Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3J4

Mterf3, Transcription termination factor 3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mterf3Q8R3J4 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mterf3Q8R3J4 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mterf3Q8R3J4 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mterf3Q8R3J4 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mterf3Q8R3J4 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mterf3Q8R3J4 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mterf3Q8R3J4 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mterf3Q8R3J4 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mterf3Q8R3J4 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mterf3Q8R3J4 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mterf3Q8R3J4 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mterf3Q8R3J4 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mterf3Q8R3J4 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mterf3Q8R3J4 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mterf3Q8R3J4 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mterf3Q8R3J4 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mterf3Q8R3J4 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mterf3Q8R3J4 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mterf3Q8R3J4 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mterf3Q8R3J4 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mterf3Q8R3J4 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mterf3Q8R3J4 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mterf3Q8R3J4 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mterf3Q8R3J4 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mterf3Q8R3J4 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mterf3Q8R3J4 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mterf3Q8R3J4 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mterf3Q8R3J4 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mterf3Q8R3J4 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mterf3Q8R3J4 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mterf3Q8R3J4 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mterf3Q8R3J4 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mterf3Q8R3J4 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mterf3Q8R3J4 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mterf3Q8R3J4 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mterf3Q8R3J4 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mterf3Q8R3J4 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Mterf3Q8R3J4 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mterf3Q8R3J4 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mterf3Q8R3J4 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Mterf3Q8R3J4 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Mterf3Q8R3J4 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mterf3Q8R3J4 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mterf3Q8R3J4 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mterf3Q8R3J4 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mterf3Q8R3J4 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mterf3Q8R3J4 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mterf3Q8R3J4 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mterf3Q8R3J4 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mterf3Q8R3J4 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Mterf3Q8R3J4 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mterf3Q8R3J4 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mterf3Q8R3J4 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mterf3Q8R3J4 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mterf3Q8R3J4 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mterf3Q8R3J4 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mterf3Q8R3J4 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mterf3Q8R3J4 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mterf3Q8R3J4 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mterf3Q8R3J4 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mterf3Q8R3J4 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mterf3Q8R3J4 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mterf3Q8R3J4 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mterf3Q8R3J4 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mterf3Q8R3J4 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mterf3Q8R3J4 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mterf3Q8R3J4 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mterf3Q8R3J4 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mterf3Q8R3J4 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mterf3Q8R3J4 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mterf3Q8R3J4 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mterf3Q8R3J4 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mterf3Q8R3J4 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mterf3Q8R3J4 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mterf3Q8R3J4 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mterf3Q8R3J4 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mterf3Q8R3J4 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mterf3Q8R3J4 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mterf3Q8R3J4 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mterf3Q8R3J4 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mterf3Q8R3J4 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mterf3Q8R3J4 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mterf3Q8R3J4 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mterf3Q8R3J4 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mterf3Q8R3J4 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mterf3Q8R3J4 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mterf3Q8R3J4 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mterf3Q8R3J4 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mterf3Q8R3J4 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mterf3Q8R3J4 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mterf3Q8R3J4 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mterf3Q8R3J4 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mterf3Q8R3J4 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mterf3Q8R3J4 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mterf3Q8R3J4 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mterf3Q8R3J4 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mterf3Q8R3J4 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mterf3Q8R3J4 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mterf3Q8R3J4 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mterf3Q8R3J4 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms