Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2R4

Tmed11, Transmembrane emp24 domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed11Q9D2R4 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmed11Q9D2R4 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmed11Q9D2R4 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmed11Q9D2R4 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmed11Q9D2R4 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmed11Q9D2R4 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmed11Q9D2R4 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Tmed11Q9D2R4 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmed11Q9D2R4 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmed11Q9D2R4 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmed11Q9D2R4 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmed11Q9D2R4 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmed11Q9D2R4 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmed11Q9D2R4 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Tmed11Q9D2R4 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmed11Q9D2R4 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmed11Q9D2R4 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmed11Q9D2R4 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmed11Q9D2R4 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Tmed11Q9D2R4 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Tmed11Q9D2R4 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmed11Q9D2R4 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmed11Q9D2R4 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Tmed11Q9D2R4 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmed11Q9D2R4 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmed11Q9D2R4 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmed11Q9D2R4 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmed11Q9D2R4 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmed11Q9D2R4 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Tmed11Q9D2R4 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Tmed11Q9D2R4 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Tmed11Q9D2R4 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmed11Q9D2R4 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Tmed11Q9D2R4 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmed11Q9D2R4 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Tmed11Q9D2R4 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Tmed11Q9D2R4 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmed11Q9D2R4 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmed11Q9D2R4 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmed11Q9D2R4 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmed11Q9D2R4 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
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Tmed11Q9D2R4 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Tmed11Q9D2R4 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmed11Q9D2R4 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmed11Q9D2R4 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmed11Q9D2R4 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmed11Q9D2R4 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmed11Q9D2R4 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmed11Q9D2R4 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmed11Q9D2R4 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmed11Q9D2R4 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmed11Q9D2R4 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmed11Q9D2R4 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmed11Q9D2R4 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmed11Q9D2R4 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmed11Q9D2R4 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmed11Q9D2R4 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Tmed11Q9D2R4 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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