Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9J3

Actrt1, Actin-related protein T1, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actrt1Q9D9J3 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Actrt1Q9D9J3 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Actrt1Q9D9J3 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Actrt1Q9D9J3 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Actrt1Q9D9J3 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Actrt1Q9D9J3 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Actrt1Q9D9J3 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Actrt1Q9D9J3 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Actrt1Q9D9J3 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Actrt1Q9D9J3 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Actrt1Q9D9J3 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Actrt1Q9D9J3 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Actrt1Q9D9J3 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Actrt1Q9D9J3 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Actrt1Q9D9J3 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Actrt1Q9D9J3 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Actrt1Q9D9J3 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Actrt1Q9D9J3 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Actrt1Q9D9J3 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Actrt1Q9D9J3 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Actrt1Q9D9J3 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Actrt1Q9D9J3 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Actrt1Q9D9J3 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Actrt1Q9D9J3 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Actrt1Q9D9J3 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Actrt1Q9D9J3 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Actrt1Q9D9J3 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Actrt1Q9D9J3 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Actrt1Q9D9J3 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Actrt1Q9D9J3 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Actrt1Q9D9J3 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Actrt1Q9D9J3 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Actrt1Q9D9J3 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Actrt1Q9D9J3 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Actrt1Q9D9J3 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Actrt1Q9D9J3 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Actrt1Q9D9J3 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Actrt1Q9D9J3 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Actrt1Q9D9J3 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Actrt1Q9D9J3 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Actrt1Q9D9J3 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Actrt1Q9D9J3 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Actrt1Q9D9J3 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Actrt1Q9D9J3 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Actrt1Q9D9J3 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Actrt1Q9D9J3 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Actrt1Q9D9J3 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Actrt1Q9D9J3 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Actrt1Q9D9J3 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Actrt1Q9D9J3 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Actrt1Q9D9J3 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Actrt1Q9D9J3 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Actrt1Q9D9J3 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Actrt1Q9D9J3 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Actrt1Q9D9J3 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Actrt1Q9D9J3 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Actrt1Q9D9J3 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Actrt1Q9D9J3 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Actrt1Q9D9J3 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Actrt1Q9D9J3 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Actrt1Q9D9J3 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Actrt1Q9D9J3 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Actrt1Q9D9J3 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Actrt1Q9D9J3 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Actrt1Q9D9J3 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Actrt1Q9D9J3 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Actrt1Q9D9J3 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Actrt1Q9D9J3 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Actrt1Q9D9J3 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Actrt1Q9D9J3 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Actrt1Q9D9J3 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Actrt1Q9D9J3 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Actrt1Q9D9J3 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Actrt1Q9D9J3 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Actrt1Q9D9J3 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Actrt1Q9D9J3 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Actrt1Q9D9J3 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Actrt1Q9D9J3 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Actrt1Q9D9J3 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Actrt1Q9D9J3 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Actrt1Q9D9J3 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Actrt1Q9D9J3 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Actrt1Q9D9J3 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Actrt1Q9D9J3 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Actrt1Q9D9J3 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Actrt1Q9D9J3 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Actrt1Q9D9J3 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Actrt1Q9D9J3 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Actrt1Q9D9J3 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Actrt1Q9D9J3 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Actrt1Q9D9J3 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Actrt1Q9D9J3 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Actrt1Q9D9J3 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Actrt1Q9D9J3 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Actrt1Q9D9J3 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Actrt1Q9D9J3 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Actrt1Q9D9J3 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Actrt1Q9D9J3 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Actrt1Q9D9J3 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Actrt1Q9D9J3 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms