Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 PHACTR2P1-201ENST00000605639 1414 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 LINC01505-205ENST00000636028 2298 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 SULT1E1-201ENST00000226444 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 HERC2-201ENST00000261609 15337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 TMTC3-201ENST00000266712 7203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 OR9K1P-201ENST00000326513 941 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 SPAG11A-202ENST00000326625 445 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 RN7SKP162-201ENST00000363605 345 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 RNU6-621P-201ENST00000364752 109 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
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PTPRAP18433 OR2AT2P-201ENST00000413438 905 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 AC073257.2-201ENST00000413991 528 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 OR5W1P-201ENST00000423705 938 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 PCDH9-AS1-201ENST00000430861 532 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 RPS25P9-201ENST00000435591 252 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 AC092755.1-201ENST00000441746 97 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 USP9YP8-201ENST00000441913 500 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 OR13K1P-201ENST00000444577 975 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 RPL23AP35-201ENST00000451906 501 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
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PTPRAP18433 MTCO3P11-201ENST00000455103 774 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 AC093166.4-201ENST00000457867 318 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
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PTPRAP18433 RPS23P6-201ENST00000466136 431 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
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PTPRAP18433 RPS3AP17-201ENST00000472594 777 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 HMGN1P10-201ENST00000474557 553 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 RPS17P15-201ENST00000475609 349 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 AC131211.1-201ENST00000497285 483 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 AC108941.1-201ENST00000502853 530 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 SUMO2P7-201ENST00000511179 285 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 LINC02432-203ENST00000511213 719 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
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PTPRAP18433 AC090616.5-202ENST00000582111 297 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
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PTPRAP18433 PSMD6-202ENST00000394431 1349 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 SLC30A6-201ENST00000282587 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
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PTPRAP18433 ZC3H7A-214ENST00000575984 2632 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
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PTPRAP18433 DYDC1-203ENST00000421924 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
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PTPRAP18433 MDM2-217ENST00000478070 692 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
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PTPRAP18433 SNORA43.3-201ENST00000517240 103 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 AC062004.1-201ENST00000518706 686 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
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PTPRAP18433 LINC02441-201ENST00000543651 552 ntTSL 4 BASIC6.95□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 AC127502.1-204ENST00000564861 618 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
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PTPRAP18433 MIR4666A-201ENST00000580160 79 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 CT45A1-202ENST00000594565 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 SUMO2P15-201ENST00000604285 278 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 AC090578.1-201ENST00000604955 591 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 AC098614.4-201ENST00000607601 462 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 AC064836.2-201ENST00000609491 462 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
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