Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM1

Type III endosome membrane protein TEMP, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQM1 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9CQM1 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9CQM1 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9CQM1 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9CQM1 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9CQM1 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9CQM1 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9CQM1 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9CQM1 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9CQM1 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9CQM1 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9CQM1 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9CQM1 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9CQM1 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9CQM1 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9CQM1 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9CQM1 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9CQM1 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9CQM1 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9CQM1 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9CQM1 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9CQM1 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9CQM1 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9CQM1 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9CQM1 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9CQM1 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9CQM1 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9CQM1 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9CQM1 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9CQM1 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9CQM1 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9CQM1 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9CQM1 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9CQM1 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9CQM1 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9CQM1 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9CQM1 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9CQM1 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9CQM1 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9CQM1 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9CQM1 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9CQM1 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9CQM1 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9CQM1 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9CQM1 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9CQM1 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9CQM1 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9CQM1 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9CQM1 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9CQM1 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9CQM1 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9CQM1 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9CQM1 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9CQM1 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9CQM1 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9CQM1 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9CQM1 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9CQM1 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9CQM1 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9CQM1 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9CQM1 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9CQM1 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9CQM1 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9CQM1 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9CQM1 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9CQM1 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9CQM1 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9CQM1 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9CQM1 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9CQM1 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9CQM1 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9CQM1 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9CQM1 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9CQM1 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9CQM1 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CQM1 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CQM1 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CQM1 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CQM1 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CQM1 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CQM1 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CQM1 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CQM1 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CQM1 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CQM1 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CQM1 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CQM1 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CQM1 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CQM1 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CQM1 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CQM1 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CQM1 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CQM1 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CQM1 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CQM1 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CQM1 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9CQM1 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9CQM1 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9CQM1 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9CQM1 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms