Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM0

Nicn1, Nicolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nicn1Q9CQM0 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nicn1Q9CQM0 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nicn1Q9CQM0 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nicn1Q9CQM0 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nicn1Q9CQM0 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nicn1Q9CQM0 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nicn1Q9CQM0 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nicn1Q9CQM0 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nicn1Q9CQM0 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nicn1Q9CQM0 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nicn1Q9CQM0 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nicn1Q9CQM0 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nicn1Q9CQM0 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nicn1Q9CQM0 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nicn1Q9CQM0 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nicn1Q9CQM0 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Nicn1Q9CQM0 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nicn1Q9CQM0 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Nicn1Q9CQM0 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nicn1Q9CQM0 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nicn1Q9CQM0 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nicn1Q9CQM0 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nicn1Q9CQM0 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nicn1Q9CQM0 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nicn1Q9CQM0 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nicn1Q9CQM0 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nicn1Q9CQM0 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nicn1Q9CQM0 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nicn1Q9CQM0 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nicn1Q9CQM0 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nicn1Q9CQM0 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nicn1Q9CQM0 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nicn1Q9CQM0 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nicn1Q9CQM0 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Nicn1Q9CQM0 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Nicn1Q9CQM0 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Nicn1Q9CQM0 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Nicn1Q9CQM0 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Nicn1Q9CQM0 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Nicn1Q9CQM0 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Nicn1Q9CQM0 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Nicn1Q9CQM0 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Nicn1Q9CQM0 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Nicn1Q9CQM0 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nicn1Q9CQM0 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nicn1Q9CQM0 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Nicn1Q9CQM0 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nicn1Q9CQM0 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nicn1Q9CQM0 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nicn1Q9CQM0 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nicn1Q9CQM0 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nicn1Q9CQM0 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nicn1Q9CQM0 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Nicn1Q9CQM0 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nicn1Q9CQM0 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nicn1Q9CQM0 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nicn1Q9CQM0 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nicn1Q9CQM0 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nicn1Q9CQM0 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nicn1Q9CQM0 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nicn1Q9CQM0 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nicn1Q9CQM0 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nicn1Q9CQM0 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nicn1Q9CQM0 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nicn1Q9CQM0 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nicn1Q9CQM0 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nicn1Q9CQM0 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nicn1Q9CQM0 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nicn1Q9CQM0 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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Nicn1Q9CQM0 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nicn1Q9CQM0 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Nicn1Q9CQM0 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nicn1Q9CQM0 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nicn1Q9CQM0 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Nicn1Q9CQM0 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nicn1Q9CQM0 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nicn1Q9CQM0 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nicn1Q9CQM0 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nicn1Q9CQM0 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nicn1Q9CQM0 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nicn1Q9CQM0 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nicn1Q9CQM0 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nicn1Q9CQM0 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nicn1Q9CQM0 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nicn1Q9CQM0 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nicn1Q9CQM0 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nicn1Q9CQM0 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nicn1Q9CQM0 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nicn1Q9CQM0 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nicn1Q9CQM0 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Nicn1Q9CQM0 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nicn1Q9CQM0 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nicn1Q9CQM0 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nicn1Q9CQM0 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nicn1Q9CQM0 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nicn1Q9CQM0 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nicn1Q9CQM0 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nicn1Q9CQM0 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nicn1Q9CQM0 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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