Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 CDH13-209ENST00000567109 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 ZNF735-201ENST00000429565 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 FOXP2-202ENST00000360232 1412 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 POT1-202ENST00000393329 3950 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 DCX-211ENST00000637570 6162 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 AC010894.1-201ENST00000313760 361 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 PRSS37-201ENST00000350549 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 SNORD35A-201ENST00000363389 86 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 SNORD8-201ENST00000363915 110 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 RNU6-452P-201ENST00000384406 107 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 RNU6-1009P-201ENST00000390996 107 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 RN7SKP281-201ENST00000410472 352 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 MRPS21P5-201ENST00000417885 231 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 REREP1Y-201ENST00000422655 198 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 VN1R20P-201ENST00000425215 966 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 AC007742.1-201ENST00000425789 329 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 LINC00189-202ENST00000431661 308 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 AL031123.1-201ENST00000432823 568 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 ELOCP26-201ENST00000436067 329 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 FBXW12-203ENST00000436231 1117 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 LINC01350-201ENST00000436955 642 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 AL138767.3-201ENST00000438082 495 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 REREP2Y-201ENST00000439103 200 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 AC020719.1-201ENST00000448977 518 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 ATP5J2-205ENST00000449683 460 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 TMSB4X-204ENST00000451311 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 AL034369.1-201ENST00000453808 477 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 NDUFB3-204ENST00000454214 547 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 LINC00430-201ENST00000457672 597 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 AC013828.1-201ENST00000481845 158 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 AC078785.1-205ENST00000491578 482 ntTSL 4 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 AC093870.1-201ENST00000506837 213 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 IL7R-204ENST00000506850 1004 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 AC108727.2-201ENST00000512277 392 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 NPM1P21-201ENST00000513394 762 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 MTCYBP43-201ENST00000513621 740 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 MINOS1P4-201ENST00000515470 318 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 COMMD10-206ENST00000515539 869 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 LINC01484-201ENST00000517733 555 ntTSL 4 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 FBXO16-207ENST00000518734 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 IGJP1-201ENST00000522682 475 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 AC245519.1-201ENST00000522799 512 ntTSL 4 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 AC068205.1-204ENST00000532989 481 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 PATE4-203ENST00000534411 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 OR9A4-201ENST00000548136 1093 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 AL121852.1-201ENST00000554665 430 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 AL157938.2-201ENST00000587264 894 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 VN1R79P-201ENST00000593540 513 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 RPL7AP69-201ENST00000595306 806 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 AC004805.3-201ENST00000603178 310 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 TAS2R6P-201ENST00000605022 826 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 AL354760.1-201ENST00000608357 643 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 AL121890.2-201ENST00000617644 465 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 AP002505.2-201ENST00000623585 696 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 AC009033.1-201ENST00000624279 431 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 AC124864.2-201ENST00000624736 186 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 AC007603.3-201ENST00000636915 979 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 SLC39A12-201ENST00000377369 2808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 PHTF2-207ENST00000424760 1977 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 SENP7-204ENST00000394085 1483 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 PLEKHS1-205ENST00000369312 3443 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 FILIP1L-202ENST00000354552 3970 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 KAT7-203ENST00000435742 3638 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 FYB2-201ENST00000343433 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 TRPC4-204ENST00000379673 2760 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 GRIA3-207ENST00000620443 4943 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 FAT4-202ENST00000394329 16123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 LINC02019-201ENST00000608605 2060 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 PDE4D-226ENST00000546160 7690 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 CLEC9A-201ENST00000355819 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 SCAMP1-206ENST00000618166 1358 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 ZNF605-204ENST00000392321 6156 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 ABCC9-204ENST00000538350 2672 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 PRKDC-202ENST00000338368 12784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 IFI16-205ENST00000368132 2704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 CASC19-260ENST00000641828 2001 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 SREK1IP1-204ENST00000513458 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 ATP8B5P-203ENST00000430846 3962 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 ZFP62-201ENST00000502412 3415 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 TAS2R16-201ENST00000249284 997 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 OR14A16-201ENST00000357627 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 RNA5SP478-201ENST00000364657 115 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 DEFB125-201ENST00000382410 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 Y_RNA.535-201ENST00000384612 99 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 MIR551B-201ENST00000384984 96 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 IGLV3-10-201ENST00000390315 382 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 SNORA40.3-201ENST00000390964 122 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 AL034417.1-201ENST00000399343 800 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 BTBD9-203ENST00000403056 1155 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 ARL4AP5-201ENST00000404372 599 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 LSM5-205ENST00000409952 687 ntTSL 4 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 RPL17P12-201ENST00000413391 526 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 CYP4F30P-202ENST00000420048 405 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 OFD1P18Y-201ENST00000420889 959 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 AL162726.4-201ENST00000422010 673 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 ELOCP14-201ENST00000428070 331 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 IGLV3-4-201ENST00000432300 244 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 LRRC23-208ENST00000436789 796 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 ELOCP7-201ENST00000439968 331 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 CYCSP51-201ENST00000443545 318 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.2 ms