Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 LINC01192-207ENST00000492553 836 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
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ITGA9Q13797 AC025524.2-211ENST00000519990 1173 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
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ITGA9Q13797 AC087632.1-216ENST00000625619 487 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
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ITGA9Q13797 AC099654.2-201ENST00000433031 1980 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
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ITGA9Q13797 TCEAL7-201ENST00000332431 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
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ITGA9Q13797 CCL20-201ENST00000358813 800 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
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ITGA9Q13797 AC098820.3-201ENST00000414135 976 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
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ITGA9Q13797 AL449043.1-202ENST00000427318 582 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
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ITGA9Q13797 LNCPRESS2-201ENST00000502518 616 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
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ITGA9Q13797 AC021733.1-201ENST00000519786 325 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
ITGA9Q13797 TRAPPC2-208ENST00000519885 561 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
ITGA9Q13797 THUMPD3-AS1-215ENST00000521609 793 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
ITGA9Q13797 OR5AZ1P-201ENST00000527448 943 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
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