Protein–RNA interactions for Protein: V9GX04

Tmem196, Transmembrane protein 196, mousemouse

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Length 182 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem196V9GX04 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem196V9GX04 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem196V9GX04 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem196V9GX04 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem196V9GX04 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem196V9GX04 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem196V9GX04 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem196V9GX04 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem196V9GX04 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem196V9GX04 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem196V9GX04 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem196V9GX04 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem196V9GX04 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem196V9GX04 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem196V9GX04 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem196V9GX04 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem196V9GX04 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem196V9GX04 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem196V9GX04 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem196V9GX04 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem196V9GX04 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem196V9GX04 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem196V9GX04 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem196V9GX04 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem196V9GX04 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem196V9GX04 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem196V9GX04 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem196V9GX04 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem196V9GX04 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem196V9GX04 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem196V9GX04 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem196V9GX04 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem196V9GX04 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem196V9GX04 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem196V9GX04 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem196V9GX04 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem196V9GX04 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem196V9GX04 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem196V9GX04 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem196V9GX04 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem196V9GX04 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem196V9GX04 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem196V9GX04 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem196V9GX04 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem196V9GX04 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem196V9GX04 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem196V9GX04 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem196V9GX04 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem196V9GX04 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem196V9GX04 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem196V9GX04 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem196V9GX04 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem196V9GX04 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem196V9GX04 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem196V9GX04 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem196V9GX04 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem196V9GX04 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem196V9GX04 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem196V9GX04 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem196V9GX04 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem196V9GX04 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem196V9GX04 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem196V9GX04 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem196V9GX04 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem196V9GX04 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem196V9GX04 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem196V9GX04 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem196V9GX04 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem196V9GX04 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem196V9GX04 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem196V9GX04 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem196V9GX04 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem196V9GX04 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem196V9GX04 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem196V9GX04 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem196V9GX04 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem196V9GX04 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem196V9GX04 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem196V9GX04 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem196V9GX04 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem196V9GX04 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem196V9GX04 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem196V9GX04 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem196V9GX04 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem196V9GX04 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem196V9GX04 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem196V9GX04 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem196V9GX04 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem196V9GX04 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem196V9GX04 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem196V9GX04 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem196V9GX04 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem196V9GX04 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem196V9GX04 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem196V9GX04 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem196V9GX04 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem196V9GX04 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem196V9GX04 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmem196V9GX04 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmem196V9GX04 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms