Protein–RNA interactions for Protein: Q810U3

Nfasc, Neurofascin, mousemouse

Predictions only

Length 1,240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfascQ810U3 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NfascQ810U3 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NfascQ810U3 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NfascQ810U3 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NfascQ810U3 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NfascQ810U3 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NfascQ810U3 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NfascQ810U3 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NfascQ810U3 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NfascQ810U3 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NfascQ810U3 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NfascQ810U3 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NfascQ810U3 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NfascQ810U3 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NfascQ810U3 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NfascQ810U3 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NfascQ810U3 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NfascQ810U3 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NfascQ810U3 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NfascQ810U3 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NfascQ810U3 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NfascQ810U3 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NfascQ810U3 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NfascQ810U3 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NfascQ810U3 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NfascQ810U3 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NfascQ810U3 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NfascQ810U3 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NfascQ810U3 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NfascQ810U3 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NfascQ810U3 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NfascQ810U3 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NfascQ810U3 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NfascQ810U3 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NfascQ810U3 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NfascQ810U3 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NfascQ810U3 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NfascQ810U3 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NfascQ810U3 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NfascQ810U3 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NfascQ810U3 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NfascQ810U3 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NfascQ810U3 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NfascQ810U3 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NfascQ810U3 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NfascQ810U3 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NfascQ810U3 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NfascQ810U3 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NfascQ810U3 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NfascQ810U3 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NfascQ810U3 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NfascQ810U3 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NfascQ810U3 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NfascQ810U3 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NfascQ810U3 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NfascQ810U3 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NfascQ810U3 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NfascQ810U3 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NfascQ810U3 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NfascQ810U3 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NfascQ810U3 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NfascQ810U3 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NfascQ810U3 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NfascQ810U3 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NfascQ810U3 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NfascQ810U3 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NfascQ810U3 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NfascQ810U3 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NfascQ810U3 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NfascQ810U3 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NfascQ810U3 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NfascQ810U3 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NfascQ810U3 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NfascQ810U3 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NfascQ810U3 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NfascQ810U3 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NfascQ810U3 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NfascQ810U3 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NfascQ810U3 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NfascQ810U3 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
NfascQ810U3 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NfascQ810U3 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NfascQ810U3 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NfascQ810U3 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NfascQ810U3 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NfascQ810U3 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NfascQ810U3 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NfascQ810U3 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NfascQ810U3 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NfascQ810U3 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NfascQ810U3 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NfascQ810U3 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NfascQ810U3 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NfascQ810U3 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NfascQ810U3 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
NfascQ810U3 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NfascQ810U3 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NfascQ810U3 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NfascQ810U3 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NfascQ810U3 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.3 ms