Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 MIR193BHG-214ENST00000641765 509 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 C2orf66-201ENST00000342506 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 CCT8P1-201ENST00000413611 1657 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 AC127070.3-201ENST00000503695 3263 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 DOCK9-203ENST00000376460 7549 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 SELE-203ENST00000367775 3389 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 ZNF615-204ENST00000594083 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 AC008505.1-201ENST00000637582 2025 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 FNDC7-201ENST00000370017 3332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 TCL6-203ENST00000459662 3307 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 MCFD2-202ENST00000409105 4210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 AC110597.1-201ENST00000562669 3176 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 CFAP57-204ENST00000528956 3037 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 MAPK1IP1L-201ENST00000395468 6480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 DSC1-201ENST00000257197 4271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 CSMD2-210ENST00000619121 13430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 ZNF211-205ENST00000391703 2239 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 GAS1RR-201ENST00000415801 4387 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 VTCN1-207ENST00000539893 2719 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
FOXQ1Q9C009 ZFHX4-204ENST00000518282 12175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
FOXQ1Q9C009 CPS1-203ENST00000430249 5698 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
FOXQ1Q9C009 AL133243.4-201ENST00000623116 3109 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
FOXQ1Q9C009 OR2AE1-201ENST00000316368 1071 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
FOXQ1Q9C009 OR2AP1-201ENST00000321688 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
FOXQ1Q9C009 RNU6-839P-201ENST00000363347 108 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.372-201ENST00000365599 102 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
FOXQ1Q9C009 CRP-204ENST00000368112 787 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
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FOXQ1Q9C009 FCF1P10-201ENST00000407590 479 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
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FOXQ1Q9C009 RNA5SP498-201ENST00000411342 120 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
FOXQ1Q9C009 CBX1P3-201ENST00000413296 527 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
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FOXQ1Q9C009 AL591475.1-201ENST00000429060 489 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
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FOXQ1Q9C009 RBPJ-202ENST00000342320 5761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
FOXQ1Q9C009 LINC02086-202ENST00000492522 2091 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
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FOXQ1Q9C009 TSC1-201ENST00000298552 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
FOXQ1Q9C009 AL138828.1-203ENST00000419926 1570 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
FOXQ1Q9C009 C5orf64-203ENST00000505642 2970 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
FOXQ1Q9C009 FTO-206ENST00000471389 11766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
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FOXQ1Q9C009 AC062022.1-201ENST00000451026 1684 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
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FOXQ1Q9C009 AQR-201ENST00000156471 9694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
FOXQ1Q9C009 OFD1P10Y-201ENST00000434110 1433 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
FOXQ1Q9C009 NCOA4P3-201ENST00000513203 1877 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
FOXQ1Q9C009 SLAMF1-202ENST00000302035 4006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
FOXQ1Q9C009 BNIP2-202ENST00000415213 1509 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
FOXQ1Q9C009 RASGRF1-201ENST00000394745 2850 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
FOXQ1Q9C009 RNF213-220ENST00000582970 21055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
FOXQ1Q9C009 KCNJ1-205ENST00000392666 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
FOXQ1Q9C009 MIER3-205ENST00000409421 2152 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
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