Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF7

Tlr5, Toll-like receptor 5, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr5Q9JLF7 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tlr5Q9JLF7 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Tlr5Q9JLF7 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tlr5Q9JLF7 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Tlr5Q9JLF7 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tlr5Q9JLF7 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tlr5Q9JLF7 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tlr5Q9JLF7 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tlr5Q9JLF7 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Tlr5Q9JLF7 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tlr5Q9JLF7 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tlr5Q9JLF7 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tlr5Q9JLF7 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tlr5Q9JLF7 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tlr5Q9JLF7 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tlr5Q9JLF7 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tlr5Q9JLF7 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tlr5Q9JLF7 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tlr5Q9JLF7 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tlr5Q9JLF7 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Tlr5Q9JLF7 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tlr5Q9JLF7 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tlr5Q9JLF7 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tlr5Q9JLF7 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tlr5Q9JLF7 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tlr5Q9JLF7 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tlr5Q9JLF7 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tlr5Q9JLF7 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Tlr5Q9JLF7 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tlr5Q9JLF7 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tlr5Q9JLF7 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tlr5Q9JLF7 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tlr5Q9JLF7 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tlr5Q9JLF7 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Tlr5Q9JLF7 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tlr5Q9JLF7 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tlr5Q9JLF7 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tlr5Q9JLF7 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tlr5Q9JLF7 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tlr5Q9JLF7 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tlr5Q9JLF7 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tlr5Q9JLF7 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tlr5Q9JLF7 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tlr5Q9JLF7 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tlr5Q9JLF7 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tlr5Q9JLF7 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Tlr5Q9JLF7 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tlr5Q9JLF7 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tlr5Q9JLF7 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tlr5Q9JLF7 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tlr5Q9JLF7 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tlr5Q9JLF7 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tlr5Q9JLF7 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tlr5Q9JLF7 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tlr5Q9JLF7 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tlr5Q9JLF7 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Tlr5Q9JLF7 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tlr5Q9JLF7 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tlr5Q9JLF7 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tlr5Q9JLF7 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tlr5Q9JLF7 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tlr5Q9JLF7 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tlr5Q9JLF7 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tlr5Q9JLF7 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tlr5Q9JLF7 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tlr5Q9JLF7 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tlr5Q9JLF7 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tlr5Q9JLF7 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tlr5Q9JLF7 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Tlr5Q9JLF7 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tlr5Q9JLF7 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tlr5Q9JLF7 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tlr5Q9JLF7 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tlr5Q9JLF7 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tlr5Q9JLF7 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tlr5Q9JLF7 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tlr5Q9JLF7 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tlr5Q9JLF7 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tlr5Q9JLF7 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tlr5Q9JLF7 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tlr5Q9JLF7 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tlr5Q9JLF7 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tlr5Q9JLF7 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tlr5Q9JLF7 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tlr5Q9JLF7 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tlr5Q9JLF7 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tlr5Q9JLF7 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tlr5Q9JLF7 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Tlr5Q9JLF7 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tlr5Q9JLF7 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Tlr5Q9JLF7 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tlr5Q9JLF7 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tlr5Q9JLF7 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tlr5Q9JLF7 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tlr5Q9JLF7 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tlr5Q9JLF7 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tlr5Q9JLF7 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tlr5Q9JLF7 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tlr5Q9JLF7 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tlr5Q9JLF7 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms