Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 AL445437.1-201ENST00000623157 3087 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 HTR1F-201ENST00000319595 3140 ntAPPRIS P1 BASIC4.64□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 SCN1A-220ENST00000641603 12506 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 IPCEF1-210ENST00000519344 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 AL583808.2-201ENST00000418078 1382 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 FAM204A-203ENST00000369183 13889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 FANCI-201ENST00000300027 4713 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 PIGN-245ENST00000640252 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 MAPK10-304ENST00000641341 3984 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 MTRNR2L6-201ENST00000604952 1447 ntAPPRIS P1 BASIC4.63□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 GALNT13-202ENST00000409237 2591 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 ATP13A4-203ENST00000392443 4016 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 BDNF-AS-202ENST00000499568 2039 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 AC015813.6-201ENST00000624409 5808 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 SDAD1P1-202ENST00000524156 2051 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 ZNF12-203ENST00000404360 4474 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 RNF111-212ENST00000561186 4536 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 R3HCC1L-202ENST00000314594 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 OR8H1-201ENST00000313022 1038 ntAPPRIS P2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 RPL32P3-201ENST00000359025 275 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 RNU6-1251P-201ENST00000364502 107 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 TMLHE-202ENST00000369439 1248 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 DEFB119-203ENST00000376321 457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 EI24P4-201ENST00000423683 1078 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 ARPP21-215ENST00000432682 1015 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 RHOT1P3-201ENST00000436571 331 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 GABRG3-AS1-201ENST00000439938 970 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 AL353764.1-201ENST00000442072 474 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 DARS-AS1-206ENST00000446492 488 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 MRPL35P2-201ENST00000448009 511 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 AC017099.1-201ENST00000448261 1028 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 KCNMB2-AS1-205ENST00000451742 844 ntTSL 4 BASIC4.63□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 AC063943.1-201ENST00000465434 453 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 AC095056.1-201ENST00000503918 425 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 AC010245.1-201ENST00000511329 754 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 IGKV2D-10-201ENST00000520194 281 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 NPM1P6-201ENST00000521088 871 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 MTERF3-205ENST00000524341 776 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 AC084083.1-201ENST00000526947 722 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 RGS5-219ENST00000528019 512 ntTSL 4 BASIC4.63□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 AC131532.1-201ENST00000555596 519 ntTSL 4 BASIC4.63□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 AC074050.1-201ENST00000563247 211 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 NQO1-206ENST00000564043 892 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 AC023932.1-201ENST00000582726 429 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 AC068408.2-201ENST00000584566 439 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 AC022387.2-201ENST00000604050 448 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 AL024498.1-201ENST00000606522 1100 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 AL627230.1-201ENST00000613077 211 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 AC116447.1-201ENST00000613153 453 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 AC003001.2-201ENST00000616294 831 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 AL591926.8-201ENST00000616876 211 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 AC145207.9-201ENST00000623802 325 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 WISP3-211ENST00000639360 1026 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 AL139254.3-201ENST00000641097 674 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 KCNRG-202ENST00000360473 1623 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 SALL4P2-201ENST00000423288 2910 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 PRLR-220ENST00000620785 11063 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 PHF11-215ENST00000488958 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 STAG2-205ENST00000371160 6045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 GLCE-201ENST00000261858 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 BNIP3L-202ENST00000518611 1352 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 CLCA3P-201ENST00000284054 2407 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 DLX6-AS1-201ENST00000430027 15364 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 AC126323.6-202ENST00000568092 3511 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 LINC01748-204ENST00000635048 5678 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 ZZZ3-202ENST00000370801 4328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 MAPK10-263ENST00000641052 4307 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 ZBTB44-210ENST00000530205 2179 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 AL672167.1-203ENST00000641299 2975 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 RC3H1-201ENST00000258349 10988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 RAG2-201ENST00000311485 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 HDAC9-204ENST00000406451 9705 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 TIPARP-207ENST00000542783 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 SSMEM1-201ENST00000297819 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 AC079741.1-201ENST00000321498 212 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 DEFB106A-201ENST00000335186 303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 DEFB106B-201ENST00000335479 316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 ELSPBP1-201ENST00000339841 1052 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 RNA5SP428-201ENST00000365129 132 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 TEX35-202ENST00000367639 785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 SPATA42-201ENST00000369989 535 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 SNORD65-201ENST00000391079 73 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 CLEC7A-206ENST00000396484 1000 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 GLULP6-201ENST00000399502 913 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 Z97832.1-201ENST00000402490 328 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 AP002530.1-201ENST00000405705 684 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 METTL5-205ENST00000409837 936 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 RNU6-603P-201ENST00000411403 107 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 P2RY10P2-201ENST00000416730 913 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 AL392003.1-201ENST00000434394 243 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 AL591719.2-201ENST00000437400 386 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 PARGP1-202ENST00000440803 790 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 KNOP1P3-201ENST00000446933 426 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 AL500527.1-201ENST00000448532 255 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 AC068707.1-201ENST00000451438 391 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 AL662889.1-201ENST00000453572 389 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 COX7A2-205ENST00000460985 357 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 AC092957.1-201ENST00000473299 570 ntTSL 4 BASIC4.62□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 MSMO1-203ENST00000504317 1026 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 ATG10-AS1-201ENST00000504846 648 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
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