Protein–RNA interactions for Protein: Q15929

ZNF56, Putative zinc finger protein 56, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF56Q15929 AC016831.4-201ENST00000438302 307 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ZNF56Q15929 AL353748.1-201ENST00000440753 474 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ZNF56Q15929 LINC02096-201ENST00000445035 953 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
ZNF56Q15929 AL451050.1-201ENST00000450126 415 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ZNF56Q15929 OR52J1P-201ENST00000450596 932 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ZNF56Q15929 AP001596.1-202ENST00000452460 644 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
ZNF56Q15929 DDX39BP2-208ENST00000453923 258 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ZNF56Q15929 AL356309.2-201ENST00000454034 719 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
ZNF56Q15929 UBTFL6-201ENST00000477929 1024 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ZNF56Q15929 AC083829.1-201ENST00000503756 657 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ZNF56Q15929 AC006499.3-201ENST00000506077 748 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ZNF56Q15929 AC138409.2-202ENST00000507274 458 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ZNF56Q15929 BTF3P13-201ENST00000513224 490 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ZNF56Q15929 IGLVIV-53-201ENST00000520107 367 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ZNF56Q15929 IGLV2-28-201ENST00000520681 304 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ZNF56Q15929 AC021242.2-201ENST00000522765 454 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
ZNF56Q15929 PFDN1-207ENST00000524074 395 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
ZNF56Q15929 AC104257.1-202ENST00000524275 884 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
ZNF56Q15929 TEX49-202ENST00000548380 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
ZNF56Q15929 LINC02394-201ENST00000549140 543 ntTSL 4 BASIC3.25□□□□□ -1.89
ZNF56Q15929 AC104938.1-202ENST00000563041 630 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
ZNF56Q15929 MIR7515HG-226ENST00000588330 1055 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
ZNF56Q15929 MTRNR2L12-201ENST00000600213 1049 ntAPPRIS P1 BASIC3.25□□□□□ -1.89
ZNF56Q15929 AC008536.1-201ENST00000602872 669 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ZNF56Q15929 AC011453.2-201ENST00000603737 729 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ZNF56Q15929 Z98200.1-201ENST00000607298 470 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ZNF56Q15929 AC098617.1-203ENST00000609865 277 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
ZNF56Q15929 IQCB2P-201ENST00000401788 1633 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ZNF56Q15929 AC063923.1-201ENST00000478982 1619 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ZNF56Q15929 AL450326.2-201ENST00000421913 1962 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ZNF56Q15929 TRIM36-209ENST00000514154 1952 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
ZNF56Q15929 CCDC121-201ENST00000324364 2342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
ZNF56Q15929 ZNF137P-201ENST00000456718 1920 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ZNF56Q15929 ARL15-202ENST00000504924 2486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
ZNF56Q15929 ARL15-207ENST00000620747 2486 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
ZNF56Q15929 CFAP47-202ENST00000313548 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
ZNF56Q15929 C9orf57-201ENST00000377024 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
ZNF56Q15929 KARSP3-201ENST00000571212 1504 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ZNF56Q15929 ZNF682-209ENST00000597972 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
ZNF56Q15929 C1orf141-208ENST00000621590 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
ZNF56Q15929 BX664718.1-201ENST00000439824 3224 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
ZNF56Q15929 SPATA31D2P-201ENST00000429999 4388 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ZNF56Q15929 PUS7L-207ENST00000551923 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
ZNF56Q15929 RNA5SP305-201ENST00000362665 119 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ZNF56Q15929 RNA5SP507-201ENST00000363603 121 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ZNF56Q15929 RHOT1P2-201ENST00000366423 333 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ZNF56Q15929 OR5L2-201ENST00000378397 936 ntAPPRIS P1 BASIC3.24□□□□□ -1.89
ZNF56Q15929 AC019155.1-201ENST00000382242 574 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ZNF56Q15929 RPS23P10-201ENST00000416185 486 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ZNF56Q15929 NRBF2P3-201ENST00000432731 865 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ZNF56Q15929 TMEM196-204ENST00000433641 768 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
