Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 MIR99AHG-205ENST00000435697 716 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
ACADSBP45954 AC074327.1-202ENST00000443523 369 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
ACADSBP45954 AL355870.1-201ENST00000448272 454 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
ACADSBP45954 IMMP2L-205ENST00000450877 761 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
ACADSBP45954 CYCSP34-201ENST00000458172 304 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ACADSBP45954 AC006967.1-201ENST00000467608 589 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ACADSBP45954 CASP12-210ENST00000494737 961 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
ACADSBP45954 RNU6-319P-201ENST00000516025 108 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ACADSBP45954 RNU2-30P-201ENST00000516209 141 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ACADSBP45954 AC104997.1-201ENST00000519761 717 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ACADSBP45954 AP003400.1-201ENST00000528319 231 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
ACADSBP45954 OR5M11-201ENST00000528616 1020 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
ACADSBP45954 DDHD2-219ENST00000529845 945 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
ACADSBP45954 MS4A7-208ENST00000530234 730 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
ACADSBP45954 AC025035.1-201ENST00000551571 894 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
ACADSBP45954 MIR4443-201ENST00000585052 53 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ACADSBP45954 EAF1-AS1-211ENST00000610011 316 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
ACADSBP45954 LINC00976-202ENST00000628064 534 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
ACADSBP45954 STAP1-201ENST00000265404 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
ACADSBP45954 PATE1-201ENST00000305738 1527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
ACADSBP45954 RNF145-201ENST00000274542 3364 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
ACADSBP45954 STON1-GTF2A1L-201ENST00000394751 3534 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
ACADSBP45954 ING3-201ENST00000315870 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
ACADSBP45954 OR51C1P-202ENST00000641159 1444 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ACADSBP45954 ACKR4-201ENST00000249887 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
ACADSBP45954 MYO9A-209ENST00000564571 8111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
ACADSBP45954 RASA1-203ENST00000506290 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
ACADSBP45954 FAM133A-202ENST00000332647 3159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
ACADSBP45954 ZNF12-203ENST00000404360 4474 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
ACADSBP45954 MRPL50-201ENST00000374865 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
ACADSBP45954 A2MP1-204ENST00000566278 4130 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ACADSBP45954 IRAK1BP1-204ENST00000607739 1387 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
ACADSBP45954 KIF3A-203ENST00000403231 2181 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
ACADSBP45954 AC079062.1-203ENST00000581862 3610 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
ACADSBP45954 EMSY-215ENST00000533248 3798 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
ACADSBP45954 ZNF645-201ENST00000323684 1519 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
ACADSBP45954 ERGIC2-212ENST00000611644 4961 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
ACADSBP45954 POLR2B-203ENST00000431623 3666 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
ACADSBP45954 LINC02085-201ENST00000465215 2051 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
ACADSBP45954 CSTA-201ENST00000264474 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
ACADSBP45954 CACYBP-203ENST00000406752 243 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
ACADSBP45954 OR51B3P-201ENST00000412287 913 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ACADSBP45954 LINC01442-201ENST00000414201 704 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
ACADSBP45954 RPL36AP10-201ENST00000421785 322 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ACADSBP45954 AC106901.1-201ENST00000425086 698 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ACADSBP45954 AL451042.1-201ENST00000426353 544 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
ACADSBP45954 MTND6P18-201ENST00000439477 513 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ACADSBP45954 AC099654.1-201ENST00000442649 407 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
ACADSBP45954 RPL31P20-201ENST00000449593 360 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ACADSBP45954 AC018742.1-202ENST00000457901 504 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
ACADSBP45954 RPL35AP28-201ENST00000459730 331 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ACADSBP45954 PANCR-201ENST00000503456 493 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
ACADSBP45954 AC008728.1-201ENST00000512730 691 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
ACADSBP45954 OR7H2P-201ENST00000513483 306 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ACADSBP45954 HAUS1-203ENST00000585518 506 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
ACADSBP45954 SLC14A2-AS1-204ENST00000592899 359 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
ACADSBP45954 MIR4527HG-203ENST00000600127 704 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
ACADSBP45954 AC005162.3-202ENST00000609495 483 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
ACADSBP45954 Mico1.1-201ENST00000611698 204 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ACADSBP45954 AC243829.4-201ENST00000620056 701 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
ACADSBP45954 ZNF479-203ENST00000620639 1239 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
ACADSBP45954 AC015722.2-201ENST00000622210 551 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ACADSBP45954 EYA1-205ENST00000388742 3907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
ACADSBP45954 CACNB4-273ENST00000638091 4061 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
ACADSBP45954 GCSAML-206ENST00000527084 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
ACADSBP45954 DDR2-202ENST00000367922 10160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
ACADSBP45954 ITGB1-205ENST00000423113 3729 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
ACADSBP45954 PARP8-201ENST00000281631 7177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
ACADSBP45954 AC125257.1-201ENST00000560400 2930 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
ACADSBP45954 PTK2-212ENST00000519419 4439 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
ACADSBP45954 POSTN-210ENST00000541481 3113 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
ACADSBP45954 ZNF445-201ENST00000396077 18299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
ACADSBP45954 GPATCH2L-214ENST00000621494 12396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
ACADSBP45954 C6-201ENST00000263413 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
ACADSBP45954 TRAV26-2-201ENST00000390460 327 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
ACADSBP45954 GNG12-AS1-202ENST00000414904 796 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
ACADSBP45954 AC073136.2-201ENST00000417282 849 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
ACADSBP45954 NPM1P26-201ENST00000426339 738 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
ACADSBP45954 AC062021.1-201ENST00000429008 557 ntTSL 4 BASIC4.93□□□□□ -1.62
ACADSBP45954 LINC02476-202ENST00000431071 559 ntTSL 4 BASIC4.93□□□□□ -1.62
ACADSBP45954 RPS26P4-201ENST00000431743 355 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
ACADSBP45954 AL049745.1-201ENST00000433953 286 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
ACADSBP45954 RPS26P2-201ENST00000440331 348 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
ACADSBP45954 DARS-AS1-206ENST00000446492 488 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
ACADSBP45954 AL137005.1-201ENST00000452944 719 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
ACADSBP45954 FO393401.1-201ENST00000453914 600 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
ACADSBP45954 AC087071.2-201ENST00000483283 575 ntTSL 4 BASIC4.93□□□□□ -1.62
ACADSBP45954 SOX2-OT-216ENST00000497122 578 ntTSL 4 BASIC4.93□□□□□ -1.62
ACADSBP45954 LINC02224-201ENST00000505706 584 ntTSL 4 BASIC4.93□□□□□ -1.62
ACADSBP45954 AL033397.2-201ENST00000508884 547 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
ACADSBP45954 AC138938.1-201ENST00000515431 782 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
ACADSBP45954 RN7SKP46-201ENST00000515942 234 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
ACADSBP45954 SDCBP-207ENST00000520168 1097 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
ACADSBP45954 AC069234.2-201ENST00000541383 575 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
ACADSBP45954 DNAL1-205ENST00000554339 548 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
ACADSBP45954 AC067805.1-201ENST00000559344 470 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
ACADSBP45954 AC013652.1-202ENST00000561058 570 ntTSL 4 BASIC4.93□□□□□ -1.62
ACADSBP45954 LINC02186-201ENST00000575767 885 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
ACADSBP45954 MIR4270-201ENST00000581799 70 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
ACADSBP45954 RPL27-207ENST00000590864 569 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.7 ms