Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY97

Ssu72, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase SSU72, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssu72Q9CY97 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ssu72Q9CY97 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ssu72Q9CY97 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ssu72Q9CY97 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ssu72Q9CY97 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ssu72Q9CY97 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ssu72Q9CY97 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ssu72Q9CY97 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ssu72Q9CY97 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ssu72Q9CY97 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ssu72Q9CY97 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ssu72Q9CY97 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ssu72Q9CY97 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ssu72Q9CY97 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ssu72Q9CY97 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ssu72Q9CY97 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ssu72Q9CY97 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ssu72Q9CY97 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ssu72Q9CY97 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ssu72Q9CY97 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ssu72Q9CY97 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ssu72Q9CY97 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ssu72Q9CY97 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ssu72Q9CY97 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ssu72Q9CY97 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ssu72Q9CY97 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ssu72Q9CY97 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ssu72Q9CY97 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ssu72Q9CY97 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ssu72Q9CY97 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ssu72Q9CY97 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ssu72Q9CY97 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ssu72Q9CY97 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ssu72Q9CY97 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ssu72Q9CY97 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ssu72Q9CY97 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ssu72Q9CY97 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ssu72Q9CY97 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ssu72Q9CY97 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ssu72Q9CY97 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ssu72Q9CY97 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ssu72Q9CY97 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ssu72Q9CY97 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ssu72Q9CY97 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ssu72Q9CY97 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ssu72Q9CY97 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ssu72Q9CY97 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ssu72Q9CY97 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ssu72Q9CY97 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ssu72Q9CY97 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ssu72Q9CY97 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ssu72Q9CY97 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ssu72Q9CY97 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ssu72Q9CY97 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ssu72Q9CY97 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ssu72Q9CY97 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ssu72Q9CY97 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ssu72Q9CY97 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ssu72Q9CY97 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ssu72Q9CY97 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ssu72Q9CY97 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ssu72Q9CY97 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ssu72Q9CY97 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ssu72Q9CY97 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ssu72Q9CY97 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ssu72Q9CY97 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ssu72Q9CY97 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ssu72Q9CY97 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ssu72Q9CY97 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ssu72Q9CY97 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ssu72Q9CY97 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ssu72Q9CY97 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ssu72Q9CY97 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ssu72Q9CY97 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ssu72Q9CY97 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ssu72Q9CY97 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ssu72Q9CY97 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ssu72Q9CY97 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ssu72Q9CY97 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ssu72Q9CY97 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ssu72Q9CY97 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ssu72Q9CY97 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ssu72Q9CY97 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ssu72Q9CY97 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ssu72Q9CY97 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ssu72Q9CY97 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ssu72Q9CY97 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ssu72Q9CY97 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ssu72Q9CY97 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ssu72Q9CY97 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ssu72Q9CY97 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ssu72Q9CY97 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ssu72Q9CY97 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ssu72Q9CY97 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ssu72Q9CY97 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ssu72Q9CY97 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ssu72Q9CY97 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ssu72Q9CY97 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ssu72Q9CY97 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ssu72Q9CY97 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms