Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp27Q8CEG8 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp27Q8CEG8 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp27Q8CEG8 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp27Q8CEG8 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp27Q8CEG8 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp27Q8CEG8 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp27Q8CEG8 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp27Q8CEG8 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp27Q8CEG8 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp27Q8CEG8 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp27Q8CEG8 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Usp27Q8CEG8 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp27Q8CEG8 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp27Q8CEG8 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp27Q8CEG8 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp27Q8CEG8 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp27Q8CEG8 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp27Q8CEG8 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp27Q8CEG8 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp27Q8CEG8 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp27Q8CEG8 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp27Q8CEG8 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp27Q8CEG8 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp27Q8CEG8 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp27Q8CEG8 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp27Q8CEG8 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp27Q8CEG8 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp27Q8CEG8 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp27Q8CEG8 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp27Q8CEG8 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp27Q8CEG8 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp27Q8CEG8 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp27Q8CEG8 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp27Q8CEG8 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp27Q8CEG8 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
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Usp27Q8CEG8 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
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Usp27Q8CEG8 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp27Q8CEG8 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp27Q8CEG8 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp27Q8CEG8 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp27Q8CEG8 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp27Q8CEG8 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp27Q8CEG8 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp27Q8CEG8 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp27Q8CEG8 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp27Q8CEG8 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp27Q8CEG8 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
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Usp27Q8CEG8 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
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Usp27Q8CEG8 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp27Q8CEG8 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp27Q8CEG8 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp27Q8CEG8 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
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Usp27Q8CEG8 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp27Q8CEG8 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
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Usp27Q8CEG8 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp27Q8CEG8 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp27Q8CEG8 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp27Q8CEG8 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp27Q8CEG8 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp27Q8CEG8 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
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Usp27Q8CEG8 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp27Q8CEG8 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp27Q8CEG8 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp27Q8CEG8 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp27Q8CEG8 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp27Q8CEG8 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp27Q8CEG8 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp27Q8CEG8 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp27Q8CEG8 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp27Q8CEG8 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp27Q8CEG8 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp27Q8CEG8 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp27Q8CEG8 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp27Q8CEG8 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp27Q8CEG8 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp27Q8CEG8 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp27Q8CEG8 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp27Q8CEG8 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp27Q8CEG8 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp27Q8CEG8 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp27Q8CEG8 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp27Q8CEG8 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
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