Protein–RNA interactions for Protein: Q62270

Srms, Tyrosine-protein kinase Srms, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrmsQ62270 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SrmsQ62270 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SrmsQ62270 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SrmsQ62270 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SrmsQ62270 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SrmsQ62270 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SrmsQ62270 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SrmsQ62270 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SrmsQ62270 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SrmsQ62270 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SrmsQ62270 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SrmsQ62270 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SrmsQ62270 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SrmsQ62270 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SrmsQ62270 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SrmsQ62270 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SrmsQ62270 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SrmsQ62270 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SrmsQ62270 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SrmsQ62270 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SrmsQ62270 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SrmsQ62270 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SrmsQ62270 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SrmsQ62270 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
SrmsQ62270 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.07■□□□□ 0
SrmsQ62270 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SrmsQ62270 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SrmsQ62270 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SrmsQ62270 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SrmsQ62270 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SrmsQ62270 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SrmsQ62270 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SrmsQ62270 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SrmsQ62270 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SrmsQ62270 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SrmsQ62270 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SrmsQ62270 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SrmsQ62270 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SrmsQ62270 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SrmsQ62270 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SrmsQ62270 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SrmsQ62270 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SrmsQ62270 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SrmsQ62270 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SrmsQ62270 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SrmsQ62270 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SrmsQ62270 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SrmsQ62270 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SrmsQ62270 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SrmsQ62270 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SrmsQ62270 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SrmsQ62270 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SrmsQ62270 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SrmsQ62270 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SrmsQ62270 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
SrmsQ62270 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SrmsQ62270 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SrmsQ62270 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SrmsQ62270 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SrmsQ62270 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SrmsQ62270 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SrmsQ62270 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SrmsQ62270 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SrmsQ62270 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SrmsQ62270 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SrmsQ62270 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SrmsQ62270 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SrmsQ62270 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SrmsQ62270 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SrmsQ62270 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SrmsQ62270 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SrmsQ62270 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SrmsQ62270 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SrmsQ62270 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SrmsQ62270 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SrmsQ62270 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SrmsQ62270 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SrmsQ62270 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SrmsQ62270 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SrmsQ62270 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SrmsQ62270 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SrmsQ62270 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SrmsQ62270 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SrmsQ62270 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SrmsQ62270 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SrmsQ62270 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SrmsQ62270 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SrmsQ62270 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SrmsQ62270 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SrmsQ62270 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SrmsQ62270 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SrmsQ62270 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SrmsQ62270 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SrmsQ62270 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SrmsQ62270 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SrmsQ62270 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SrmsQ62270 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SrmsQ62270 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SrmsQ62270 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SrmsQ62270 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms