Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
OtofQ9ESF1 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
OtofQ9ESF1 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
OtofQ9ESF1 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
OtofQ9ESF1 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
OtofQ9ESF1 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
OtofQ9ESF1 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
OtofQ9ESF1 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
OtofQ9ESF1 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
OtofQ9ESF1 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
OtofQ9ESF1 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
OtofQ9ESF1 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
OtofQ9ESF1 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
OtofQ9ESF1 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
OtofQ9ESF1 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
OtofQ9ESF1 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
OtofQ9ESF1 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
OtofQ9ESF1 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
OtofQ9ESF1 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
OtofQ9ESF1 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
OtofQ9ESF1 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
OtofQ9ESF1 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
OtofQ9ESF1 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
OtofQ9ESF1 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
OtofQ9ESF1 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
OtofQ9ESF1 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
OtofQ9ESF1 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
OtofQ9ESF1 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
OtofQ9ESF1 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
OtofQ9ESF1 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
OtofQ9ESF1 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
OtofQ9ESF1 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
OtofQ9ESF1 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
OtofQ9ESF1 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
OtofQ9ESF1 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
OtofQ9ESF1 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
OtofQ9ESF1 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
OtofQ9ESF1 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
OtofQ9ESF1 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
OtofQ9ESF1 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
OtofQ9ESF1 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
OtofQ9ESF1 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
OtofQ9ESF1 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
OtofQ9ESF1 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
OtofQ9ESF1 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
OtofQ9ESF1 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
OtofQ9ESF1 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
OtofQ9ESF1 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
OtofQ9ESF1 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
OtofQ9ESF1 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
OtofQ9ESF1 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
OtofQ9ESF1 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
OtofQ9ESF1 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
OtofQ9ESF1 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
OtofQ9ESF1 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
OtofQ9ESF1 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
OtofQ9ESF1 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
OtofQ9ESF1 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
OtofQ9ESF1 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
OtofQ9ESF1 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
OtofQ9ESF1 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
OtofQ9ESF1 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
OtofQ9ESF1 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
OtofQ9ESF1 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
OtofQ9ESF1 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
OtofQ9ESF1 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
OtofQ9ESF1 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
OtofQ9ESF1 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
OtofQ9ESF1 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
OtofQ9ESF1 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
OtofQ9ESF1 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
OtofQ9ESF1 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
OtofQ9ESF1 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
OtofQ9ESF1 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
OtofQ9ESF1 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
OtofQ9ESF1 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
OtofQ9ESF1 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
OtofQ9ESF1 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
OtofQ9ESF1 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
OtofQ9ESF1 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
OtofQ9ESF1 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
OtofQ9ESF1 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
OtofQ9ESF1 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
OtofQ9ESF1 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
OtofQ9ESF1 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
OtofQ9ESF1 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
OtofQ9ESF1 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
OtofQ9ESF1 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
OtofQ9ESF1 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
OtofQ9ESF1 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
OtofQ9ESF1 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
OtofQ9ESF1 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
OtofQ9ESF1 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
OtofQ9ESF1 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
OtofQ9ESF1 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
OtofQ9ESF1 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
OtofQ9ESF1 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
OtofQ9ESF1 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
OtofQ9ESF1 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
OtofQ9ESF1 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
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