Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLC3

Msrb1, Methionine-R-sulfoxide reductase B1, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msrb1Q9JLC3 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Msrb1Q9JLC3 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Msrb1Q9JLC3 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Msrb1Q9JLC3 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Msrb1Q9JLC3 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Msrb1Q9JLC3 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Msrb1Q9JLC3 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Msrb1Q9JLC3 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Msrb1Q9JLC3 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Msrb1Q9JLC3 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Msrb1Q9JLC3 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Msrb1Q9JLC3 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Msrb1Q9JLC3 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Msrb1Q9JLC3 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Msrb1Q9JLC3 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Msrb1Q9JLC3 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Msrb1Q9JLC3 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Msrb1Q9JLC3 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Msrb1Q9JLC3 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Msrb1Q9JLC3 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Msrb1Q9JLC3 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Msrb1Q9JLC3 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Msrb1Q9JLC3 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Msrb1Q9JLC3 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Msrb1Q9JLC3 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Msrb1Q9JLC3 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Msrb1Q9JLC3 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Msrb1Q9JLC3 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Msrb1Q9JLC3 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Msrb1Q9JLC3 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Msrb1Q9JLC3 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Msrb1Q9JLC3 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Msrb1Q9JLC3 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Msrb1Q9JLC3 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Msrb1Q9JLC3 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Msrb1Q9JLC3 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Msrb1Q9JLC3 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Msrb1Q9JLC3 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Msrb1Q9JLC3 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Msrb1Q9JLC3 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Msrb1Q9JLC3 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Msrb1Q9JLC3 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Msrb1Q9JLC3 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Msrb1Q9JLC3 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Msrb1Q9JLC3 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Msrb1Q9JLC3 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Msrb1Q9JLC3 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Msrb1Q9JLC3 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Msrb1Q9JLC3 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Msrb1Q9JLC3 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Msrb1Q9JLC3 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Msrb1Q9JLC3 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Msrb1Q9JLC3 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Msrb1Q9JLC3 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Msrb1Q9JLC3 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Msrb1Q9JLC3 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Msrb1Q9JLC3 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Msrb1Q9JLC3 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Msrb1Q9JLC3 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Msrb1Q9JLC3 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Msrb1Q9JLC3 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Msrb1Q9JLC3 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Msrb1Q9JLC3 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Msrb1Q9JLC3 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Msrb1Q9JLC3 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Msrb1Q9JLC3 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Msrb1Q9JLC3 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Msrb1Q9JLC3 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Msrb1Q9JLC3 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Msrb1Q9JLC3 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Msrb1Q9JLC3 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Msrb1Q9JLC3 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Msrb1Q9JLC3 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Msrb1Q9JLC3 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Msrb1Q9JLC3 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Msrb1Q9JLC3 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Msrb1Q9JLC3 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Msrb1Q9JLC3 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Msrb1Q9JLC3 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Msrb1Q9JLC3 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Msrb1Q9JLC3 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Msrb1Q9JLC3 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Msrb1Q9JLC3 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Msrb1Q9JLC3 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Msrb1Q9JLC3 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Msrb1Q9JLC3 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Msrb1Q9JLC3 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Msrb1Q9JLC3 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Msrb1Q9JLC3 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Msrb1Q9JLC3 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Msrb1Q9JLC3 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Msrb1Q9JLC3 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Msrb1Q9JLC3 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Msrb1Q9JLC3 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Msrb1Q9JLC3 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Msrb1Q9JLC3 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Msrb1Q9JLC3 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Msrb1Q9JLC3 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Msrb1Q9JLC3 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Msrb1Q9JLC3 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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