Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 AL109610.1-201ENST00000414598 431 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 ATP6V1G1P7-201ENST00000415853 349 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 AC068287.1-201ENST00000430283 295 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 AC004990.1-201ENST00000431722 564 ntTSL 4 BASIC3.49□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 AC017002.1-201ENST00000432268 881 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 ELOCP18-201ENST00000434209 337 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 CLUHP1-201ENST00000435012 1190 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 AC078993.1-203ENST00000435789 1037 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 PPIAP17-201ENST00000438507 471 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 DIAPH2-AS1-201ENST00000439759 971 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 DNAJA1P5-201ENST00000440278 943 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 AL354793.1-201ENST00000446028 713 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 RPL29P29-201ENST00000448725 423 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 MORF4L1P4-201ENST00000450245 976 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 AL034369.1-201ENST00000453808 477 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 AC010894.4-201ENST00000454203 457 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 AL035443.1-201ENST00000456631 304 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 RNU6ATAC28P-201ENST00000459249 118 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 C2orf74-204ENST00000464909 726 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 RPL23AP71-201ENST00000470966 469 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
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VAMP3Q15836 AC018639.1-201ENST00000492994 442 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 AC108022.1-201ENST00000493466 478 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 AC078918.1-201ENST00000498515 228 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 AC093864.1-201ENST00000504555 745 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 AC093770.1-201ENST00000511559 571 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 AC023141.12-201ENST00000512399 199 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 NREP-223ENST00000515855 801 ntTSL 4 BASIC3.49□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 SNORA74.1-201ENST00000516320 180 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 MTND5P21-201ENST00000531961 522 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 DCN-210ENST00000547568 823 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 AC074031.1-201ENST00000550634 734 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 AC089998.2-201ENST00000551856 277 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 AC039056.1-201ENST00000552704 467 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 LINC02259-202ENST00000565543 438 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 AC092376.1-201ENST00000569677 335 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 AC023932.1-201ENST00000582726 429 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 AC007993.3-202ENST00000585329 725 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 AC015911.5-201ENST00000587076 451 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 UBA2-208ENST00000592791 910 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
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VAMP3Q15836 AC108359.1-201ENST00000616451 1211 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 FAM27E2-201ENST00000619668 403 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 AC103564.3-201ENST00000621194 220 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 AC048347.1-201ENST00000624621 427 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 DUXB-201ENST00000633875 1079 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
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VAMP3Q15836 AC025031.4-201ENST00000621248 3271 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
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VAMP3Q15836 LMNTD1-202ENST00000413632 1520 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
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VAMP3Q15836 SLC17A1-204ENST00000476801 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
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VAMP3Q15836 EIF4E-208ENST00000505992 898 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
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VAMP3Q15836 AC112196.1-201ENST00000515092 832 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 AC021678.3-201ENST00000517893 476 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 AC104036.1-201ENST00000523550 611 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 AP001775.2-201ENST00000531710 334 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 PRH1-206ENST00000543626 710 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 AC006511.5-202ENST00000546339 1198 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 FKBP1BP1-201ENST00000553366 325 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 OR11J2P-201ENST00000555298 907 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 AC007493.1-202ENST00000567899 517 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 AC012146.1-201ENST00000571138 462 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 AC015845.1-202ENST00000580184 242 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 AL589765.6-201ENST00000601909 549 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 AP000769.2-201ENST00000602344 396 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 SNHG8-202ENST00000602483 309 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 AC067773.1-201ENST00000603284 1094 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 HMGN2P28-201ENST00000606102 262 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 AC104836.2-201ENST00000609675 1293 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 FAM49B-229ENST00000615041 750 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
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