Protein–RNA interactions for Protein: Q9R087

Gpc6, Glypican-6, mousemouse

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc6Q9R087 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gpc6Q9R087 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gpc6Q9R087 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gpc6Q9R087 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gpc6Q9R087 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gpc6Q9R087 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gpc6Q9R087 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gpc6Q9R087 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gpc6Q9R087 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gpc6Q9R087 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gpc6Q9R087 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gpc6Q9R087 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gpc6Q9R087 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gpc6Q9R087 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gpc6Q9R087 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gpc6Q9R087 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gpc6Q9R087 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gpc6Q9R087 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gpc6Q9R087 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gpc6Q9R087 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gpc6Q9R087 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gpc6Q9R087 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gpc6Q9R087 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gpc6Q9R087 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gpc6Q9R087 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gpc6Q9R087 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gpc6Q9R087 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gpc6Q9R087 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gpc6Q9R087 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gpc6Q9R087 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gpc6Q9R087 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gpc6Q9R087 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gpc6Q9R087 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gpc6Q9R087 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gpc6Q9R087 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gpc6Q9R087 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gpc6Q9R087 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gpc6Q9R087 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gpc6Q9R087 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gpc6Q9R087 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gpc6Q9R087 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gpc6Q9R087 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gpc6Q9R087 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gpc6Q9R087 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gpc6Q9R087 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gpc6Q9R087 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gpc6Q9R087 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gpc6Q9R087 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gpc6Q9R087 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gpc6Q9R087 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gpc6Q9R087 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gpc6Q9R087 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gpc6Q9R087 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gpc6Q9R087 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gpc6Q9R087 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gpc6Q9R087 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gpc6Q9R087 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gpc6Q9R087 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gpc6Q9R087 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gpc6Q9R087 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gpc6Q9R087 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gpc6Q9R087 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gpc6Q9R087 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gpc6Q9R087 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gpc6Q9R087 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gpc6Q9R087 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gpc6Q9R087 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gpc6Q9R087 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gpc6Q9R087 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gpc6Q9R087 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gpc6Q9R087 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gpc6Q9R087 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gpc6Q9R087 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gpc6Q9R087 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gpc6Q9R087 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gpc6Q9R087 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gpc6Q9R087 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gpc6Q9R087 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gpc6Q9R087 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gpc6Q9R087 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gpc6Q9R087 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gpc6Q9R087 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gpc6Q9R087 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gpc6Q9R087 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gpc6Q9R087 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gpc6Q9R087 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gpc6Q9R087 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gpc6Q9R087 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gpc6Q9R087 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gpc6Q9R087 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gpc6Q9R087 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gpc6Q9R087 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gpc6Q9R087 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gpc6Q9R087 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gpc6Q9R087 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gpc6Q9R087 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gpc6Q9R087 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gpc6Q9R087 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gpc6Q9R087 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gpc6Q9R087 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms