Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK1

Stx6, Syntaxin-6, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx6Q9JKK1 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Stx6Q9JKK1 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Stx6Q9JKK1 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Stx6Q9JKK1 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Stx6Q9JKK1 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Stx6Q9JKK1 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Stx6Q9JKK1 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Stx6Q9JKK1 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Stx6Q9JKK1 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Stx6Q9JKK1 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Stx6Q9JKK1 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Stx6Q9JKK1 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Stx6Q9JKK1 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Stx6Q9JKK1 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Stx6Q9JKK1 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Stx6Q9JKK1 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Stx6Q9JKK1 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Stx6Q9JKK1 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Stx6Q9JKK1 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Stx6Q9JKK1 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Stx6Q9JKK1 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Stx6Q9JKK1 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Stx6Q9JKK1 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Stx6Q9JKK1 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Stx6Q9JKK1 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Stx6Q9JKK1 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Stx6Q9JKK1 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Stx6Q9JKK1 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Stx6Q9JKK1 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Stx6Q9JKK1 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Stx6Q9JKK1 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Stx6Q9JKK1 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Stx6Q9JKK1 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Stx6Q9JKK1 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Stx6Q9JKK1 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Stx6Q9JKK1 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Stx6Q9JKK1 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Stx6Q9JKK1 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Stx6Q9JKK1 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Stx6Q9JKK1 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Stx6Q9JKK1 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Stx6Q9JKK1 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Stx6Q9JKK1 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Stx6Q9JKK1 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Stx6Q9JKK1 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Stx6Q9JKK1 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Stx6Q9JKK1 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Stx6Q9JKK1 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Stx6Q9JKK1 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Stx6Q9JKK1 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Stx6Q9JKK1 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Stx6Q9JKK1 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Stx6Q9JKK1 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Stx6Q9JKK1 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Stx6Q9JKK1 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Stx6Q9JKK1 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Stx6Q9JKK1 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Stx6Q9JKK1 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Stx6Q9JKK1 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Stx6Q9JKK1 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Stx6Q9JKK1 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Stx6Q9JKK1 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Stx6Q9JKK1 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Stx6Q9JKK1 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Stx6Q9JKK1 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Stx6Q9JKK1 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Stx6Q9JKK1 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Stx6Q9JKK1 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Stx6Q9JKK1 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Stx6Q9JKK1 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Stx6Q9JKK1 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Stx6Q9JKK1 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Stx6Q9JKK1 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Stx6Q9JKK1 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Stx6Q9JKK1 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Stx6Q9JKK1 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Stx6Q9JKK1 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Stx6Q9JKK1 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Stx6Q9JKK1 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Stx6Q9JKK1 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Stx6Q9JKK1 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Stx6Q9JKK1 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Stx6Q9JKK1 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Stx6Q9JKK1 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Stx6Q9JKK1 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Stx6Q9JKK1 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Stx6Q9JKK1 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Stx6Q9JKK1 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Stx6Q9JKK1 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Stx6Q9JKK1 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Stx6Q9JKK1 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Stx6Q9JKK1 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Stx6Q9JKK1 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Stx6Q9JKK1 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Stx6Q9JKK1 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Stx6Q9JKK1 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Stx6Q9JKK1 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Stx6Q9JKK1 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Stx6Q9JKK1 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Stx6Q9JKK1 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms