Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6F4

Gabra4, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra4Q9D6F4 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gabra4Q9D6F4 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gabra4Q9D6F4 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gabra4Q9D6F4 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gabra4Q9D6F4 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gabra4Q9D6F4 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gabra4Q9D6F4 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gabra4Q9D6F4 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gabra4Q9D6F4 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gabra4Q9D6F4 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gabra4Q9D6F4 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gabra4Q9D6F4 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gabra4Q9D6F4 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gabra4Q9D6F4 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gabra4Q9D6F4 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gabra4Q9D6F4 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gabra4Q9D6F4 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gabra4Q9D6F4 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gabra4Q9D6F4 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gabra4Q9D6F4 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gabra4Q9D6F4 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gabra4Q9D6F4 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gabra4Q9D6F4 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gabra4Q9D6F4 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gabra4Q9D6F4 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gabra4Q9D6F4 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gabra4Q9D6F4 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gabra4Q9D6F4 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gabra4Q9D6F4 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gabra4Q9D6F4 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gabra4Q9D6F4 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gabra4Q9D6F4 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gabra4Q9D6F4 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gabra4Q9D6F4 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gabra4Q9D6F4 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gabra4Q9D6F4 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gabra4Q9D6F4 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gabra4Q9D6F4 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gabra4Q9D6F4 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gabra4Q9D6F4 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gabra4Q9D6F4 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gabra4Q9D6F4 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gabra4Q9D6F4 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gabra4Q9D6F4 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gabra4Q9D6F4 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gabra4Q9D6F4 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gabra4Q9D6F4 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gabra4Q9D6F4 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gabra4Q9D6F4 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gabra4Q9D6F4 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gabra4Q9D6F4 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gabra4Q9D6F4 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gabra4Q9D6F4 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gabra4Q9D6F4 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gabra4Q9D6F4 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gabra4Q9D6F4 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gabra4Q9D6F4 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gabra4Q9D6F4 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gabra4Q9D6F4 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gabra4Q9D6F4 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gabra4Q9D6F4 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gabra4Q9D6F4 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gabra4Q9D6F4 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gabra4Q9D6F4 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gabra4Q9D6F4 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gabra4Q9D6F4 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gabra4Q9D6F4 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gabra4Q9D6F4 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gabra4Q9D6F4 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gabra4Q9D6F4 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gabra4Q9D6F4 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gabra4Q9D6F4 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gabra4Q9D6F4 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gabra4Q9D6F4 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gabra4Q9D6F4 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gabra4Q9D6F4 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gabra4Q9D6F4 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gabra4Q9D6F4 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gabra4Q9D6F4 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gabra4Q9D6F4 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gabra4Q9D6F4 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gabra4Q9D6F4 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gabra4Q9D6F4 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gabra4Q9D6F4 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gabra4Q9D6F4 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gabra4Q9D6F4 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gabra4Q9D6F4 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gabra4Q9D6F4 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gabra4Q9D6F4 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gabra4Q9D6F4 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gabra4Q9D6F4 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gabra4Q9D6F4 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gabra4Q9D6F4 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gabra4Q9D6F4 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gabra4Q9D6F4 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gabra4Q9D6F4 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gabra4Q9D6F4 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gabra4Q9D6F4 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gabra4Q9D6F4 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gabra4Q9D6F4 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.9 ms