Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5L3

Cnot2, CCR4-NOT transcription complex subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot2Q8C5L3 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnot2Q8C5L3 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnot2Q8C5L3 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnot2Q8C5L3 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnot2Q8C5L3 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnot2Q8C5L3 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnot2Q8C5L3 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnot2Q8C5L3 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnot2Q8C5L3 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnot2Q8C5L3 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnot2Q8C5L3 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnot2Q8C5L3 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnot2Q8C5L3 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnot2Q8C5L3 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnot2Q8C5L3 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnot2Q8C5L3 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnot2Q8C5L3 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnot2Q8C5L3 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnot2Q8C5L3 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot2Q8C5L3 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot2Q8C5L3 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot2Q8C5L3 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot2Q8C5L3 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot2Q8C5L3 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot2Q8C5L3 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot2Q8C5L3 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot2Q8C5L3 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot2Q8C5L3 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot2Q8C5L3 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot2Q8C5L3 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot2Q8C5L3 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot2Q8C5L3 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot2Q8C5L3 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot2Q8C5L3 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot2Q8C5L3 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot2Q8C5L3 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot2Q8C5L3 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot2Q8C5L3 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot2Q8C5L3 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot2Q8C5L3 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot2Q8C5L3 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot2Q8C5L3 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot2Q8C5L3 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot2Q8C5L3 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot2Q8C5L3 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot2Q8C5L3 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot2Q8C5L3 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot2Q8C5L3 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cnot2Q8C5L3 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cnot2Q8C5L3 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnot2Q8C5L3 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnot2Q8C5L3 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnot2Q8C5L3 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnot2Q8C5L3 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnot2Q8C5L3 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Cnot2Q8C5L3 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cnot2Q8C5L3 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Cnot2Q8C5L3 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cnot2Q8C5L3 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnot2Q8C5L3 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnot2Q8C5L3 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnot2Q8C5L3 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnot2Q8C5L3 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cnot2Q8C5L3 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnot2Q8C5L3 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cnot2Q8C5L3 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnot2Q8C5L3 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cnot2Q8C5L3 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cnot2Q8C5L3 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnot2Q8C5L3 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cnot2Q8C5L3 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnot2Q8C5L3 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnot2Q8C5L3 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnot2Q8C5L3 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnot2Q8C5L3 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cnot2Q8C5L3 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnot2Q8C5L3 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnot2Q8C5L3 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnot2Q8C5L3 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnot2Q8C5L3 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnot2Q8C5L3 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnot2Q8C5L3 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cnot2Q8C5L3 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnot2Q8C5L3 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Cnot2Q8C5L3 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cnot2Q8C5L3 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cnot2Q8C5L3 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnot2Q8C5L3 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cnot2Q8C5L3 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnot2Q8C5L3 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnot2Q8C5L3 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnot2Q8C5L3 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnot2Q8C5L3 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnot2Q8C5L3 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnot2Q8C5L3 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnot2Q8C5L3 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnot2Q8C5L3 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cnot2Q8C5L3 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnot2Q8C5L3 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnot2Q8C5L3 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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