Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Q1

Ribc2, RIB43A-like with coiled-coils protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ribc2Q9D4Q1 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ribc2Q9D4Q1 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ribc2Q9D4Q1 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ribc2Q9D4Q1 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ribc2Q9D4Q1 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ribc2Q9D4Q1 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ribc2Q9D4Q1 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ribc2Q9D4Q1 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ribc2Q9D4Q1 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ribc2Q9D4Q1 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ribc2Q9D4Q1 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ribc2Q9D4Q1 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ribc2Q9D4Q1 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ribc2Q9D4Q1 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ribc2Q9D4Q1 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ribc2Q9D4Q1 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ribc2Q9D4Q1 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ribc2Q9D4Q1 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ribc2Q9D4Q1 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ribc2Q9D4Q1 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ribc2Q9D4Q1 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ribc2Q9D4Q1 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ribc2Q9D4Q1 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ribc2Q9D4Q1 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ribc2Q9D4Q1 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ribc2Q9D4Q1 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ribc2Q9D4Q1 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ribc2Q9D4Q1 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ribc2Q9D4Q1 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ribc2Q9D4Q1 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ribc2Q9D4Q1 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ribc2Q9D4Q1 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ribc2Q9D4Q1 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ribc2Q9D4Q1 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ribc2Q9D4Q1 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ribc2Q9D4Q1 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ribc2Q9D4Q1 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ribc2Q9D4Q1 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ribc2Q9D4Q1 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ribc2Q9D4Q1 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ribc2Q9D4Q1 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ribc2Q9D4Q1 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ribc2Q9D4Q1 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ribc2Q9D4Q1 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ribc2Q9D4Q1 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ribc2Q9D4Q1 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ribc2Q9D4Q1 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ribc2Q9D4Q1 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ribc2Q9D4Q1 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ribc2Q9D4Q1 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ribc2Q9D4Q1 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ribc2Q9D4Q1 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ribc2Q9D4Q1 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ribc2Q9D4Q1 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ribc2Q9D4Q1 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ribc2Q9D4Q1 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ribc2Q9D4Q1 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ribc2Q9D4Q1 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ribc2Q9D4Q1 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ribc2Q9D4Q1 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ribc2Q9D4Q1 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ribc2Q9D4Q1 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ribc2Q9D4Q1 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ribc2Q9D4Q1 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ribc2Q9D4Q1 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ribc2Q9D4Q1 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ribc2Q9D4Q1 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ribc2Q9D4Q1 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ribc2Q9D4Q1 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ribc2Q9D4Q1 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ribc2Q9D4Q1 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ribc2Q9D4Q1 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ribc2Q9D4Q1 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ribc2Q9D4Q1 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ribc2Q9D4Q1 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ribc2Q9D4Q1 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ribc2Q9D4Q1 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ribc2Q9D4Q1 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ribc2Q9D4Q1 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ribc2Q9D4Q1 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ribc2Q9D4Q1 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ribc2Q9D4Q1 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ribc2Q9D4Q1 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ribc2Q9D4Q1 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ribc2Q9D4Q1 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ribc2Q9D4Q1 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ribc2Q9D4Q1 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ribc2Q9D4Q1 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ribc2Q9D4Q1 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ribc2Q9D4Q1 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ribc2Q9D4Q1 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ribc2Q9D4Q1 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ribc2Q9D4Q1 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ribc2Q9D4Q1 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ribc2Q9D4Q1 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ribc2Q9D4Q1 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ribc2Q9D4Q1 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ribc2Q9D4Q1 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ribc2Q9D4Q1 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ribc2Q9D4Q1 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms