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
IFFO1Q0D2I5 FEZ2-201ENST00000305852 1782 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
IFFO1Q0D2I5 FIG4-202ENST00000368941 791 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
IFFO1Q0D2I5 DEFB115-201ENST00000400552 267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
IFFO1Q0D2I5 RN7SKP267-201ENST00000410381 285 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
IFFO1Q0D2I5 NPM1P4-201ENST00000414095 812 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
IFFO1Q0D2I5 MAP1LC3BP1-201ENST00000417653 379 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
IFFO1Q0D2I5 AC138024.1-201ENST00000420867 699 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
IFFO1Q0D2I5 AC015971.1-204ENST00000424788 1147 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
IFFO1Q0D2I5 AC234779.1-201ENST00000425910 285 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
IFFO1Q0D2I5 AC099060.1-201ENST00000427806 448 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
IFFO1Q0D2I5 AL121760.1-201ENST00000447206 346 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
IFFO1Q0D2I5 AC007000.3-201ENST00000459742 617 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
IFFO1Q0D2I5 AC079804.1-201ENST00000461922 436 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
IFFO1Q0D2I5 RPL23AP71-201ENST00000470966 469 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
IFFO1Q0D2I5 BAALC-AS1-201ENST00000499522 1353 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
IFFO1Q0D2I5 RANBP3L-202ENST00000502994 2278 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
IFFO1Q0D2I5 AC011405.1-202ENST00000504658 803 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
IFFO1Q0D2I5 MTATP6P1-201ENST00000514057 681 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
IFFO1Q0D2I5 AC018682.2-201ENST00000517716 399 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
IFFO1Q0D2I5 AP001267.1-201ENST00000531742 2074 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
IFFO1Q0D2I5 AC068789.1-201ENST00000547942 577 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
IFFO1Q0D2I5 MTND2P17-201ENST00000550281 688 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
IFFO1Q0D2I5 AC025035.1-201ENST00000551571 894 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
IFFO1Q0D2I5 AC027287.1-201ENST00000553115 1453 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
IFFO1Q0D2I5 DTNA-208ENST00000554864 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
IFFO1Q0D2I5 AC004825.1-201ENST00000555068 586 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
IFFO1Q0D2I5 AC018767.2-201ENST00000562361 600 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
IFFO1Q0D2I5 AC009039.1-201ENST00000568711 471 ntTSL 4 BASIC4.59□□□□□ -1.67
IFFO1Q0D2I5 RN7SL652P-201ENST00000577769 300 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
IFFO1Q0D2I5 AC104984.1-201ENST00000581633 697 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
IFFO1Q0D2I5 ZNF573-217ENST00000590414 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
IFFO1Q0D2I5 AC020914.4-201ENST00000597690 277 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
IFFO1Q0D2I5 BNIP3P32-201ENST00000600015 554 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
IFFO1Q0D2I5 AC073254.1-207ENST00000600482 714 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
IFFO1Q0D2I5 AL391422.2-201ENST00000602854 361 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
IFFO1Q0D2I5 AC090181.2-201ENST00000602975 672 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
IFFO1Q0D2I5 AC087468.1-201ENST00000604365 630 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
IFFO1Q0D2I5 AL160290.3-201ENST00000604869 165 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
IFFO1Q0D2I5 AC005392.3-201ENST00000607109 459 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
IFFO1Q0D2I5 Z98200.1-201ENST00000607298 470 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
IFFO1Q0D2I5 AP000569.1-201ENST00000607953 591 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
IFFO1Q0D2I5 C7orf77-201ENST00000616258 548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
IFFO1Q0D2I5 AC244100.4-201ENST00000617747 388 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
IFFO1Q0D2I5 AL627171.1-201ENST00000618845 1308 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
IFFO1Q0D2I5 ESCO1-204ENST00000622333 1850 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
IFFO1Q0D2I5 AC015908.5-201ENST00000623289 343 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
IFFO1Q0D2I5 MAPK10-253ENST00000641010 4072 ntBASIC4.59□□□□□ -1.68
IFFO1Q0D2I5 USP26-203ENST00000511190 3665 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.68
IFFO1Q0D2I5 MAPK10-263ENST00000641052 4307 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
IFFO1Q0D2I5 AC008505.1-201ENST00000637582 2025 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
IFFO1Q0D2I5 AC108467.2-201ENST00000617640 1597 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
IFFO1Q0D2I5 SAMMSON-226ENST00000642089 1582 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
IFFO1Q0D2I5 ZNF682-209ENST00000597972 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
IFFO1Q0D2I5 SMG1P1-206ENST00000431681 2913 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
IFFO1Q0D2I5 AC083899.2-201ENST00000423285 1376 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
IFFO1Q0D2I5 HELLS-204ENST00000371332 2675 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
IFFO1Q0D2I5 NUDT6-202ENST00000339154 1065 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
IFFO1Q0D2I5 RNA5SP307-201ENST00000362863 116 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
IFFO1Q0D2I5 SAMD13-204ENST00000370671 724 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
IFFO1Q0D2I5 IFNA21-201ENST00000380225 1024 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
IFFO1Q0D2I5 MIR143-201ENST00000385300 106 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
IFFO1Q0D2I5 EIF4A1P3-201ENST00000411521 244 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
IFFO1Q0D2I5 AL591468.1-201ENST00000417932 573 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
IFFO1Q0D2I5 OR2B7P-201ENST00000429302 934 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
IFFO1Q0D2I5 AC000111.1-201ENST00000441019 221 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
IFFO1Q0D2I5 GK-IT1-201ENST00000441146 397 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
IFFO1Q0D2I5 TAB3-AS2-201ENST00000445240 292 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
IFFO1Q0D2I5 AL606490.1-201ENST00000452266 765 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
IFFO1Q0D2I5 OR52Y1P-201ENST00000452418 828 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
IFFO1Q0D2I5 RPL10P17-201ENST00000453852 316 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
IFFO1Q0D2I5 AURKAPS2-201ENST00000454983 333 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
IFFO1Q0D2I5 AC104763.1-201ENST00000475274 360 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
IFFO1Q0D2I5 TRBV8-1-201ENST00000481590 279 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
IFFO1Q0D2I5 AC072052.1-201ENST00000496556 306 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
IFFO1Q0D2I5 OSMR-AS1-201ENST00000506463 800 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
IFFO1Q0D2I5 AC025766.1-201ENST00000514061 409 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
IFFO1Q0D2I5 AC112196.1-201ENST00000515092 832 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
IFFO1Q0D2I5 AC093331.2-201ENST00000520459 677 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
IFFO1Q0D2I5 AC044810.3-201ENST00000527565 589 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
IFFO1Q0D2I5 AC046130.2-201ENST00000537655 794 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
IFFO1Q0D2I5 AL360157.1-201ENST00000565962 87 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
IFFO1Q0D2I5 LYRM1-208ENST00000567954 460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
IFFO1Q0D2I5 LINC01630-204ENST00000582689 539 ntTSL 4 BASIC4.58□□□□□ -1.68
IFFO1Q0D2I5 AC105094.1-201ENST00000588245 316 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
IFFO1Q0D2I5 BPIFA4P-203ENST00000603168 689 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
IFFO1Q0D2I5 HMGB1P50-201ENST00000605814 607 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
IFFO1Q0D2I5 AC096586.2-201ENST00000610260 441 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
IFFO1Q0D2I5 ZNF701-207ENST00000611267 1136 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
IFFO1Q0D2I5 TEX41-256ENST00000626411 368 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
IFFO1Q0D2I5 LINC02246-206ENST00000630211 712 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
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