ZNF56Q15929 KRTAP8-2P-201ENST00000440620 186 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ZNF56Q15929 AC026320.1-202ENST00000444729 672 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
ZNF56Q15929 TTTY23B-202ENST00000451467 512 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
ZNF56Q15929 TTTY23-201ENST00000452889 512 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
ZNF56Q15929 BX284632.1-201ENST00000478218 541 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ZNF56Q15929 IGLV2-34-201ENST00000490007 283 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ZNF56Q15929 DUBR-205ENST00000495228 411 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
ZNF56Q15929 AC011405.1-202ENST00000504658 803 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
ZNF56Q15929 IGLV3-26-201ENST00000520756 302 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ZNF56Q15929 SOX5P1-201ENST00000524155 1127 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ZNF56Q15929 LINC02188-201ENST00000562064 550 ntTSL 4 BASIC3.24□□□□□ -1.89
ZNF56Q15929 MIR4489-201ENST00000578869 62 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ZNF56Q15929 ZNF561-AS1-207ENST00000591932 676 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
ZNF56Q15929 AC025946.2-201ENST00000603398 234 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ZNF56Q15929 AP002360.3-201ENST00000607673 710 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ZNF56Q15929 AP000569.1-201ENST00000607953 591 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
ZNF56Q15929 MIR6826-201ENST00000617808 98 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ZNF56Q15929 AC074276.2-201ENST00000619891 348 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ZNF56Q15929 MIR7154-201ENST00000620673 73 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ZNF56Q15929 AC112694.2-201ENST00000623697 768 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ZNF56Q15929 AC007546.2-201ENST00000623996 360 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ZNF56Q15929 LINC01808-202ENST00000641680 1116 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ZNF56Q15929 AC107027.3-201ENST00000565095 3473 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ZNF56Q15929 CRB1-201ENST00000367397 9023 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
ZNF56Q15929 IFI16-208ENST00000448393 2245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
ZNF56Q15929 FSBP-203ENST00000611249 2181 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
ZNF56Q15929 CUL2-201ENST00000374746 3903 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
ZNF56Q15929 GABRG2-210ENST00000638772 7669 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
ZNF56Q15929 ARHGAP42P1-201ENST00000507474 1976 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ZNF56Q15929 MBNL1-224ENST00000545754 5147 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
ZNF56Q15929 CA1-225ENST00000626824 2405 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
ZNF56Q15929 KNTC1-201ENST00000333479 6975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
ZNF56Q15929 RNU1-15P-201ENST00000353977 144 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ZNF56Q15929 RNA5SP123-201ENST00000363244 119 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ZNF56Q15929 SNORD74.4-201ENST00000364129 80 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ZNF56Q15929 LINC00862-201ENST00000367355 1417 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
ZNF56Q15929 CARD16-201ENST00000375704 613 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
ZNF56Q15929 MIR765-201ENST00000390226 114 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ZNF56Q15929 FAIM-204ENST00000393035 946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
ZNF56Q15929 ESCO2-202ENST00000397418 720 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
ZNF56Q15929 ARL4A-205ENST00000404894 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
ZNF56Q15929 ALS2CR12-203ENST00000405148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
ZNF56Q15929 VN1R8P-201ENST00000407739 893 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ZNF56Q15929 SNORA11.5-201ENST00000408163 128 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ZNF56Q15929 SF3B1-202ENST00000409915 600 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
ZNF56Q15929 EIF4A1P3-201ENST00000411521 244 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ZNF56Q15929 OR51B3P-201ENST00000412287 913 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ZNF56Q15929 RPS20P14-201ENST00000412545 360 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ZNF56Q15929 GSTM3P2-201ENST00000412746 530 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.5 ms