Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atg16l1Q8C0J2 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atg16l1Q8C0J2 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atg16l1Q8C0J2 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atg16l1Q8C0J2 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atg16l1Q8C0J2 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg16l1Q8C0J2 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg16l1Q8C0J2 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg16l1Q8C0J2 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg16l1Q8C0J2 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg16l1Q8C0J2 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg16l1Q8C0J2 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg16l1Q8C0J2 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg16l1Q8C0J2 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg16l1Q8C0J2 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg16l1Q8C0J2 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg16l1Q8C0J2 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg16l1Q8C0J2 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg16l1Q8C0J2 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg16l1Q8C0J2 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg16l1Q8C0J2 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg16l1Q8C0J2 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg16l1Q8C0J2 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg16l1Q8C0J2 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg16l1Q8C0J2 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg16l1Q8C0J2 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg16l1Q8C0J2 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg16l1Q8C0J2 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg16l1Q8C0J2 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg16l1Q8C0J2 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg16l1Q8C0J2 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg16l1Q8C0J2 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg16l1Q8C0J2 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg16l1Q8C0J2 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg16l1Q8C0J2 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg16l1Q8C0J2 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg16l1Q8C0J2 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg16l1Q8C0J2 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg16l1Q8C0J2 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg16l1Q8C0J2 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg16l1Q8C0J2 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg16l1Q8C0J2 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg16l1Q8C0J2 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg16l1Q8C0J2 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg16l1Q8C0J2 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg16l1Q8C0J2 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg16l1Q8C0J2 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg16l1Q8C0J2 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg16l1Q8C0J2 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg16l1Q8C0J2 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg16l1Q8C0J2 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg16l1Q8C0J2 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg16l1Q8C0J2 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg16l1Q8C0J2 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg16l1Q8C0J2 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg16l1Q8C0J2 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg16l1Q8C0J2 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg16l1Q8C0J2 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg16l1Q8C0J2 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg16l1Q8C0J2 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg16l1Q8C0J2 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg16l1Q8C0J2 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg16l1Q8C0J2 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg16l1Q8C0J2 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg16l1Q8C0J2 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg16l1Q8C0J2 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg16l1Q8C0J2 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg16l1Q8C0J2 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg16l1Q8C0J2 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg16l1Q8C0J2 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg16l1Q8C0J2 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg16l1Q8C0J2 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg16l1Q8C0J2 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg16l1Q8C0J2 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg16l1Q8C0J2 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg16l1Q8C0J2 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg16l1Q8C0J2 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg16l1Q8C0J2 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atg16l1Q8C0J2 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atg16l1Q8C0J2 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atg16l1Q8C0J2 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atg16l1Q8C0J2 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atg16l1Q8C0J2 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atg16l1Q8C0J2 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atg16l1Q8C0J2 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atg16l1Q8C0J2 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atg16l1Q8C0J2 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Atg16l1Q8C0J2 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atg16l1Q8C0J2 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atg16l1Q8C0J2 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atg16l1Q8C0J2 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atg16l1Q8C0J2 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atg16l1Q8C0J2 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atg16l1Q8C0J2 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atg16l1Q8C0J2 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atg16l1Q8C0J2 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atg16l1Q8C0J2 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Atg16l1Q8C0J2 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atg16l1Q8C0J2 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atg16l1Q8C0J2 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms