Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYZ8

Ssbp2, Single-stranded DNA-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp2Q9CYZ8 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssbp2Q9CYZ8 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssbp2Q9CYZ8 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssbp2Q9CYZ8 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssbp2Q9CYZ8 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssbp2Q9CYZ8 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssbp2Q9CYZ8 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssbp2Q9CYZ8 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssbp2Q9CYZ8 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssbp2Q9CYZ8 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssbp2Q9CYZ8 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssbp2Q9CYZ8 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssbp2Q9CYZ8 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssbp2Q9CYZ8 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssbp2Q9CYZ8 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssbp2Q9CYZ8 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssbp2Q9CYZ8 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssbp2Q9CYZ8 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssbp2Q9CYZ8 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssbp2Q9CYZ8 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssbp2Q9CYZ8 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssbp2Q9CYZ8 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssbp2Q9CYZ8 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssbp2Q9CYZ8 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssbp2Q9CYZ8 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssbp2Q9CYZ8 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssbp2Q9CYZ8 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssbp2Q9CYZ8 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssbp2Q9CYZ8 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssbp2Q9CYZ8 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssbp2Q9CYZ8 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssbp2Q9CYZ8 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssbp2Q9CYZ8 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssbp2Q9CYZ8 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssbp2Q9CYZ8 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssbp2Q9CYZ8 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssbp2Q9CYZ8 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssbp2Q9CYZ8 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssbp2Q9CYZ8 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssbp2Q9CYZ8 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Ssbp2Q9CYZ8 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssbp2Q9CYZ8 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssbp2Q9CYZ8 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssbp2Q9CYZ8 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssbp2Q9CYZ8 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssbp2Q9CYZ8 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssbp2Q9CYZ8 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssbp2Q9CYZ8 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssbp2Q9CYZ8 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssbp2Q9CYZ8 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssbp2Q9CYZ8 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssbp2Q9CYZ8 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssbp2Q9CYZ8 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssbp2Q9CYZ8 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssbp2Q9CYZ8 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssbp2Q9CYZ8 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssbp2Q9CYZ8 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssbp2Q9CYZ8 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssbp2Q9CYZ8 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssbp2Q9CYZ8 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssbp2Q9CYZ8 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssbp2Q9CYZ8 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssbp2Q9CYZ8 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssbp2Q9CYZ8 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssbp2Q9CYZ8 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssbp2Q9CYZ8 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssbp2Q9CYZ8 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssbp2Q9CYZ8 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssbp2Q9CYZ8 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssbp2Q9CYZ8 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssbp2Q9CYZ8 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssbp2Q9CYZ8 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssbp2Q9CYZ8 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssbp2Q9CYZ8 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssbp2Q9CYZ8 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssbp2Q9CYZ8 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ssbp2Q9CYZ8 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ssbp2Q9CYZ8 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ssbp2Q9CYZ8 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ssbp2Q9CYZ8 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ssbp2Q9CYZ8 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ssbp2Q9CYZ8 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ssbp2Q9CYZ8 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ssbp2Q9CYZ8 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ssbp2Q9CYZ8 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ssbp2Q9CYZ8 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ssbp2Q9CYZ8 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ssbp2Q9CYZ8 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ssbp2Q9CYZ8 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ssbp2Q9CYZ8 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ssbp2Q9CYZ8 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ssbp2Q9CYZ8 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ssbp2Q9CYZ8 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ssbp2Q9CYZ8 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ssbp2Q9CYZ8 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ssbp2Q9CYZ8 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ssbp2Q9CYZ8 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ssbp2Q9CYZ8 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ssbp2Q9CYZ8 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ssbp2Q9CYZ8 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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