Protein–RNA interactions for Protein: Q76LS9

Mindy1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mindy1Q76LS9 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Mindy1Q76LS9 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mindy1Q76LS9 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mindy1Q76LS9 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mindy1Q76LS9 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mindy1Q76LS9 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mindy1Q76LS9 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mindy1Q76LS9 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mindy1Q76LS9 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mindy1Q76LS9 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mindy1Q76LS9 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mindy1Q76LS9 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mindy1Q76LS9 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mindy1Q76LS9 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mindy1Q76LS9 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mindy1Q76LS9 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mindy1Q76LS9 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mindy1Q76LS9 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mindy1Q76LS9 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mindy1Q76LS9 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mindy1Q76LS9 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mindy1Q76LS9 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Mindy1Q76LS9 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mindy1Q76LS9 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mindy1Q76LS9 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mindy1Q76LS9 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mindy1Q76LS9 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mindy1Q76LS9 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mindy1Q76LS9 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mindy1Q76LS9 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mindy1Q76LS9 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mindy1Q76LS9 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mindy1Q76LS9 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mindy1Q76LS9 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mindy1Q76LS9 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mindy1Q76LS9 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mindy1Q76LS9 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mindy1Q76LS9 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mindy1Q76LS9 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mindy1Q76LS9 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mindy1Q76LS9 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mindy1Q76LS9 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mindy1Q76LS9 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mindy1Q76LS9 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mindy1Q76LS9 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mindy1Q76LS9 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mindy1Q76LS9 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mindy1Q76LS9 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mindy1Q76LS9 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mindy1Q76LS9 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mindy1Q76LS9 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mindy1Q76LS9 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mindy1Q76LS9 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mindy1Q76LS9 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mindy1Q76LS9 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mindy1Q76LS9 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mindy1Q76LS9 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mindy1Q76LS9 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mindy1Q76LS9 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mindy1Q76LS9 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mindy1Q76LS9 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mindy1Q76LS9 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mindy1Q76LS9 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mindy1Q76LS9 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mindy1Q76LS9 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mindy1Q76LS9 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mindy1Q76LS9 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mindy1Q76LS9 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mindy1Q76LS9 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Mindy1Q76LS9 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Mindy1Q76LS9 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Mindy1Q76LS9 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Mindy1Q76LS9 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Mindy1Q76LS9 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Mindy1Q76LS9 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Mindy1Q76LS9 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mindy1Q76LS9 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mindy1Q76LS9 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mindy1Q76LS9 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mindy1Q76LS9 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Mindy1Q76LS9 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Mindy1Q76LS9 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mindy1Q76LS9 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mindy1Q76LS9 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mindy1Q76LS9 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Mindy1Q76LS9 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mindy1Q76LS9 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mindy1Q76LS9 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mindy1Q76LS9 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mindy1Q76LS9 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mindy1Q76LS9 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mindy1Q76LS9 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Mindy1Q76LS9 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mindy1Q76LS9 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mindy1Q76LS9 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mindy1Q76LS9 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mindy1Q76LS9 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mindy1Q76LS9 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mindy1Q76LS9 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mindy1Q76LS9 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms