Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAD9

H2al1m, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1mQ9DAD9 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
H2al1mQ9DAD9 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
H2al1mQ9DAD9 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
H2al1mQ9DAD9 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
H2al1mQ9DAD9 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
H2al1mQ9DAD9 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
H2al1mQ9DAD9 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
H2al1mQ9DAD9 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
H2al1mQ9DAD9 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
H2al1mQ9DAD9 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
H2al1mQ9DAD9 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
H2al1mQ9DAD9 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
H2al1mQ9DAD9 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
H2al1mQ9DAD9 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
H2al1mQ9DAD9 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
H2al1mQ9DAD9 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
H2al1mQ9DAD9 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
H2al1mQ9DAD9 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
H2al1mQ9DAD9 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
H2al1mQ9DAD9 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
H2al1mQ9DAD9 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
H2al1mQ9DAD9 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
H2al1mQ9DAD9 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
H2al1mQ9DAD9 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
H2al1mQ9DAD9 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
H2al1mQ9DAD9 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
H2al1mQ9DAD9 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
H2al1mQ9DAD9 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
H2al1mQ9DAD9 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
H2al1mQ9DAD9 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
H2al1mQ9DAD9 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
H2al1mQ9DAD9 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
H2al1mQ9DAD9 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
H2al1mQ9DAD9 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
H2al1mQ9DAD9 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
H2al1mQ9DAD9 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
H2al1mQ9DAD9 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
H2al1mQ9DAD9 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
H2al1mQ9DAD9 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
H2al1mQ9DAD9 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
H2al1mQ9DAD9 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
H2al1mQ9DAD9 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
H2al1mQ9DAD9 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
H2al1mQ9DAD9 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
H2al1mQ9DAD9 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
H2al1mQ9DAD9 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
H2al1mQ9DAD9 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
H2al1mQ9DAD9 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
H2al1mQ9DAD9 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
H2al1mQ9DAD9 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
H2al1mQ9DAD9 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
H2al1mQ9DAD9 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
H2al1mQ9DAD9 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
H2al1mQ9DAD9 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
H2al1mQ9DAD9 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
H2al1mQ9DAD9 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
H2al1mQ9DAD9 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
H2al1mQ9DAD9 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
H2al1mQ9DAD9 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
H2al1mQ9DAD9 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
H2al1mQ9DAD9 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
H2al1mQ9DAD9 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
H2al1mQ9DAD9 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
H2al1mQ9DAD9 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
H2al1mQ9DAD9 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
H2al1mQ9DAD9 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
H2al1mQ9DAD9 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
H2al1mQ9DAD9 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
H2al1mQ9DAD9 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
H2al1mQ9DAD9 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
H2al1mQ9DAD9 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
H2al1mQ9DAD9 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
H2al1mQ9DAD9 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
H2al1mQ9DAD9 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
H2al1mQ9DAD9 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
H2al1mQ9DAD9 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
H2al1mQ9DAD9 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
H2al1mQ9DAD9 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
H2al1mQ9DAD9 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
H2al1mQ9DAD9 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
H2al1mQ9DAD9 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
H2al1mQ9DAD9 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
H2al1mQ9DAD9 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
H2al1mQ9DAD9 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
H2al1mQ9DAD9 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
H2al1mQ9DAD9 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
H2al1mQ9DAD9 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
H2al1mQ9DAD9 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
H2al1mQ9DAD9 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
H2al1mQ9DAD9 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
H2al1mQ9DAD9 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
H2al1mQ9DAD9 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
H2al1mQ9DAD9 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
H2al1mQ9DAD9 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
H2al1mQ9DAD9 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
H2al1mQ9DAD9 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
H2al1mQ9DAD9 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
H2al1mQ9DAD9 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
H2al1mQ9DAD9 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
H2al1mQ9DAD9 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms